New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2697468 | 8 (0.210) | 8 (0.230) | 4/288 | NT | 36.1% | intergenic (‑46/+226) | rnc/lepB | RNase III/leader peptidase (signal peptidase I) |
? | CP009273 | = 2697536 | 21 (0.600) | intergenic (‑114/+158) | rnc/lepB | RNase III/leader peptidase (signal peptidase I) |
TGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCC > CP009273/2697337‑2697802 | tGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGct > 1:399880‑M2/1‑200 (MQ=255) aTGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCgg > 1:448691/1‑173 (MQ=255) ggTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGa < 2:448684/173‑1 (MQ=255) aataaatGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGAt > 2:520125/1‑199 (MQ=255) aatGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGTGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTAt < 1:520132/199‑1 (MQ=255) aatGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGCGTGCCGTGTCAACCTGGAGTTTCCAACCTTAAACTTCGCGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGTGAGATTTATCTCATAAGTAATTCACGTTGTCGCCTTAACGGCGACAACGTGAACTAAAATGTCTATTAATGTATGCCACCAATg > 1:282489/1‑274 (MQ=255) CACACGAAACAGACCTGATATACATGGGTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGAagacaag < 1:410092‑M1/275‑4 (MQ=255) aCATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACg < 2:450045/59‑1 (MQ=255) cATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGctgtttcgtgtgctgaattgttgacgcatttatttattggtatcgcatgaaccccatcgtaattaatcggcttcaacggaagctgggctacacttttaatcatcaggaactgttgcagcaggcatnaactcatcgtagtgccagcagtaaacataacgagcgtttagaatttttaggcgactctattcttatctacgttatcgccaatgcgctttct < 1:533958‑M2/275‑218 (MQ=255) cATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGctgtttcgtgtgctgaattgttgacgcatttatttattggtatcgcatgaaccccatcgtaattaatcggcttcaacggaagctgggctacacttttaatcatcag < 1:554547‑M2/164‑107 (MQ=255) cATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGctgtttcgtgtgctgaattgttgacgcatttatt < 2:558896‑M2/92‑35 (MQ=255) cATGGTTCTGCTAACAGCTTCGCTGCAGTCTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGctgtttcgtgtgctgaattgttgacgcatttatttattggtatcgcatgaaccccatcgtattaatcggctccaacggaagctgggcaacacttttaatcatcaggaactgttgcagcaggcattnactcatcgtagtgccagcagtaaacataacgagcgtttagaatttttaggcgactctattctgagctacgttatcaccaatgagcctgtc < 1:500834‑M2/274‑217 (MQ=255) cATGGTTCTGCTAACAGCTTCACTACAGCGTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGctgtttcgtgtgctgaattgttgacgcatttatttattggtatcgcatgaaccccatcgtaattaatcggcttcaacggaagctgggctacacttttaatcatcaggaactgttgcagcaggcatnaactcatcgtagt < 1:486146‑M2/197‑140 (MQ=255) gTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGTGACCAACGctgtttcgtgtgctgaattgttgacgcatttatttattggtatcgcatgaaccccatcgtaattaatcggcttcaacggaagctgggctacacttttaatcatcaggaactgttgcagcaggcattaactcatcgtagtgcca > 2:486139‑M2/1‑54 (MQ=255) gTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGctgtttcgtgtgctgaattgttgacgcatttatttattggtatcgcatgaaccccatcgtaattaatcggcttcaacggaagctgggctacacttttaatcatcaggaac > 2:554538‑M2/1‑54 (MQ=255) gTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGctgtttcgtgtgctgaattgttgacgcatttatttatt > 1:558905‑M2/1‑54 (MQ=255) ttCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGt > 1:356586/1‑133 (MQ=255) cTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCgg > 2:572378/1‑99 (MQ=255) tGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCgggg > 1:218469/1‑100 (MQ=255) gCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGtt < 2:356580/133‑1 (MQ=255) tAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGa < 1:572387/99‑1 (MQ=255) aaCTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAat < 2:218464/100‑1 (MQ=255) cGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAatat > 2:664544/1‑94 (MQ=255) cGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAatat > 2:92161/1‑94 (MQ=255) gCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCta < 1:92162/94‑1 (MQ=255) gCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCta < 1:664553/94‑1 (MQ=255) gtttACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCgg > 2:436923/1‑73 (MQ=255) aCCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGa < 1:436930/73‑1 (MQ=255) aCCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACaa > 2:394644/1‑88 (MQ=255) gTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAacgac < 1:394651/88‑1 (MQ=255) ggACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCa > 1:560652/1‑125 (MQ=255) ggACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTTCTTATCGACGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGAACGACCAGATACGCTTcc > 1:568442/1‑275 (MQ=255) cAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGtt < 2:560643/125‑1 (MQ=255) aaCGctgtttcgtgtgctgaattgttgacgcatttatttattggtatcgcat < 2:117481‑M2/52‑49 (MQ=255) | TGAGTTAATGCCTGCTGCAACAGTTCCTGATGATTAAAAGTGTAGCCCAGCTTCCGTTGAAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCC > CP009273/2697337‑2697802 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |