New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 4273257 | 49 (0.700) | 24 (0.350) | 13/132 | 2.1 | 33.3% | coding (1574/1650 nt) | actP | acetate transporter |
? | CP009273 | 4273264 = | 48 (0.700) | coding (1567/1650 nt) | actP | acetate transporter |
CGGCCTTGCTCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAT > CP009273/4273191‑4273321 | cgGCCTTGCTCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTtcacgctcacg < 1:3958643/68‑1 (MQ=255) cgGCCTTGCTCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACc < 1:1306066‑M1/68‑2 (MQ=255) tGCTCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGcc < 1:2287587/68‑1 (MQ=255) tCAACGCGAAAGCCGGTCTGGGAGAGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTc > 1:5937773/1‑68 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCCCcttccgctga > 1:5513813‑M1/1‑58 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACcttccgctga > 1:4508799‑M1/1‑58 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACcttccgctga > 1:6071583‑M1/1‑58 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACcttccgctga > 1:6191709‑M1/1‑58 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTc > 1:5771518/1‑68 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTc > 1:1222241/1‑68 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACCCTCACGCGCGCCTTc > 1:3487284/1‑68 (MQ=255) aaCGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACcttccgctgagt < 1:6065345‑M1/68‑13 (MQ=255) aCGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGc < 1:2451131/68‑1 (MQ=255) cGCCTAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACTGTTCACGCTCACGCGCGGCTTCCGCt < 1:4514880/68‑1 (MQ=255) gCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTg > 1:5217021/1‑68 (MQ=255) gCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTg > 1:573778/1‑68 (MQ=255) ccAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGa < 1:1768601/68‑1 (MQ=255) ccAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGa < 1:111969/68‑1 (MQ=255) ccAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGa < 1:3520080/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGTAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:1198617/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:4074114/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:3051051/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:5593734/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:6059381/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:4321704/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACAGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:5594088/68‑1 (MQ=255) gCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCCCGCGCGCCTTCCGCTGAGTTAt > 1:4218546/1‑68 (MQ=255) gCCGGGCTGGGAGCGGATGAACAGCGCGCGGGACAGTACACGCTCACcttccgctgagttatcggttg > 1:1289338‑M1/1‑47 (MQ=255) ccGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgc < 1:2426540‑M1/68‑23 (MQ=255) ccGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgc < 1:350271‑M1/68‑23 (MQ=255) tGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGc < 1:3025761/68‑1 (MQ=255) aGCGGATAAACTGCGCGCGGAACCGTTCACGCTCACcttccgcggagttatcggttgccgagaagaac < 1:6063966‑M1/68‑33 (MQ=255) aGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaac > 1:382733‑M1/1‑36 (MQ=255) aGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCTCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgag > 1:3808979/1‑68 (MQ=255) aGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgag < 1:4028859/68‑1 (MQ=255) aGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCGCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaac < 1:2190412‑M1/68‑33 (MQ=255) aGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTAACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgag > 1:1885962/1‑68 (MQ=255) gCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCTCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgaga < 1:2807523/68‑1 (MQ=255) gCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgaga < 1:4429088/68‑1 (MQ=255) gATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGagaaga < 1:1305695/68‑1 (MQ=255) tAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatg < 1:3780769‑M1/68‑39 (MQ=255) cTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGa > 1:1543694/1‑68 (MQ=255) tGCGCGCGGATCAGTTCACGCTCTCGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCTGTTGCCGAGAAGAACCAGAt > 1:5987596/1‑68 (MQ=255) tGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgag > 1:206261‑M1/1‑25 (MQ=255) tGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGAt > 1:2641638/1‑68 (MQ=255) tGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGAt > 1:4998063/1‑68 (MQ=255) tcgGAACAGAACACGCTCACGCGCGCCTTCCTCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAATAACCAGATGCCGa < 1:5532813/67‑1 (MQ=255) gcgGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGa < 1:5460850/68‑1 (MQ=255) cgGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAg < 1:786981/68‑1 (MQ=255) ggAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAgg < 1:3533446/68‑1 (MQ=255) aCAGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacg < 1:1300023‑M1/68‑54 (MQ=255) aCAGATCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAAt < 1:5701176/68‑1 (MQ=255) aGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacggt < 1:4815768‑M1/68‑56 (MQ=255) aGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacggt < 1:2342827‑M1/68‑56 (MQ=255) aGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacggt < 1:3347440‑M1/68‑56 (MQ=255) aGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacggt < 1:3833601‑M1/68‑56 (MQ=255) aGTTCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacggt < 1:5110315‑M1/68‑56 (MQ=255) tCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacggtgat < 1:5468638‑M1/68‑59 (MQ=255) tCACGCTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacggtgat < 1:5943665‑M1/68‑59 (MQ=255) tCACGCTCACctaccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacggtgat < 1:3091126‑M1/68‑59 (MQ=255) cacgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACg < 1:3998355/68‑1 (MQ=255) cacgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACg < 1:5020806/68‑1 (MQ=255) cacgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACg < 1:4901891/68‑1 (MQ=255) cacgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACg < 1:3425922/68‑1 (MQ=255) cgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACggg < 1:2839597/68‑2 (MQ=255) cgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGt < 1:5051904/68‑1 (MQ=255) cgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGt < 1:1437060/68‑1 (MQ=255) gctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGCACCAGATGCCGCGGAATGCCACGGTg > 1:1971940/1‑68 (MQ=255) gctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTg < 1:1990420/68‑1 (MQ=255) ctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGa > 1:1313163/1‑68 (MQ=255) cTCACcttccgctgagttatcggttgccgagaagaaccagatgccgaggaatgccacggtgatagaga > 1:4083782‑M1/1‑5 (MQ=255) tcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAt < 1:5287927/68‑1 (MQ=255) tcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAt < 1:2374779/68‑1 (MQ=255) | CGGCCTTGCTCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAT > CP009273/4273191‑4273321 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |