| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4300605 | 68 (1.770) | 9 (0.240) | 8/302 | NT | 11.2% | coding (193/1533 nt) | alsA | fused D‑allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP‑binding components |
| ? | CP009273 | = 4300798 | 78 (2.110) | intergenic (‑1/+126) | alsA/alsB | fused D‑allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP‑binding components/D‑allose transporter subunit | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GATAGATAAATTCGCCACTTTCTCATCTAGATCAACTTTCAAGCCCACGCGTAATAACATCATGGCGGCGCGGACACGCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGG > CP009273/4300354‑4300877 | gataagtcanttcgccaaTTTCGCGTCGAGATCAACTTTCAAGCACACGCGTAATAACATCATGGCGGCACGGACACTGATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGGCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGT < 2:63748‑M1/265‑1 (MQ=255) tcATCTAGATCAACTTTCAAGCCCACGCGTAATAACATCATGGCGGCGCGGACACGCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGANTTTTTTCGTCAGATGACGAGCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTtatggccacgccatatatatcgatggcggggatcggcaagtcctt < 1:565292‑M1/275‑46 (MQ=255) cAAGCCCACGCGTAATAACATCATGGCGGCGCGGACACGCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTATGCCGCTAATTTNTGATCCAGNTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGAGTGGAtt > 1:480683/1‑275 (MQ=255) cACGCGTAATAACATCATGGCGGCGCGGACACGCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTAcc < 1:168739/273‑1 (MQ=255) atcatGGCGGCGCGGACACCCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTCGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCAtttt > 1:586652/1‑271 (MQ=255) tggtgggggagACACGCATTTATCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTcc < 2:586643/261‑1 (MQ=255) gcggcgCGGACACGCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGAGACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGc < 1:12714/243‑1 (MQ=255) cggcgCGGACACGCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAAt > 2:213585/1‑275 (MQ=255) cgcgGACACGCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCAt > 1:605687/1‑235 (MQ=255) gCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCa < 1:213589/275‑1 (MQ=255) aTTTTTTGCCAGTCGATAATATTGTCGTCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTGCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCAc < 1:457436/274‑1 (MQ=255) tCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCACGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGAGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCGCATAGTAATTCATGTATTTCNCACGGATAAAcctt > 2:535724/1‑273 (MQ=255) tatTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACt > 1:100185/1‑200 (MQ=255) ttGACGCCACAGTTTTTTTTCGTCAGATGACTACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAAc < 1:273559/275‑1 (MQ=255) tGACGCCACAGTTTTTTTTCGTCAGATTACGACCTATATTTAAATTTTCCAGTACGTTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTANGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAAcc < 1:606693/275‑1 (MQ=255) gACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCa < 2:100184/200‑1 (MQ=255) gCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaa < 1:543251/149‑1 (MQ=255) gCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTGGCGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATT < 1:509685‑M1/147‑1 (MQ=255) cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATT < 1:141907‑M1/145‑1 (MQ=255) atatatAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATTAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTAAACCGGACCAACGGACTTAcc > 1:226959/1‑275 (MQ=255) aaTTTTCAAGGTCTGTTAATTGATCTATTACGCTTAGTTCCTTATTAATAATTCCTATTCCGAGTTGTTACGCTAATTTATGATTCAGCATGTTATAGCTAATTTTATTAATGATAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACATTCATTAGCGTTGATTTACCCGCTCCATTTTCTCCTAGTGATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCAGACCAAAGGACTTGCCGATcccc < 2:145931/275‑1 (MQ=255) aaTGTTCCAGTACGGTTAATTCAGCAATAACGCTGAGTTCCTTATTAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGATAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCTTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGGGGAGTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTAGTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATcc < 2:226954/273‑1 (MQ=255) ttCCAGTACGGTTAATTCATCACTAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTaa > 1:277739/1‑192 (MQ=255) ttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTTGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTa > 2:398664/1‑191 (MQ=255) ttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAGAACTTGAATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCAt > 1:643796/1‑197 (MQ=255) ttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTANAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCa < 1:531655/275‑1 (MQ=255) ttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAAACCTGTGTTCCTTATAAATAATCCAGCTACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATTCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTACGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGAGTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCa < 2:642253/275‑1 (MQ=255) tCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTACTTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGTTAATGTTGCCTTTGGTCGGCTCCTGTATACCGGATATAACTTTCATTAGCGTGCATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAACTTAACCGACTTTAATGCGTACACCGGGCCAAAGGACTTGACTGTcccctcact > 2:146909/1‑270 (MQ=255) tCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaat < 1:388842/107‑1 (MQ=255) tCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTGATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTACTAGTAATGAATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGCACCAAAGGACTTGCCGAt > 1:145932/1‑266 (MQ=255) tCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGG > 1:167745‑M1/1‑124 (MQ=255) tCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCC > 1:425383‑M1/1‑119 (MQ=255) aGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTTGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGc < 1:398671/191‑1 (MQ=255) aGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCa < 2:277734/192‑1 (MQ=255) aGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATT < 2:554525‑M1/101‑1 (MQ=255) ttACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGTGCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCa < 1:696005/269‑1 (MQ=255) gTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCgg < 2:167742/124‑1 (MQ=255) gTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTG < 2:425376‑M1/119‑1 (MQ=255) tACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTAAACCGGACAAAAGAACTTGCCGATaccc > 1:254656/1‑265 (MQ=255) cGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCcgcg > 1:643171/1‑167 (MQ=255) gTTAATTCATACATACCGCTGTTTTCTTTATATATAATCCCGCTACTGGTTTTTGCCGTTAATTTATGATGCAGCTTTTTATTGCTAATGTTATTAATGGGATTGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTTACCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAACGACTTGCCGATCCCCGCCa < 2:254651/265‑1 (MQ=255) ttAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAACGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATcccc > 1:614846/1‑260 (MQ=255) ttAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAACGTGGATTTANCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGAACAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGatatatat > 1:652923/1‑275 (MQ=255) tAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCAt < 2:643162/167‑1 (MQ=255) ttCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAACGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCa < 2:614837/260‑1 (MQ=255) ttCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATT < 1:328414‑M1/90‑1 (MQ=255) caTACCGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGTGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCATCTTGTTATAGCTAATTTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTTGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCa < 2:652914/274‑1 (MQ=255) aaTAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTtatggccacgccatatatatcgatggcg > 2:558811‑M1/1‑84 (MQ=255) aCGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTtatggccacgccatatatatcgatggcgggga < 1:558820‑M1/112‑33 (MQ=255) tGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGAc > 1:450459/1‑195 (MQ=255) aaataaTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCcggttcacgcattaaagtcggttaatttaacggtttatcctggtgaaatac > 1:123714‑M1/1‑86 (MQ=255) aaataaTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTa < 2:450452/195‑1 (MQ=255) ataatCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGG > 1:142228‑M1/1‑82 (MQ=255) ataatCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGG > 1:418007‑M1/1‑82 (MQ=255) ataatCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGATCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACttt > 2:181192/1‑110 (MQ=255) aatCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCcggttcacgcattaaagtcggttaatttaacggtttatcctggtgaaatacatgc < 2:123713‑M1/137‑56 (MQ=255) tctcgttACCGAGTTGTGCCTTTAATTTTTGATCTATCTTTTTATAGCTAATTTTATTAATGGTAATGTTGCCTTTGGTAGGCTCATGTATTCCGGATATAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTCCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATc < 1:707485/269‑1 (MQ=255) tCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCgg < 2:418000/82‑1 (MQ=255) tCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTAt > 1:177354/1‑154 (MQ=255) tCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGATCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCAtt < 1:181195/110‑1 (MQ=255) gATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCa < 2:177351/154‑1 (MQ=255) gATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAACCCGTTAAATTAACCGACTTNAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGtat > 1:556685/1‑275 (MQ=255) tACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTtatggccacgccatatatatcgatggcggggatcggcaagtcctttggtccggttcacgcattaaagtcggttaattt > 1:176863‑M1/1‑52 (MQ=255) cGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGG > 2:223546‑M1/1‑69 (MQ=255) gAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTtatggccacgccatatatatcgatggcggggatcggcaagtcctttggtccggttcacgcattaaagtcggttaatttaacg < 2:176860‑M1/130‑83 (MQ=255) aGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTtatggccacgccatatatatcgatggcggggatcggcaagtcctttggtccggttc < 1:200112‑M1/103‑57 (MQ=255) ttGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCgg < 1:223551/69‑1 (MQ=255) tgCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCT > 2:607458‑M1/1‑58 (MQ=255) gCTTATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATANAACTTTCANTAGCGTGGATTTGCCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACATCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATgg < 1:471796/272‑1 (MQ=255) gCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGG < 1:607467‑M1/58‑1 (MQ=255) gCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATT < 1:348520‑M1/38‑1 (MQ=255) gCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATT < 2:695768‑M1/38‑1 (MQ=255) cTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTg > 1:426786/1‑224 (MQ=255) tttATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTATCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCa < 2:426779/224‑1 (MQ=255) tGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTtatggccacgccatatatatcgatggcggggatcggcaagtcctttggtccggttcacgcattaaagtcggttaattt > 1:550196‑M1/1‑29 (MQ=255) ccAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTtatggccacgccatatatatcgatggcggggatcggcaagtcctttggtccggttcacgcattaaagtcggttaatttaacg < 2:550187‑M1/107‑83 (MQ=255) cAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACtt > 1:552687/1‑71 (MQ=255) cAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCATTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGAGTTGCCGATCCCCGCAATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCATGATGGCTACATTTATAAGGtat > 1:361592/1‑273 (MQ=255) gCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAAt > 2:487575/1‑141 (MQ=255) gCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGg < 2:170235‑M2/166‑2 (MQ=255) cTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGatatata > 1:284714/1‑201 (MQ=255) ttGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCAt < 2:552678/71‑1 (MQ=255) gTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATTAACCGTTAAATTAAc < 1:487582/141‑1 (MQ=255) gTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGgacca > 1:170238‑M2/1‑161 (MQ=255) ttATGGCTAATNTTATTAATGGTAAGGGTGCCTTTGGTCGTCTCATGTATTCCTGATAAAACTTTCATTAGCGTTGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCTGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCa < 2:58750/275‑1 (MQ=255) ttATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGc < 2:284709/201‑1 (MQ=255) cTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAg > 1:130101/1‑115 (MQ=255) cTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGgac < 2:330138‑M2/157‑4 (MQ=255) aaTGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTa > 1:132541/1‑130 (MQ=255) ttttataaATGGAATGGGTGCTTTTTGTCTGCTCATGTATTCCGGATTAAACTTTTATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAACGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTttg < 2:556676/273‑1 (MQ=255) tGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATa < 2:130100/115‑1 (MQ=255) tGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCATGAACCGgaccaaa > 1:330144‑M2/1‑150 (MQ=255) tGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGAATTTaa > 2:423400/1‑139 (MQ=255) ttattaATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCg < 2:132540/130‑1 (MQ=255) attaATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTAcc > 1:95405/1‑69 (MQ=255) attaATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAg > 2:409842/1‑107 (MQ=255) attaATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCa < 1:681439/194‑1 (MQ=255) ttaATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCAtttt > 1:381550/1‑79 (MQ=255) ttaATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATcccc > 2:173030/1‑168 (MQ=255) ttaATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCACGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTATACGTTCAGGTTATTTTGTTgg > 1:394632/1‑274 (MQ=255) | GATAGATAAATTCGCCACTTTCTCATCTAGATCAACTTTCAAGCCCACGCGTAATAACATCATGGCGGCGCGGACACGCATTTCTCGCCAGTCGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGG > CP009273/4300354‑4300877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |