New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 264675 | 50 (1.250) | 7 (0.180) | 4/294 | NT | 15.1% | intergenic (‑4/+325) | ykfA/perR | CP4‑6 prophage; putative GTP‑binding protein/CP4‑6 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
? | CP009273 | = 264741 | 31 (0.810) | intergenic (‑70/+259) | ykfA/perR | CP4‑6 prophage; putative GTP‑binding protein/CP4‑6 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
CACATCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGAGAGTATGAGCCGCCGTGATACACCTTAAAATCTCAACCCAGCAAAGTTTCGGAGCCGCGAGCAAAAGTGAGAGCCTTCACAAAATAATGCTTAGTAATAAAGTTACTTTGAATTCAGAGCCCCGATTAATGTGAACATGATCAACGAATTTT > CP009273/264471‑265011 | cacaTCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACAGTAAAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTTCGTATGTTCAGagct < 2:188576‑M2/275‑5 (MQ=255) acaTCGCTGACCGGTGTTATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCTGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAAGAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 1:370987‑M2/1‑270 (MQ=255) acaTCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 1:589681‑M2/1‑270 (MQ=255) tCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 1:188578‑M2/1‑267 (MQ=255) ccGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATAGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGAATGTTCAGAGAGATGATATAAATCTGAAGAtttctta > 2:204055/1‑274 (MQ=255) aGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGag > 1:644734‑M2/1‑237 (MQ=255) gACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgat < 2:267770‑M2/230‑7 (MQ=255) gCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGata < 1:267774/230‑1 (MQ=255) ctctTCCCAACACCGGGTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACNACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCAGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTAAGGAAGCTgcgc > 1:623233/1‑275 (MQ=255) cGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCTCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGGAACGACTTCAAACCTTCATACTTATTCATCACTACTCCGTTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCTTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTAGTTTCAGAGAGATGATATATATCTGAGAATTTTTTCAGTCCTCTGCGCTTGAGTTAGCTGTTAGCCTgctcgctct > 2:235858/1‑274 (MQ=38) ttACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaa < 1:204057/275‑1 (MQ=255) ccATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGANTGCTGAAACGACTTCAAACATTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaatgaa < 1:572297/275‑1 (MQ=255) aTAATGCCGAGTACTGGTTCTTAGTTAGGTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCGGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACGACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGAGATATATCTGAAGATTTTTTTAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaatgaa < 1:25840/273‑1 (MQ=255) tagttagtTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCag > 2:696736/1‑174 (MQ=255) tagttaACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtg > 1:696750‑M2/1‑170 (MQ=255) ttaACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCTGCTCTGAGACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTCATGATATATATCNGAAGA‑TTTNTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAggg > 1:481992/1‑275 (MQ=255) cTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCag > 2:228881/1‑163 (MQ=255) ttAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtg > 1:228883‑M2/1‑159 (MQ=255) tgcAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTACAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGAGAGTATg > 1:417182/1‑275 (MQ=255) aTTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaa > 2:152080/1‑202 (MQ=255) tGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGa < 1:337998‑M2/127‑2 (MQ=255) tGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTTCGCGACTTCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATCGCAGCATTTACTAACAGGGCTTTATTTAGAGTATGAGCCTCCGTGATACACCTTacatt > 2:304515/1‑271 (MQ=255) cGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaatgaa < 1:152081/202‑1 (MQ=255) gCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 2:337992‑M2/1‑122 (MQ=255) cAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagt < 1:192106‑M2/116‑4 (MQ=255) cGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgatg > 2:192104‑M2/1‑109 (MQ=255) gATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaa > 2:516699/1‑182 (MQ=255) gCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaatgaa < 1:516708/182‑1 (MQ=255) aCGCCTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaa > 2:325711/1‑172 (MQ=255) gACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTTAGATTCCGCCGTTCATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCACTCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGActgct > 2:667662/1‑159 (MQ=255) cTTCAAACCGTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCaatgaa < 1:325717/172‑1 (MQ=255) ttCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGa < 2:529375‑M2/94‑2 (MQ=255) ncAAACCTTCAGGATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGAGTTTTTCAATCCTCTGCGCGTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCt < 1:667676/158‑1 (MQ=255) aaCCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCCGagtga > 1:529384‑M2/1‑89 (MQ=255) caaaaTTAGTCATAACTACCCCTATGAACAATAATGCACACCTGGAGAATCCTGAGTTTCCGCCTTTAATTGCGTATGTTCTGAGTGATGATATATATCGGAAGATTTTTTCAAGCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGTGAGTATGAGCCGCCGTGATACACCTTACAATCTCAACCCAGCAAAGTTTCGGAGCCGCGAGCAAAAGTGAGAGc < 2:623219/272‑1 (MQ=255) cAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTgg > 1:679228/1‑148 (MQ=255) cAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACt > 2:173736/1‑185 (MQ=255) attattCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCa < 2:679214/148‑1 (MQ=255) attattCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACa < 1:173738/185‑1 (MQ=255) caCTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACt > 1:388554/1‑172 (MQ=255) caCTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTCCGTATGTACAGAGTGATGATCTATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTataata > 1:294487/1‑160 (MQ=255) ctactCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGa < 2:587107‑M2/69‑2 (MQ=255) actCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACa < 2:388547/172‑1 (MQ=255) tcctcTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 1:587120‑M2/1‑64 (MQ=255) ctctGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGa < 2:674934‑M2/63‑2 (MQ=255) tctGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGa < 2:15688‑M2/62‑2 (MQ=255) gAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 1:674948‑M2/1‑58 (MQ=255) aaaaaTAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtga > 1:15688‑M2/1‑57 (MQ=255) aaaaaCGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaactaagtacgagccagtgatcggcattatgggtaaaaccggtgttgggaagagcagtctgtgcaatgccctgtttgccggagatatatcaccggtcagcgatgtggcgtcctgtaaacgtgagccact < 1:645535‑M2/275‑229 (MQ=255) aaaaaCGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaactaactacgagccagtgatcggcattatgggtaaa < 1:129406‑M2/183‑137 (MQ=255) aaaaaCGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttc < 1:5592‑M2/127‑81 (MQ=255) aaaaaCGGTAGAATCCTGAGAGTGCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgatgaataattctgaag < 1:506096‑M2/67‑21 (MQ=255) aCGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgcagcaaattaaccagttaactaactacgagccagtgatcggcattatgggtaaaaccg > 2:129405‑M2/1‑43 (MQ=255) aCGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgatgaataattctgaaggttt > 2:506087‑M2/1‑43 (MQ=255) aCGGTAGAATCGTGAGATTACGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGagtgatgaataattctgaaggtttgaagtcgtttcagcaatcgcttgctgatctgccgcaatgggtatcagagcggcttctgca > 2:5592‑M2/1‑43 (MQ=255) cGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTtata > 1:447520/1‑98 (MQ=255) aTGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGActgct > 2:33418/1‑71 (MQ=255) aTGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGAGAGTATGAGCCGCCGTGATACACCTTAAAAtc > 1:6732/1‑158 (MQ=255) aTGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGAGAGTATGAGCCGCCGTGATACACCTTAAAATCTCAACCCAGCAAAGTTTCGGAGCCGCGAGCAAAAGTGAGAGCCTTCACAAAATAATGCTTAGTAATAAAGTTACTTTGAATTCAGAGCCCCGATTAATGTGAACATGATCAACGAAt > 1:301295/1‑275 (MQ=255) tGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATag < 2:447513/98‑1 (MQ=255) gTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCATTCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGAGAGTATGAGCCGCCGTGATACACCTTAAAATCTCAACCCAGCAAAGTGTCGGAGCCGCGAGCAAAAGTGAGAGCCTTCACAAAATAATGCTTAGTAATAAAGTTACTTTGAATTCAGAGCCCCGATTAATGTGAACATGATCAACGAAtt < 1:396012/274‑1 (MQ=255) ttCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGAATGCTGGCTACGGAAATGAATGAGTTATAATAGTAGCATTTACTAACAGGGATTTAGTGAGAGTATGAGACGCTGTGATACACATTACAATCTAAACCCAGCAAAGTTTCGGAGCAGCGTGCAAAAGTGAGAGACTTCACAAACTCAGGATTAGAAATAAAATAACTTTGACATCAGAACCCCGCGTAATGGGCACAAGATACACGAAattt > 2:741738/1‑275 (MQ=255) tCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCt < 1:33419/71‑1 (MQ=255) tCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGAGAGTATGAGCCGCCGTGATACACCTTAAAATCTCaa < 2:6732/158‑1 (MQ=255) | CACATCGCTGACCGGTGATATATCTCCGGCAAACAGGGCATTGCACAGACTGCTCTTCCCAACACCGGTTTTACCCATAATGCCGATCACTGGCTCGTAGTTAGTTAACTGGTTAATTTGCTGCAGAAGCCGCTCTGATACCCATTGCGGCAGATCAGCAAGCGATTGCTGAAACGACTTCAAACCTTCAGAATTATTCATCACTACTCCTCTGAAAAATAATAAAAAACGGTAGAATCGTGAGATTCCGCCGTTAATTGCGTATGTTCAGAGTGATGATATATATCTGAAGATTTTTTCAATCCTCTGCGCTTGAGGCAGCTGCGCGACTGCTGGCTCAGGCAATGAATGAGTTATAATAGCAGCATTTACTAACAGGGATTTATTGAGAGTATGAGCCGCCGTGATACACCTTAAAATCTCAACCCAGCAAAGTTTCGGAGCCGCGAGCAAAAGTGAGAGCCTTCACAAAATAATGCTTAGTAATAAAGTTACTTTGAATTCAGAGCCCCGATTAATGTGAACATGATCAACGAATTTT > CP009273/264471‑265011 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |