| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2209206 | 65 (1.620) | 14 (0.360) | 5/302 | NT | 19.4% | coding (71/108 nt) | yohO | putative membrane protein |
| ? | CP009273 | = 2209278 | 53 (1.360) | coding (678/732 nt) | yehW | inner membrane putative ABC superfamily transporter permease | |||||
ACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGACCTTACGCACTCGCTGACCACGACTCATTCCCATACCTTTCGCAACTTCTGTCACGCTGGCATCAATCGCT > CP009273/2209025‑2209542 | aCTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTTCTGGCTAAGCGCCTGAACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCCGGGcccc > 2:682795/1‑272 (MQ=255) cATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATAcg < 1:323674/275‑1 (MQ=255) ttcttatTTTCCCCCTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGAACACATAcg < 2:192323/270‑1 (MQ=255) ttCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGCTCACATNTGCGGGATTag > 2:73216/1‑274 (MQ=255) aCTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAAGGCGCTTTANTGTACAATNCTTTCGTTAACACAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGAGCGCCGCCAGt < 1:485954/230‑1 (MQ=255) ttCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGTTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCCGTAAAGCACCCATGATCACCTCCCCTTAATTAAATCCTCCAATccctaa > 2:387798/1‑267 (MQ=255) ttCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTGTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCGGTTCCTGTTTATGGCGTGAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTGGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAGCAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCgatgatga < 1:243135/275‑1 (MQ=255) tCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTCCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAGCGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCACCGTGCTGGCCCCTAc > 1:702286/1‑274 (MQ=255) tCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGAGATGATCGCCGCAAATGCCACCAGTAACGCCCCCTTGATCACAt > 1:206845/1‑208 (MQ=255) ttAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGt > 1:49338/1‑186 (MQ=255) tAACATAAGGAGTGAATTATTCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGACCTGTTCCTGTTTATGGTGTTATGCGGAATTGGGTGCGTCATGCTTGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCCAACAGGCGTTCTGCGATGATCGCTGCCAGTGCTACCAGTAACGCCCCCTGGATAACATAcga < 2:206843/208‑2 (MQ=255) aaCATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATATGAGGTATTAAATCCACTAAGCCCGATGAGGATGGGGGAACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTggtgct > 2:703432/1‑269 (MQ=255) aaCATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCg > 1:438189/1‑274 (MQ=255) cATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACg < 2:49337/186‑1 (MQ=255) ggCATTTTGCGATTTGGTAAATTTGGNGTCATCGCCCTTTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCTCATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTa < 2:478129/274‑1 (MQ=255) gCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTa > 1:467297/1‑274 (MQ=255) gCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGAGCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTgg > 1:658009/1‑245 (MQ=255) gcATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAg > 1:18063/1‑204 (MQ=255) aTAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTGTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCTCATACGNGGTATTAANTCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGc > 1:478138/1‑259 (MQ=255) aTAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTCTTCCTGTGTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGNGGTATTAANTCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGAt > 1:489660/1‑274 (MQ=255) aGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCg < 2:18063/204‑1 (MQ=255) aGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGc < 1:701353/233‑1 (MQ=255) ggTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTg > 2:186453/1‑139 (MQ=255) gTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGcc > 1:394572/1‑140 (MQ=255) aTCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGccac < 1:186455/139‑1 (MQ=255) tCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGccacca < 2:394565/140‑1 (MQ=255) gttcctgttTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGccacc > 1:39070/1‑132 (MQ=255) ctgttTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTa < 2:39069/132‑1 (MQ=255) tGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAAc > 1:352066/1‑127 (MQ=255) tGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATc > 1:81669/1‑158 (MQ=255) tGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTGGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGa > 2:311885/1‑274 (MQ=255) tttAGGCGGGATTGGTGGCGTCATGCGCGCAGGGTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCACACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCt < 2:81668/157‑1 (MQ=255) gTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGcc < 1:366868/114‑1 (MQ=255) gTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGccc < 2:352060/127‑1 (MQ=255) gtggCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATc > 2:457079/1‑140 (MQ=255) gtggCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGa < 1:311890/275‑1 (MQ=255) tggCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTACGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGGTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAAACACCGGAGCCGCCacccttcgctccc > 2:601809/1‑262 (MQ=255) cGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCt < 1:457086/140‑1 (MQ=255) gTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGa > 1:256686/1‑192 (MQ=255) aGGTTATACCTTTATATTGCGAGTCGGCACAGCGCCTCCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCNTCGCCGTAcc > 1:511325/1‑194 (MQ=255) ggTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCg < 1:454970/65‑1 (MQ=255) cTTTATTTTGCGTGCTGTCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCGGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGACCTTACGCACTCGCTGACCACGACt < 1:73217/275‑1 (MQ=255) cTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGACCTTACGCACTCGCTGACCACGACt < 1:387805/275‑1 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCATCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgatcgccgccagtgccaccagtaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgcgcataatgcactccttatgttaacgaaag < 1:564998‑M2/153‑100 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagct < 2:218568‑M2/117‑64 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagct < 2:417833‑M2/117‑64 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttag < 1:294245‑M2/115‑62 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttag < 1:55193‑M2/115‑62 (MQ=255) tATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaac < 2:136296‑M2/78‑25 (MQ=255) gatTTTGCTTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAACCAGGCGGCCTGCGctgacgccaccattaccgcctaccgccatagacaggaacagggcgatgacaccaattttag < 2:69983‑M2/114‑62 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAGCAGGCTGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctat > 1:69984‑M2/1‑50 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgatcgccgccagtgccaccagtaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgcgcataatgcactccttatgttaacgaaaggatt > 2:564986‑M2/1‑50 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgc > 1:417840‑M2/1‑50 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctatgc > 1:218570‑M2/1‑50 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctat > 2:294240‑M2/1‑50 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgccataaacaggaacagggcgatgaccccaattttagctat > 2:55192‑M2/1‑50 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGatgacgccaccaattccgcctaacgcca > 1:136297‑M2/1‑50 (MQ=255) ttGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTgg > 2:407226/1‑147 (MQ=255) cGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCg > 2:307986/1‑199 (MQ=255) cGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCAcgc > 1:92130/1‑204 (MQ=255) gTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGcccc < 1:407233/147‑1 (MQ=255) cTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCAcgcccgc < 2:92129/204‑1 (MQ=255) cTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCAcg < 1:307991/199‑1 (MQ=255) gccaggcccAGCCTTTCCAACAGGCGGTCTGCGAGGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCGGGTGCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCTATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGACCTTACGCACTCGCTGACCACGACTCATTCCCATACCTTTCGCAACtt < 2:702272/267‑1 (MQ=255) tGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTgg > 1:127948/1‑127 (MQ=255) ccgcccTTTCCAACTGGCGTTCTGCGATGCTCCCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGcccc < 2:127947/123‑1 (MQ=255) cAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTTAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGTCCCCTACCGTTTAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGACCTTACGCACTCGCTGACCACGACTCATTCCCATACCTTTCGCAACTTCTGTCACg < 1:703446/274‑1 (MQ=255) ggCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCCGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGCCCTTACGCACTCGCTGACCACGACTCATTCCCATACCTTTCCCAACTTCTGTCACGCTGGCATCAATCGCt > 1:177029/1‑275 (MQ=255) | ACTCACCAGTTGGCAAGAACAAGGCCATGATATTTTCCCACTCGGCATTTAATGATTCGTTAACAAATGCGCTTTACTGTACAATCCTTTCGTTAACATAAGGAGTGCATTATGCGCATAGCTAAAATTGGGGTCATCGCCCTGTTCCTGTTTATGGCGTTAGGCGGAATTGGTGGCGTCATGCTCGCAGGTTATACCTTTATTTTGCGTGCTGGCTAAGCGCCTGCACCAGCCTTTCAAACAGGCGGTCTGCGATGATCGCCGCCAGTGCCACCAGTAACGCCCCCTGGATCACATACGCGGTATTAAATCCGCTAAGCCCGATGATGATGGGCGTACCCAGCGTGCTGGCCCCTACCGTTGAGGCGATCGTCGCCGTACCAATGTTGATAATCACCGAAGTTCGCACGCCCGCCAGAATCACCGGAGCCGCCAGCGGTAGCTCGACCTTACGCACTCGCTGACCACGACTCATTCCCATACCTTTCGCAACTTCTGTCACGCTGGCATCAATCGCT > CP009273/2209025‑2209542 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |