| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | KX077536 | 6245 = | 2353 (0.640) | 1007 (0.290) | 183/186 | 0.0 | 32.0% | coding (669/1020 nt) | unknown | prkA |
| ? | KX077536 | = 6255 | 2099 (0.610) | coding (679/1020 nt) | unknown | prkA | |||||
Only 100 of 4862 total aligned reads displayed.
TCATGCCGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACG > KX077536/6145‑6345 | tCATGCCGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTg > 1:1196619/1‑101 (MQ=255) aTGCCGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGtt < 2:3269006/101‑1 (MQ=255) aTGCCGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGtt < 1:1948230/101‑1 (MQ=255) aTGCCGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGtt < 2:1271456/101‑1 (MQ=255) tGCCGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTc > 2:1134609/1‑101 (MQ=255) ctaatccccaatgacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttc < 1:2428801‑M1/4‑1 (MQ=255) ctaatccccaatgacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttc > 2:1750610‑M1/98‑101 (MQ=255) taatccccaatgacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttcg < 2:735750‑M1/5‑1 (MQ=255) taatccccaatgacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttcg < 2:315648‑M1/5‑1 (MQ=255) taatccccaatgacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttcg > 1:3133748‑M1/97‑101 (MQ=255) gCCGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTcg < 1:2592475/101‑1 (MQ=255) gCCGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTcg > 2:3091246/1‑101 (MQ=255) aatccccaatgacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttcga > 1:772114‑M1/96‑101 (MQ=255) aatccccaatgacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttcga < 1:406898‑M1/6‑1 (MQ=255) cGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTcgac < 2:1339988/101‑1 (MQ=255) cGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTcgac > 1:3072562/1‑101 (MQ=255) gACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTcgacg < 2:1633295/101‑1 (MQ=255) gACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTcgacg > 2:634735/1‑101 (MQ=255) ccccaatgacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttcgacga < 2:881620‑M1/9‑1 (MQ=255) cccAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGaa < 2:2580707/101‑1 (MQ=255) cccAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGaa > 1:1634473/1‑101 (MQ=255) gCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgtt > 2:930206‑M2/1‑98 (MQ=255) atgacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttcgacgaaggtt > 1:3289186‑M1/88‑101 (MQ=255) gacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacggaggttcgacgaaggttcg > 1:1130104‑M1/86‑101 (MQ=255) tCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGAcc < 2:2137000/101‑1 (MQ=255) ccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCa > 1:726701‑M1/82‑101 (MQ=255) ccAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATc > 2:2189077/1‑101 (MQ=255) aTGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGTTGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAg > 2:2473121/1‑101 (MQ=255) aTGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAg < 1:3014133/101‑1 (MQ=255) tGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGt < 1:1000751/101‑1 (MQ=255) gcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGt > 1:2324753‑M1/76‑101 (MQ=255) gcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGt < 1:2121843‑M1/26‑1 (MQ=255) gcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGt < 2:1809146‑M1/26‑1 (MQ=255) acacCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTgg < 2:1576302/101‑1 (MQ=255) aaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTgg > 2:2709926‑M1/74‑101 (MQ=255) tgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCt > 1:1371503‑M1/67‑101 (MQ=255) cgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGc > 2:379998‑M1/65‑101 (MQ=255) gggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCg < 2:1511773‑M1/38‑1 (MQ=255) gggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCg > 1:1438886‑M1/64‑101 (MQ=255) cAACGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttccacgaaggttcgaccatccagtg > 1:2816208‑M2/1‑74 (MQ=255) aGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGt > 1:1686256/1‑101 (MQ=255) gTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCg > 1:2906281/1‑101 (MQ=255) tgctgcGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGt > 1:1257000/1‑101 (MQ=255) tgcGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccct < 2:2410134‑M2/101‑36 (MQ=255) cGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCt < 1:3224777/101‑1 (MQ=255) tgTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGa > 2:3332864/2‑101 (MQ=255) ggTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGa < 2:2761029/101‑1 (MQ=255) gCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcg < 1:2255766‑M2/101‑43 (MQ=255) cAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTg > 1:1736609/1‑101 (MQ=255) ggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTc > 2:429193‑M1/45‑101 (MQ=255) tGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagc > 2:2526452‑M2/1‑54 (MQ=255) gATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagct > 2:2307502‑M2/1‑53 (MQ=255) gATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagct > 1:2054191‑M2/1‑53 (MQ=255) aTCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTa > 2:2365769/1‑101 (MQ=255) tCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTAt < 1:1494647/101‑1 (MQ=255) 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cGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCggg > 2:2071100/1‑101 (MQ=255) cGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCggg > 2:1085511/1‑101 (MQ=255) ggAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCa > 2:2986473/1‑101 (MQ=255) ggAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCa < 2:563061/101‑1 (MQ=255) ggAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCa > 1:2475399/1‑101 (MQ=255) gAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCAt > 1:217930/1‑101 (MQ=255) gAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCAt < 2:2633948/101‑1 (MQ=255) ggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCAtt > 1:1898689‑M1/32‑101 (MQ=255) ggCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGCCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCg > 2:2871549/1‑101 (MQ=255) gCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCCGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGc > 1:837241/1‑101 (MQ=255) cgcgATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCtt < 2:1693089/101‑1 (MQ=255) gcgATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgg < 2:2923756‑M2/101‑66 (MQ=255) cgATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAg < 2:1407296/101‑1 (MQ=255) gATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggc < 1:1849547‑M2/101‑68 (MQ=255) aTGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggca > 1:2380301‑M2/1‑33 (MQ=255) aTGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGcc > 2:198837/1‑101 (MQ=255) tGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCt < 1:1798668/101‑1 (MQ=255) ggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTa < 1:490352‑M1/81‑1 (MQ=255) ggTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTa < 1:2765705/101‑1 (MQ=255) gTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTAc < 2:3045726/101‑1 (MQ=255) ttttGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcg < 2:682252‑M2/101‑73 (MQ=255) tttGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACgg < 2:1455418/101‑1 (MQ=255) ttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACgg > 2:495206‑M1/18‑101 (MQ=255) tacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGc < 1:8928‑M1/85‑1 (MQ=255) gAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgctta < 1:1313494‑M2/101‑77 (MQ=255) tgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTg > 1:2961864‑M1/13‑101 (MQ=255) ccGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGa < 1:955318/101‑1 (MQ=255) tcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGaca > 2:3210287‑M1/10‑101 (MQ=255) ggCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagccta < 2:2251798‑M2/101‑82 (MQ=255) cTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagcctacg > 1:61774‑M2/1‑18 (MQ=255) cTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagcctacg > 1:1571452‑M2/1‑18 (MQ=255) acgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACct > 1:2704170‑M1/7‑101 (MQ=255) tACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACcta < 1:665870/101‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACctac < 1:554906/101‑1 (MQ=255) ccTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACctact > 2:806085/1‑101 (MQ=255) agGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACctacta > 2:1867‑M1/3‑101 (MQ=255) tGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCtactac < 1:337970/101‑1 (MQ=255) gttcgacgaaggttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagcctacggccctga < 2:1928150‑M2/101‑91 (MQ=255) | TCATGCCGACCCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACG > KX077536/6145‑6345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |