| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAATTAAATGCGAGGGATATTCCGGAGTACGTGAATTAGGGTAAAATGCAAGCGTTGGTTTATGATAAGCCGCAGCGATATGAACAAGAGCTGTATCAACAGAAATGACAAAATCACTATACTTGGTCAACGCAACGGTATAAATAAACTCATCAAATGGTAGTGTTTCGATTTCAAGTATTGGTATTGTCAATAAATCTTGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCT > CP009273/3791623‑3792128 | tctcTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTATAGATTTATGATGATTCGGGGACCAAATTAAATGCGAGGGATATTCCGGAGTACGTGAATTAGGGTAAAATGCAAGCGTTGGTTTATGATAAGCCGCAGCGATATGAACAAGAGCTGTATCAACAGAAATGACAAAATCACTATACTTGGTCAACGCAACGGTATAAATAAACTCATCAAATGGTAGTGTATAGATTTCAAgta > 1:308719/1‑275 (MQ=255) 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atcaAATGGTAGTGTTTCGATTTCAAGTATTGGTATTGTCAATAAATCTTGCGGTAACCCGGTAAata < 2:16231/68‑1 (MQ=255) atcaAATGGTAGTGTTTCGATTTCAAGTATTGGTATTGTCAATAAATCTTGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAgt < 1:626142/89‑1 (MQ=255) tcaAATGGTAGTGTTTCGATTTCAAGTATTGGTATTGTCAATAAATCTTGCGGTAAcc > 1:168155/1‑58 (MQ=255) tcaAATGGTAGTGTTTCGATTTCAAGTATTGGTATTGTCAATAAATCTTGCGGTAACCCGGt < 1:45920/62‑1 (MQ=255) tcaAATGGTAGTGTTTCGATTTCAAGTATTGGTATTGTCAATAAATCTTGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCActtct < 2:232824/102‑1 (MQ=255) tcaAATGGTAGTGTTTCGATTTCAAGTATTGGTATTGTCAATAAATCTTGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCAc > 2:683312/1‑98 (MQ=255) tcaAATGGTAGTGTTTCGATTTCAAGTATTGGTATTGTCAATAAATCTTGCGGTAACCCGGTAAATATAATCCGATAATTTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGa < 1:685190/135‑1 (MQ=255) aaaTGGTAGTGTTTCGATTTCAAGTATTGGTATTGTCAATAAATCTTGCGGTAACCCGGt < 1:15979/60‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |