| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2209186 | 40 (1.040) | 16 (0.440) | 6/300 | NT | 33.3% | coding (51/108 nt) | yohO | putative membrane protein |
| ? | CP009273 | = 2209301 | 26 (0.710) | coding (655/732 nt) | yehW | inner membrane putative ABC superfamily transporter permease | |||||
GCGCATTGATGTCCTCGCCCACTCGCTCAATCAACTACGCCCTGAACTATTCGAAGGCCGTACATTGCTGGTGTGGTGCGGTGAAAATCGAACCTCCGCCCAACAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCG > CP009273/2208914‑2209456 | gcgcATTGATGTCCTCGCCCACTCGCTCAATCAACTACGCCCTGAACTATTCGAAGGCCGTACATTGCTGGTGTGGTGCGGTGAAAATCGAACCTCCGCCCAACAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTCCCCACTCGGCANTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCACTGTTCCTGTTTATGGCGTTAgg > 1:654703/1‑275 (MQ=255) tgatgaCCTCGCACACTCGCTCAATAAAGCACGCCCTCAACGAGTCGAAGGCCGGACATTGCTGGTGTGGTGAGGTGAAAATCGAACCTACGCACAACAGCAGCAACTCACCAGGTGGAAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGAATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGaa < 2:700878/274‑1 (MQ=255) gCCCACTCGCACAATCAACTACGCCCTGAACTATTCGAAGGCCGTACATTGCTGGTGTGGTGCGGTGAAAATCGAACCTCCGCCCAACAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATACGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTATGCGGAATTGGTGGCGt > 1:700887/1‑274 (MQ=255) caaaaaaCTACGCCCCCAACTAGTCGACTCACGTACATTGCTGGTGTGGTGGGGTGAAAATCTACCCTCCAGCCAACAGCAGCAACTCACCAGGTGGCAAGAACAAGGCCATCATATTTTCCCACTAGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑GAAAG‑TTGGGGTCATCGCCGTGTTCCTGTTTATGGCGTGAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCACAgg < 2:681845/270‑1 (MQ=255) tcaaCTACGCCCTGAACTATTCGAAGGCCGTACATTGCTGGTGTGGTGCGGTGAAAATCGAACCTCCGCCCAACAGCAGTAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGATCGCAGGTta < 1:704741/275‑1 (MQ=255) cTACGCCCTGAACGATTCGCAGGCCGTACATTGCTGGTGTGGTGCGGTGAAAATCGAACCTCAGCCCAACAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAATGCATTATGAGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCACTGTTCCTGTTAATGGCGTTAGGCGGAATTGGGGGCGTCTTGCTGTCAGGttgttcc > 2:619248/1‑270 (MQ=255) aGGCCGTACATTGCTGGTGTGGTGCGGTGAAAATCGAACCTCCGCCCAACAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAg > 2:224746/1‑247 (MQ=255) cGTACATTGCTGGTGTGGTGCGGTGAAAATCGAACCTCCGCCCAACAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTta < 1:224751/247‑1 (MQ=255) gtgCGGTGAAAATCGAACCTCCGCCCAACAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTTCTGGTTATAGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGGCATGCTCGCAGGTTATACCTTTAtttta > 1:45911/1‑242 (MQ=255) atttggCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGtaacg > 1:354190‑M2/3‑270 (MQ=255) ggCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGATGGCTAATCGCCGTCACCAGCCTGTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGGGCCACCAGTAACGCCCCCTGGAtatgc > 1:2820/1‑270 (MQ=255) tGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTNCTGGCTAANCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCACCCTGGATCACATAcgc > 1:478891/1‑274 (MQ=255) cgcTTTGCTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAg < 1:341165/274‑1 (MQ=255) ggtgtgcgcctgcTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGAGGGGCGTACCAAGCGTGcc > 1:712650/13‑274 (MQ=255) aaTCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaa > 2:120970‑M1/1‑80 (MQ=255) aaTCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCCGCCTTTCAACCCGGCGGTCTGCGATGCTCGCCGCCAGTGCCCCCAGt < 1:27601‑M2/196‑2 (MQ=255) aaTCCTTTAGTTAACAGAAGGGGTGAATTGTGGGCATAGC‑TATAA‑TTGGGGTCATGGCCCTGTTCCTGTTGATGGCGTTAGGCGGAATGGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTa < 2:654694/275‑1 (MQ=255) aaTCCTCTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTActggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaa > 2:419981‑M1/1‑80 (MQ=255) tCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATtggtgg > 1:143018/1‑92 (MQ=255) gtgtcgtTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTActggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgca < 2:179988‑M1/126‑54 (MQ=255) cTTTCGTTAACGTAAGGAGTGCATTAGGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTTATCGCCCTGTTCCTGTTTAGGGCGTTAGGGGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATGTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGGGACACCAGtaacg > 2:27601‑M2/1‑191 (MQ=255) cTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaata < 1:120971‑M1/151‑76 (MQ=255) cTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTActggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaata < 1:419988‑M1/153‑78 (MQ=255) cTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTAt > 1:441243/1‑220 (MQ=255) ttCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTc < 2:143017/92‑1 (MQ=255) cGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTaaa < 2:441236/220‑1 (MQ=255) aCATAAGGAGTGCTTTATGCGCATAGT‑TAAAA‑TTGGGTTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGGGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGTAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTNAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATAGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAt < 1:619257/275‑1 (MQ=255) cATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCt > 1:282688/1‑192 (MQ=255) aGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGAt < 2:282683/192‑1 (MQ=255) tGCATTATGCGCATAGC‑TAAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCG‑TCTGCGATGATCGCCGCAAGTGCCACCAGtaacg < 1:322426‑M2/177‑6 (MQ=255) tGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGc > 1:44074/1‑72 (MQ=255) cATTATTCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTACGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCTCATGGATAACATACGCTGTATTAAATCCGCTAAGCCCTATAATGATGGGCTTACCCACCATGCTGGCCCCTCCCGTTACGCCGATCGTAGCCGtcc > 1:403782/1‑272 (MQ=255) cATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATg > 2:272805/1‑76 (MQ=255) cATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATcgccgc > 1:619319/1‑158 (MQ=255) ttATGCGCATAGCGAAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTTTTTATGTCGTTATGCGGAATTGGTTGCTTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGTC‑GTCTGCGATTATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGcccc < 2:322420/177‑1 (MQ=255) ttATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCa < 2:44074/72‑1 (MQ=255) aTGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCg < 1:272810/76‑1 (MQ=255) aTGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGt < 2:619310/158‑1 (MQ=255) gcgcATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTg > 2:622497/1‑94 (MQ=255) gcATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaa > 2:107252‑M1/1‑47 (MQ=255) aTAGC‑TATAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTActggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcct > 2:109486‑M1/1‑45 (MQ=255) aTAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcgtcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaa > 2:255120‑M1/1‑45 (MQ=255) aTAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcgtcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaa > 1:113051‑M1/1‑45 (MQ=255) aTAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaa > 1:293392‑M1/1‑45 (MQ=255) aTAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTg < 1:622506/94‑1 (MQ=255) aGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaata < 1:107253‑M1/127‑85 (MQ=255) aGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCTCATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTAccc < 1:672768/222‑1 (MQ=255) c‑TATAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTActggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgttt < 1:109487‑M1/80‑40 (MQ=255) c‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcgtcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaata < 1:255125‑M1/115‑75 (MQ=255) c‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcgtcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaata < 2:113050‑M1/115‑75 (MQ=255) c‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaata < 1:24663‑M1/125‑85 (MQ=255) c‑TAAAA‑TTGGGGTCAGCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAggcggaattggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaata < 2:293386‑M1/125‑85 (MQ=255) ttAAAA‑TTGGGGTCATCGCTCTGTTTCTGTTTATGGCGTGAGGTGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTCATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAt < 1:380752/248‑1 (MQ=255) ggTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTTGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGGTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAGCAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCCCATACGCGGAATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTCCTGGCCCCTACCATTGAGGCGCTCGTCGCGGTACCAACGTTGATAATCaaccaatgtcg > 2:233091/1‑265 (MQ=255) aTCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAg > 2:39684/1‑55 (MQ=255) aTCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCaa > 1:317843/1‑105 (MQ=255) cccTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTta < 1:39684/55‑1 (MQ=255) cccTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAg < 2:317837/105‑1 (MQ=255) tgtgTATGGCGTTGGTCGCAATTGGTGGCGTCCTGCTCGCAGGTTTTACTTTTATTTTGCTTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTGCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCa < 2:712640/275‑1 (MQ=255) tGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCaa > 1:649943/1‑35 (MQ=255) tGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCATTCACGCCCCCTGGATcaca > 2:676374/1‑142 (MQ=255) tGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGt < 1:226629‑M2/124‑2 (MQ=255) cGTTActggtgtccctggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaacataaaggtataacctgcgagcatgacgccaccaattccccctaacgccctaaacaggaacagggcgataaccccaattttagctatgcgcctaatgcactccttacgttaacgaaag > 2:27601‑M1/1‑5 (MQ=255) cGTTActggtggcacttgcggcgatcatcgcagacgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaataaaggtataacctgcgagcatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaatttttagctatgcgcataatgca < 1:322426‑M1/177‑173 (MQ=255) cGTTActggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaataaaggtataacctgcgagcatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgcgcataatgcactccttatgttaacgaaaggattgtacagtaaagcgcatttgttaacgaatcattaaatgccgagtgggaaaatatcatggccttgttcttgccaaat > 1:354190‑M1/1‑5 (MQ=255) cGTTActggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaataaaggtataacctgcgagcatgacgccaccaattccgcctaac > 2:226624‑M1/1‑5 (MQ=255) gTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGtaacg > 2:226624‑M2/1‑119 (MQ=255) gTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGAGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATAcg < 1:676383/142‑1 (MQ=255) tAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTa > 2:513827/1‑58 (MQ=255) actggtggcactggcggcgatcatcgcagaccgcctgtttgaaaggctggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaataaaggtataacctgcgagcatgacgccaccaattccgcctaacgcca < 1:226629‑M1/124‑124 (MQ=255) actgggggcactggcggcgagcatcgcagaccgccgggttgaaaggcgggtgcaggcgcttagccagcacgcaaaataaaggtataacctgcgagcatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgcgcataatgcactccttatgttaacgaaaggatt < 1:27601‑M1/196‑196 (MQ=255) | GCGCATTGATGTCCTCGCCCACTCGCTCAATCAACTACGCCCTGAACTATTCGAAGGCCGTACATTGCTGGTGTGGTGCGGTGAAAATCGAACCTCCGCCCAACAGCAGCAACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCG > CP009273/2208914‑2209456 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |