New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2209186 | 40 (1.040) | 16 (0.440) | 6/300 | NT | 33.3% | coding (51/108 nt) | yohO | putative membrane protein |
? | CP009273 | = 2209301 | 26 (0.710) | coding (655/732 nt) | yehW | inner membrane putative ABC superfamily transporter permease |
AGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGACCTTACGCACTCGCTGACCACGACTCATTCCCATAC > CP009273/2209032‑2209507 | atttggCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑Gtaacg > 1:354190‑M2/3‑270 (MQ=255) ggCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGATGGCTAATCGCCGTCACCAGCCTGTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGGGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGAtatgc > 1:2820/1‑270 (MQ=255) tGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTNCTGGCTAANCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCACCCTGGATCACATAcgc > 1:478891/1‑274 (MQ=255) cgcTTTGCTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAg < 1:341165/274‑1 (MQ=255) ggtgtgcgcctgcTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGAGGGGCGTACCAAGCGTGcc > 1:712650/13‑274 (MQ=255) aaTCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCCGCCTTTCAACCCGGCGGTCTGCGATGCTCGCCGCCAGTGCCCCCA‑‑‑‑‑Gt < 1:27601‑M2/196‑2 (MQ=255) aaTCCTTTAGTTAACAGAAGGGGTGAATTGTGGGCATAGC‑TATAA‑TTGGGGTCATGGCCCTGTTCCTGTTGATGGCGTTAGGCGGAATGGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTa < 2:654694/275‑1 (MQ=255) cTTTCGTTAACGTAAGGAGTGCATTAGGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTTATCGCCCTGTTCCTGTTTAGGGCGTTAGGGGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATGTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGGGACACCA‑‑‑‑‑Gtaacg > 2:27601‑M2/1‑191 (MQ=255) cTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTAt > 1:441243/1‑220 (MQ=255) cGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTaaa < 2:441236/220‑1 (MQ=255) aCATAAGGAGTGCTTTATGCGCATAGT‑TAAAA‑TTGGGTTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGGGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGTAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTNAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATAGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAt < 1:619257/275‑1 (MQ=255) cATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCt > 1:282688/1‑192 (MQ=255) aGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGAt < 2:282683/192‑1 (MQ=255) tGCATTATGCGCATAGC‑TAAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCG‑TCTGCGATGATCGCCGCAAGTGCCACCA‑‑‑‑‑Gtaacg < 1:322426‑M2/177‑6 (MQ=255) cATTATTCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTACGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCTCATGGATAACATACGCTGTATTAAATCCGCTAAGCCCTATAATGATGGGCTTACCCACCATGCTGGCCCCTCCCGTTACGCCGATCGTAGCCGtcc > 1:403782/1‑272 (MQ=255) ttATGCGCATAGCGAAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTTTTTATGTCGTTATGCGGAATTGGTTGCTTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGTC‑GTCTGCGATTATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGcccc < 2:322420/177‑1 (MQ=255) aGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCTCATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTAccc < 1:672768/222‑1 (MQ=255) ttAAAA‑TTGGGGTCATCGCTCTGTTTCTGTTTATGGCGTGAGGTGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTCATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAt < 1:380752/248‑1 (MQ=255) ggTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTTGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGGTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAGCAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCCCATACGCGGAATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTCCTGGCCCCTACCATTGAGGCGCTCGTCGCGGTACCAACGTTGATAATCaaccaatgtcg > 2:233091/1‑265 (MQ=255) tgtgTATGGCGTTGGTCGCAATTGGTGGCGTCCTGCTCGCAGGTTTTACTTTTATTTTGCTTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTGCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCa < 2:712640/275‑1 (MQ=255) tGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑TTCACGCCCCCTGGATcaca > 2:676374/1‑142 (MQ=255) tGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑Gt < 1:226629‑M2/124‑2 (MQ=255) gTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑Gtaacg > 2:226624‑M2/1‑119 (MQ=255) gTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGAGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATAcg < 1:676383/142‑1 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAATTCCGcctaacgccataaacaggaacagggcgctgaccccaattttag < 2:293386‑M2/125‑44 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAATTCCGcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagct < 1:107253‑M2/127‑46 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAATTCCGcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttag < 1:24663‑M2/125‑44 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑Gtaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgcgcataatgcactccttatgttaacgaaag < 1:419988‑M2/153‑77 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGCGCTGGCCCCTACCGTTGAAGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGACGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAACGGTAACACAACCTTCCCCACACGCTAACAACGACTcc > 2:715371/1‑273 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCACCAATTCCGCC‑‑‑‑‑‑aacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgcgcataatgcactccttatgttaacgaaag < 1:120971‑M2/151‑76 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGA‑CGCCACCAATTCCGCC‑‑‑‑‑‑aacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttag < 2:113050‑M2/115‑41 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGA‑CGCCACCAATTCCGCC‑‑‑‑‑‑aacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttag < 1:255125‑M2/115‑41 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAATTCCGcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgc > 2:107252‑M2/1‑78 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAATTCCGcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctat > 1:293392‑M2/1‑78 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑Gtaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgcgcataatgcactccttatgttaacgagaggatt > 2:419981‑M2/1‑73 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCACCAATTCCGCC‑‑‑‑‑‑aacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgcgcataatgcactccttatgttaacgaaaggatt > 2:120970‑M2/1‑72 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGA‑CGCCACCAATTCCGCC‑‑‑‑‑‑aacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctat > 1:113051‑M2/1‑71 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGA‑CGCCACCAATTCCGCC‑‑‑‑‑‑aacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctat > 2:255120‑M2/1‑71 (MQ=255) cGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACAt > 1:194237/1‑90 (MQ=255) cGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGa > 2:684243/1‑162 (MQ=255) cGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCT‑GATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTCCCAATGTTGATAATCACCGACGTTCGCACGCCCGCCCGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGACCTTACGCACTCGCTCACCACGACTCCTTCCCCTAc > 1:382442/1‑275 (MQ=255) cTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATAcgc < 2:194234/90‑1 (MQ=255) cTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATTATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGAtcgt < 1:684252/162‑1 (MQ=255) tGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑Gtaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgcgcataatgcactccttatgttaacgacac < 2:179988‑M2/129‑77 (MQ=255) tCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAg > 2:483736/1‑83 (MQ=255) aaaCAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑Gtaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattatag < 1:109487‑M2/80‑42 (MQ=255) aCAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCg < 1:483743/83‑1 (MQ=255) aGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑Gtaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattatagctat > 2:109486‑M2/1‑35 (MQ=255) tCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATc > 1:300142/1‑64 (MQ=255) cGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCt < 2:300136/64‑1 (MQ=255) | AGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGC‑TAAAA‑TTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCA‑‑‑‑‑GTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGACCTTACGCACTCGCTGACCACGACTCATTCCCATAC > CP009273/2209032‑2209507 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |