| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4514953 = | 63 (2.280) | 4 (0.150) | 4/266 | NT | 6.4% | coding (668/789 nt) | yjhI | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | CP009273 | 4515239 = | 55 (2.050) | coding (382/789 nt) | yjhI | putative DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
TGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGTGAATAGTAGCCGTTTTTGTTTTTAATTAAGAAACCACAATCCACCA > CP009273/4514999‑4515478 | tGAATACCGGAATACTTAAACATACCGCACCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTACAGGCTAATAATGCTTTACCAAACGCGGTAATATGCAACTAAAATGTTTTGCAAATCCAGCTTTAGCTCGTCGGTACAAATTCCTTACTTTca > 2:403982/1‑274 (MQ=255) cGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGTAATTATGCAACTCAAGTTTTTTTCAAATCAAGCTTTTGCTCGTCGTAACAGATCCCGGAcactctatatt > 2:110548/1‑263 (MQ=255) ccGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTNTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCACCTTTTGCTCGTTGGTACAGAGTCCGTACTTTCGCTCTTTTCAAgataaatacc > 1:486161/1‑269 (MQ=255) ccccATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGTCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTACATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCCACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTcc < 1:536796/239‑1 (MQ=255) ccccATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCACATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACACTTTTTTATCGGTAAATGTCTTTCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTTCCAAACCAGCTTTTTCTCGGCGGTACAGAGTCCGTACTTTATAACTTGTCGATATAGCTATCCAAAAt > 2:285407/1‑274 (MQ=255) cATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCttt > 2:118112/1‑216 (MQ=255) ggTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCt < 1:118112/216‑1 (MQ=255) tttGCTTCTTCGTTGTCTAGGGACCTTCCCCGTAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTTCATAAACAATTTTTTTTCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTTGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCGTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCTACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTTGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCAt < 2:486154/274‑1 (MQ=255) gTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGTGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGNATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGACGACATCGATAGCCGAAATGCTCTCCAt < 1:404144/275‑1 (MQ=255) tGATTCTTCGTTATCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAAATAGATAGCCGAAATGATCCCCAtag > 1:328590/1‑273 (MQ=255) gATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTTTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑c < 1:285410/275‑1 (MQ=255) tgttgttTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTTCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGa < 1:110548/274‑1 (MQ=255) aTCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATATCCGAAATGCTCCAAATCG‑CCCCAAGATGACAAAcaaaccc > 2:142551/1‑268 (MQ=255) aTCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTGTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCTGTACAGAGTCCGGACTTTCGATATTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGTTCTCCATCG‑CCCCAAACTGACAAACCAGTCCa > 1:63626/1‑275 (MQ=255) cgcaatacatttaccgataaaaaattgtttctggaagaattacaaaaaacacgccttcggggatgggccatagacaacgaagaatcaacctatggggcggtatgtttaagtatgccggtattcaatatgtataacagagttaactatgcaatctcactttctggcgatccAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGAAAAACAAGTACACCTTTCAGc > 2:236215‑M2/171‑274 (MQ=255) gtgtTTTTTTTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGAc < 1:142552/275‑1 (MQ=255) atacatttaccgataaaaaattgtttctggaagaattacaaaaaacacgccttcggggatgggccatagacaacgaagaatcaacctatggggcggtatgtttaagtatgccggtattcaatatgtataacagagttaactatgcaatctcactttctggcgatccAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCAc < 1:236217‑M2/96‑1 (MQ=255) atttttttttCGGTACATGTAGTTCGCGTATATGGATTTCACGTGAGTGCTTCTAAATAATCATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGATAATAATGCCTTACCCATCGCGTTAATATGCAACTCAAGTTGTTTGCCAAGCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGTCTTTAGATATTGTCGAGACAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCATCTTTTAAGCCGCAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCAc < 2:63626/273‑1 (MQ=255) aTGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGAt > 1:206938/1‑150 (MQ=255) ggAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTg < 2:206936/150‑1 (MQ=255) aaCGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAg > 1:267232/1‑206 (MQ=255) aGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCtcgtc > 2:37610/1‑111 (MQ=255) cTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTa < 1:37610/111‑1 (MQ=255) atCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCCAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGAAAACACAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGTg > 1:135007/1‑275 (MQ=255) tggggcggtatgttgaagtatgcaggtattcaatatgtataacagagttaactatgcaatctcactttctggcgatccAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGagat > 1:380915‑M2/79‑126 (MQ=255) tcggtatgtttaagtatgccggtattcaatatgtataacagagttaactatgcaatctcactttctggctatccAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGagatagat < 2:380909‑M2/52‑1 (MQ=255) ctcGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCtcgt > 2:367/1‑82 (MQ=255) ctcGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAgatagata > 2:296073/1‑122 (MQ=255) tgtCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGt < 1:367/82‑1 (MQ=255) tgtCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCg < 1:296077/122‑1 (MQ=255) ttCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGt > 1:61862/1‑103 (MQ=255) aGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCgag < 2:61862/103‑1 (MQ=255) taatGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAg > 1:480569/1‑153 (MQ=255) gCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGAc < 2:480562/153‑1 (MQ=255) ccTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGTGAATAGTAGCCGTTTTTGTTTTTAATTAAGAAACca > 1:189741/1‑275 (MQ=255) aCCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCt > 1:301991/1‑45 (MQ=255) aCCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTTTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCATTGAATAGTAGCCGTTTTTGTTTTTAATTAAAAAACCACAAt > 1:180014/1‑275 (MQ=255) aCCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATACGTAGTTTTTTATTCCCAGTGAATAATAGCCGTTTTTGTTTTTAATTAAGAAACAACAAt > 1:34319/1‑275 (MQ=255) ctataCGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTAAAGAGTCCTGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGTGAATAGTAGCCGTTTTTGTTTTTAATTAAGAAACCACAATc < 2:180013/271‑1 (MQ=255) aaCGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTg < 2:301987/45‑1 (MQ=255) cgcgGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCt > 1:287088/1‑39 (MQ=255) cgcgGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCTTAGTTTTTTATTCCCCTTGAATATAAGCCGTTTTTTTTGTTTTTTTCTAAACCACAATccacca > 2:298750/1‑275 (MQ=255) cgcgGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTATtttttt > 2:117062/1‑220 (MQ=255) cgaggTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCa > 2:101089/4‑172 (MQ=255) gTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTg < 2:287085/39‑1 (MQ=255) gTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAata < 1:101089/172‑1 (MQ=255) gTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTc < 1:117062/220‑1 (MQ=255) tAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACagag > 2:226444/1‑53 (MQ=255) tAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGAt > 1:104143/1‑67 (MQ=255) atGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCg < 1:226446/53‑1 (MQ=255) atGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTg < 2:104143/67‑1 (MQ=255) aaCTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAg > 1:558491/1‑126 (MQ=255) cTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGctc > 2:119686/1‑85 (MQ=255) cTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCAtt > 1:262616/1‑139 (MQ=255) cTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCt > 1:18498/1‑146 (MQ=255) cTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGAc > 2:110836/1‑170 (MQ=255) cAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGAc < 2:558483/126‑1 (MQ=255) aGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCa < 1:119686/85‑1 (MQ=255) aGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGcc < 2:262614/139‑1 (MQ=255) aGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGt < 2:18498/146‑1 (MQ=255) aGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGgtg < 1:110836/170‑1 (MQ=255) | TGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCG‑CCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACTCCTGCATTGGCCGCTTAGTCACCTCAAATATATTTTGACGGTGTAACGCCTGACAACCCAATTCGTAGTTTTTTATTCCCAGTGAATAGTAGCCGTTTTTGTTTTTAATTAAGAAACCACAATCCACCA > CP009273/4514999‑4515478 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |