New junction evidence | |||||||||||
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? | CP009273 | = 4300798 | 78 (2.110) | intergenic (‑1/+126) | alsA/alsB | fused D‑allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP‑binding components/D‑allose transporter subunit |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTATTGAGTGACCAGGATTGAATCGACCAGTTTAAATTCCGGTGCTTTATCCAGCGGGATAACCTTGCCGGATTTCTCAGCGTCAACCATCAGCTTCAGACCCGTTGCGCCGATATCCGCCGGGTTCTGGGCAACCGTCG > CP009273/4300548‑4301063 | tctcgttACCGAGTTGTGCCTTTAATTTTTGATCTATCTTTTTATAGCTAATTTTATTAATGGTAATGTTGCCTTTGGTAGGCTCATGTATTCCGGATATAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTCCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATc < 1:707485/269‑1 (MQ=255) 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cGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTATTGAGTGACCAGGATTGAATCGACCAGTTTAAATTCCGGTGCTTTATCCAGCGGGATaa < 2:516329/222‑1 (MQ=255) gATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTa > 1:123220/1‑162 (MQ=255) aTCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGaa < 1:252029/52‑1 (MQ=255) aTCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTATTGAGTGACCAGGATTGAATCGACCAGTTTAAATTCCGGTGCTTTATCCAGCGGGATAACCTTGCCGGATTTCTCAGCGTCAACCATCAGCtt < 2:136653/254‑1 (MQ=255) tCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAaataacattagctataacaagctggatcataaattagcggcacaactcggtatcgggattatttatcaggaactcagcgt < 1:558820‑M2/112‑81 (MQ=255) 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ataaataaCCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTATTGAGTGACCAGGATTGAATCGACCAGTTTAAATTCCGGTGCTTTATCCAGCGGGATAACCTTGCCGGATTTCTCAGCGTCAACCATCAGCTTCAGACCCGtt < 2:353530/234‑1 (MQ=255) taaataaCCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATgg < 2:220252/43‑1 (MQ=255) aaataaCCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACa > 2:516861‑M2/1‑46 (MQ=255) | TCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTATTGAGTGACCAGGATTGAATCGACCAGTTTAAATTCCGGTGCTTTATCCAGCGGGATAACCTTGCCGGATTTCTCAGCGTCAACCATCAGCTTCAGACCCGTTGCGCCGATATCCGCCGGGTTCTGGGCAACCGTCG > CP009273/4300548‑4301063 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |