New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4527387 = | 57 (1.480) | 10 (0.270) | 8/300 | NT | 15.4% | coding (25/981 nt) | nanS | 9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
? | CP009273 | 4527631 = | 55 (1.500) | coding (952/1107 nt) | nanM | N‑acetylneuraminic acid mutarotase |
AGTGCCTGGCCAACGGTGCCGTACTGTGTTTGATGATTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGAAGCGTTAGTTTTGTACTGTGACTTTATTATCCTTCACAGTGATCAAAACTGAATCCGTCACCGCTTTGCCGCCTGCAGTTTCACCGCCAATAATCAATAGACTATTATTCCAGGGCAATGATACTCCGTAGGCCCGACCTTGCGATAATTCACCCGATTTATCCCATTTCCCGTTATGCCAA > CP009273/4527122‑4527653 | gtttccTGGCCAACGGTGCCGGACTGTTTTTGATGATTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGa < 2:185693/271‑1 (MQ=255) tGCCTGGCCAACGGTGCCGTACTGTGTTTGATGATTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTACAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCCTCTTCCCTGTCCGGTCATTGCAGTTCTTCGCCATACTGCTTGGCATTAGACGGACCAGCAAACGTAAGAACCGTGTAATAANCg > 2:255424/1‑268 (MQ=255) tGCCTGGCCAACGGTGCCGTACTGTGTTTGATGATTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCATCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATAgggagcta > 1:18868/1‑270 (MQ=255) ccTGGCCAACGGTGCCGTACTGTGTTTGATGATTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATTGCAGTCCTTCGCCATACGCCCTCTCATTATACTGACCATCCACGTCATGACCATAGTAAAAAACAGGCGAtatt > 1:25212/1‑275 (MQ=255) 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atataatcaatCGGGCTATATTATTGCGTTCAGATAAATTTCGCGTATTTGAAATGACAAATTGTGAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGAAGCGTTAGTTTTGTACTGTGACTTTATTATCCTTCACAGTGATCAAAACTGAATCCGTCACCGCTTTGCCGCCTGCAGTTTCACCGCCAATAATCAATAGACTATTATTCCAGGGCAATGATACTCCGTAGGCCCGACCTTGCGATAATTCACCCGATTTATCCCATTTCCCGTTATGCCaa < 2:316227/267‑1 (MQ=255) tAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGAAGCGTTAGTTTTGTACTGTGACTTTATTATCCTTCACAGTGATCAAAACTGAATCCGTCACCGCTTTgc > 2:507099/1‑161 (MQ=255) aGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGaaa > 2:66378/1‑52 (MQ=255) aGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGTGGCCCTGAAGCGTTAGTTTTGTACTGTGACTTTATTATCCTTCACAGTGATCAAAACTGAATCCGTCACCGCTTTGCCGCCTGCAGTTTCACCGCCAATAATCAATAGACTattatt > 2:500865/1‑200 (MQ=255) aataatCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGAAGCGTTAGTTTTGTACTGTGACTTTATTATCCTTCACAGTGATCGAAACTGAATCCGTCACCGCTTTgccgcc < 1:507106/161‑1 (MQ=255) ataatCGGGCGATATTNTTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCGCCTTTACCGGGGCTCTGAAGCGTTAGTTTTGTACTGTGACTTTATTATCCTTCACAGTGATCAAAACTGAATCCGTCACCGCTTTGCCGCCTGCAGTTTCAACGCCACTCATCAATAGACTATTATTCCAg < 1:500872/200‑1 (MQ=255) ataatCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGAc < 1:66379/52‑1 (MQ=255) | AGTGCCTGGCCAACGGTGCCGTACTGTGTTTGATGATTCGTTGCCAGAGGATGGTGATAACCCTGCATATCCTGAACATCGTGTGGGCAGTGAGTCAGTGGAATAATGTCGTTAAAGTGACATGGCGGGCCTCCGGGATGCGTATGCGCAAATCTCGCTAATTGTTTAATTCTGGGATGAGGCGCATCTTCCCTGTCCGGTAATGGCAGTCCTTCGCCATACGCCATGGCATTAGACTGACCAGCAACGGTAAGAACATAGTAATAATCGGGCGATATTATTGCGTTCATATAAATTTCGCGTAATTGAAATGACAAATTGATAGCAGGGCCCCTTTACCGGGGCCCTGAAGCGTTAGTTTTGTACTGTGACTTTATTATCCTTCACAGTGATCAAAACTGAATCCGTCACCGCTTTGCCGCCTGCAGTTTCACCGCCAATAATCAATAGACTATTATTCCAGGGCAATGATACTCCGTAGGCCCGACCTTGCGATAATTCACCCGATTTATCCCATTTCCCGTTATGCCAA > CP009273/4527122‑4527653 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |