New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 264675 | 50 (1.250) | 7 (0.180) | 4/294 | NT | 15.1% | intergenic (‑4/+325) | ykfA/perR | CP4‑6 prophage; putative GTP‑binding protein/CP4‑6 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
? | CP009273 | = 264741 | 31 (0.810) | intergenic (‑70/+259) | ykfA/perR | CP4‑6 prophage; putative GTP‑binding protein/CP4‑6 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
GCAGGCGAAAGCGCAGTGGCTCACGTGTACAGGCCGCCACATCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGAGAGTATGAGCCGCCGTGATACACCTTAAAATCTCAACCCAGCAAAGTTTCGGAGCCGCGAGCAAAAGTGAGAGCCTTCACAAAATAA > CP009273/264434‑264946 | gCAGGCGAAAGCGCAGTGGCTCACGTGTACAGGCCGCCACATCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTTAAAAATAATaaaaaaaattaaa > 2:589668/1‑266 (MQ=255) aGTGGCTCACGTTTACAGGACGCCACATCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTACTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttt < 1:645535‑M1/275‑48 (MQ=255) cacaTCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACAGTAAAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTTCGTATGTTCAGagct < 2:188576‑M2/275‑5 (MQ=255) acaTCGCTGACCGGTGTTATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCTGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAAGAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 1:370987‑M2/1‑270 (MQ=255) acaTCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 1:589681‑M2/1‑270 (MQ=255) tCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 1:188578‑M2/1‑267 (MQ=255) ccGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATAGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGAATGTTCAGAGAGATGATATAAATCTGAAGAtttctta > 2:204055/1‑274 (MQ=255) aaaCAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTc > 2:644720/1‑239 (MQ=255) aGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGag > 1:644734‑M2/1‑237 (MQ=255) gACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgat < 2:267770‑M2/230‑7 (MQ=255) 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cGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCTCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGGAACGACTTCAAACCTTCATACTTATTCATCACTACTCCGTTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCTTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTAGTTTCAGAGAGATGATATATATCTGAGAATTTTTTCAGTCCTCTGCGCTTGAGTTAGCTGTTAGCCTgctcgctct > 2:235858/1‑274 (MQ=38) cGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgt > 2:129405‑M1/1‑140 (MQ=255) tttACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttt < 1:129406‑M1/183‑48 (MQ=255) ttACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaa < 1:204057/275‑1 (MQ=255) ccATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGANTGCTGAAACGACTTCAAACATTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaatgaa < 1:572297/275‑1 (MQ=255) aTAATGCCGAGTACTGGTTCTTAGTTAGGTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCGGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACGACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGAGATATATCTGAAGATTTTTTTAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaatgaa < 1:25840/273‑1 (MQ=255) tAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAaataat > 2:325028/1‑146 (MQ=255) gCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATaaaa < 1:325034/146‑1 (MQ=255) gATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTgaga > 1:336566/1‑161 (MQ=255) tagttagtTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCag > 2:696736/1‑174 (MQ=255) tagttaACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtg > 1:696750‑M2/1‑170 (MQ=255) ttaACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCTGCTCTGAGACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTCATGATATATATCNGAAGA‑TTTNTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAggg > 1:481992/1‑275 (MQ=255) ttaACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAAtt > 1:340825/1‑155 (MQ=255) aaCTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGt > 1:313626/1‑148 (MQ=255) aCTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTa > 1:402996/1‑157 (MQ=255) cTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGt < 2:340819/155‑1 (MQ=255) cTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCag > 2:228881/1‑163 (MQ=255) ggTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAAt < 2:313621/148‑1 (MQ=255) gTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGtt < 2:402989/157‑1 (MQ=255) ttAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtg > 1:228883‑M2/1‑159 (MQ=255) tgcAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTctgaacatacgcaattaacggcgtaatctcacgattctaccgt > 2:5592‑M1/1‑84 (MQ=255) 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attattCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACa < 1:173738/185‑1 (MQ=255) attCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGt > 1:132290/1‑38 (MQ=255) catcaCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcg > 2:192104‑M1/1‑7 (MQ=255) atcaCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaactaactacgagccagtgatcggcattatgggtaaaaccggtgttgggaagagcagtc < 2:267770‑M1/230‑225 (MQ=255) atcaCTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGaa < 2:132289/38‑1 (MQ=255) tcaCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttcttatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaactaactacgagccagtgatcggcattatgggtaaaacaggtgttgggaagagcagtctgtgcaatgccctgtttgccggagatataacaccggtcagcgatgt > 1:370987‑M1/1‑5 (MQ=255) tcaCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaactaactacgagccagtgatcggcattatgggtaaaaccggtgttgggaagagcagtctgtgcaatgccctgtttgccggagatatatcaccggtcagcgatgt > 1:589681‑M1/1‑5 (MQ=255) tcaCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaactaactacgagccagtgatcggcattatgggtaaaaccggtgttgggaagagcagtctgtgcaatgccctgtttgccggagatatatcaccggtcagcga > 1:188578‑M1/1‑5 (MQ=255) tcaCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgc > 2:337992‑M1/1‑5 (MQ=255) tcaCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagagga > 1:587120‑M1/1‑5 (MQ=255) tcaCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttc > 1:674948‑M1/1‑5 (MQ=255) tcaCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattattttt > 1:15688‑M1/1‑5 (MQ=255) tcaCTcggaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtt > 1:529384‑M1/1‑5 (MQ=255) caCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaacta > 1:696750‑M1/1‑4 (MQ=255) caCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaa > 1:228883‑M1/1‑4 (MQ=255) caCTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACt > 1:388554/1‑172 (MQ=255) caCTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTCCGTATGTACAGAGTGATGATCTATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTataata > 1:294487/1‑160 (MQ=255) agctctgaacatacgaaattaacggcggaatctcacgattttactgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaactaactacgagccagtgatcggcattatgggtaaaaccggtgttgggaagagcagtctgtgcaatgccctgtttgccggagatatatcaccggtcagcgatgtg < 2:188576‑M1/273‑272 (MQ=255) aCTctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttg < 1:192106‑M1/116‑114 (MQ=255) ctctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaactaactacgagccagtgatcggcattatgggtaaaaccggtgttgggaagagcagtctgtgcaatgccct > 1:644734‑M1/1‑2 (MQ=255) ctactCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGa < 2:587107‑M2/69‑2 (MQ=255) tctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgca < 1:337998‑M1/127‑127 (MQ=255) tctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtagtgatgaataattctgaaggtttgaa < 2:529375‑M1/94‑94 (MQ=255) tctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagaggagtag < 2:587107‑M1/69‑69 (MQ=255) tctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcagag < 2:674934‑M1/63‑63 (MQ=255) tctgaacatacgcaattaacggcggaatctcacgattctaccgttttttattatttttcaga < 2:15688‑M1/62‑62 (MQ=255) tactCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAAtt > 2:538650/1‑55 (MQ=255) | GCAGGCGAAAGCGCAGTGGCTCACGTGTACAGGCCGCCACATCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGAGAGTATGAGCCGCCGTGATACACCTTAAAATCTCAACCCAGCAAAGTTTCGGAGCCGCGAGCAAAAGTGAGAGCCTTCACAAAATAA > CP009273/264434‑264946 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |