New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 4273257 | 49 (0.700) | 24 (0.350) | 13/132 | 2.1 | 33.3% | coding (1574/1650 nt) | actP | acetate transporter |
? | CP009273 | 4273264 = | 48 (0.700) | coding (1567/1650 nt) | actP | acetate transporter |
TGCTCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGATAGAGAACAGC > CP009273/4273197‑4273331 | tGCTCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGcc < 1:2287587/68‑1 (MQ=255) cggccttgctcaacgccaaagccggtctgggagcggataaactgcgcgcggaacagttcacgctcacc < 1:1306066‑M2/1‑1 (MQ=255) tCAACGCGAAAGCCGGTCTGGGAGAGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTc > 1:5937773/1‑68 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTc > 1:1222241/1‑68 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTc > 1:5771518/1‑68 (MQ=255) tCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACCCTCACGCGCGCCTTc > 1:3487284/1‑68 (MQ=255) aCGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGc < 1:2451131/68‑1 (MQ=255) cGCCTAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACTGTTCACGCTCACGCGCGGCTTCCGCt < 1:4514880/68‑1 (MQ=255) gCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTg > 1:573778/1‑68 (MQ=255) gCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTg > 1:5217021/1‑68 (MQ=255) tcaacgccaaagccggtctgggagcggataaactgcgcgcggaacagttcacgctcccCTTCCGCTGa > 1:5513813‑M2/59‑68 (MQ=255) tcaacgccaaagccggtctgggagcggataaactgcgcgcggaacagttcacgctcacCTTCCGCTGa > 1:6071583‑M2/59‑68 (MQ=255) tcaacgccaaagccggtctgggagcggataaactgcgcgcggaacagttcacgctcacCTTCCGCTGa > 1:4508799‑M2/59‑68 (MQ=255) tcaacgccaaagccggtctgggagcggataaactgcgcgcggaacagttcacgctcacCTTCCGCTGa > 1:6191709‑M2/59‑68 (MQ=255) ccAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGa < 1:1768601/68‑1 (MQ=255) ccAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGa < 1:3520080/68‑1 (MQ=255) ccAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGa < 1:111969/68‑1 (MQ=255) aacgccaaagccggtctgggagcggataaactgcgcgcggaacagttcacgctcacCTTCCGCTGAGt < 1:6065345‑M2/12‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGTAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:1198617/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:5593734/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:6059381/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:4074114/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:4321704/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:3051051/68‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACAGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGt < 1:5594088/68‑1 (MQ=255) gCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCCCGCGCGCCTTCCGCTGAGTTAt > 1:4218546/1‑68 (MQ=255) gccgggctgggagcggatgaacagcgcgcgggacagtacacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTg > 1:1289338‑M2/48‑68 (MQ=255) tGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGc < 1:3025761/68‑1 (MQ=255) ccggtctgggagcggataaactgcgcgcggaacagttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGc < 1:350271‑M2/22‑1 (MQ=255) ccggtctgggagcggataaactgcgcgcggaacagttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGc < 1:2426540‑M2/22‑1 (MQ=255) aGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCTCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgag > 1:3808979/1‑68 (MQ=255) aGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgag < 1:4028859/68‑1 (MQ=255) aGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTAACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgag > 1:1885962/1‑68 (MQ=255) gCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCTCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgaga < 1:2807523/68‑1 (MQ=255) gCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCgaga < 1:4429088/68‑1 (MQ=255) gATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGagaaga < 1:1305695/68‑1 (MQ=255) agcggataaactgcgcgcggaaccgttcacgctcacCTTCCGCGGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAAc < 1:6063966‑M2/32‑1 (MQ=255) agcggataaactgcgcgcggaacagttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAAc > 1:382733‑M2/37‑68 (MQ=255) agcggataaactgcgcgcggaacagttcacgcgcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAAc < 1:2190412‑M2/32‑1 (MQ=255) cTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGa > 1:1543694/1‑68 (MQ=255) tGCGCGCGGATCAGTTCACGCTCTCGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCTGTTGCCGAGAAGAACCAGAt > 1:5987596/1‑68 (MQ=255) tGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGAt > 1:2641638/1‑68 (MQ=255) tGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGAt > 1:4998063/1‑68 (MQ=255) taaactgcgcgcggaacagttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATg < 1:3780769‑M2/38‑1 (MQ=255) tcgGAACAGAACACGCTCACGCGCGCCTTCCTCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAATAACCAGATGCCGa < 1:5532813/67‑1 (MQ=255) gcgGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGa < 1:5460850/68‑1 (MQ=255) tgcgcgcggaacagttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAg > 1:206261‑M2/26‑68 (MQ=255) cgGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAg < 1:786981/68‑1 (MQ=255) ggAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAgg < 1:3533446/68‑1 (MQ=255) aCAGATCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAAt < 1:5701176/68‑1 (MQ=255) cacgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACg < 1:5020806/68‑1 (MQ=255) cacgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACg < 1:3425922/68‑1 (MQ=255) cacgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACg < 1:3998355/68‑1 (MQ=255) cacgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACg < 1:4901891/68‑1 (MQ=255) acagttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACg < 1:1300023‑M2/53‑1 (MQ=255) cgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACggg < 1:2839597/68‑2 (MQ=255) cgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGt < 1:5051904/68‑1 (MQ=255) cgctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGt < 1:1437060/68‑1 (MQ=255) agttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGt < 1:4815768‑M2/55‑1 (MQ=255) agttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGt < 1:3833601‑M2/55‑1 (MQ=255) agttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGt < 1:5110315‑M2/55‑1 (MQ=255) agttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGt < 1:3347440‑M2/55‑1 (MQ=255) agttcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGt < 1:2342827‑M2/55‑1 (MQ=255) gctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGCACCAGATGCCGCGGAATGCCACGGTg > 1:1971940/1‑68 (MQ=255) gctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTg < 1:1990420/68‑1 (MQ=255) ctcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGa > 1:1313163/1‑68 (MQ=255) tcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAt < 1:5468638‑M2/58‑1 (MQ=255) tcacgctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAt < 1:5943665‑M2/58‑1 (MQ=255) tcacgctcacCTACCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAt < 1:3091126‑M2/58‑1 (MQ=255) tcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAt < 1:2374779/68‑1 (MQ=255) tcacgcGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAt < 1:5287927/68‑1 (MQ=255) ctcacCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGATAgaga > 1:4083782‑M2/6‑68 (MQ=255) cTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGAGAGAGAACAgc > 1:5456206/1‑68 (MQ=255) | TGCTCAACGCCAAAGCCGGTCTGGGAGCGGATAAACTGCGCGCGGAACAGTTCACGCTCACGCGCGCCTTCCGCTGAGTTATCGGTTGCCGAGAAGAACCAGATGCCGAGGAATGCCACGGTGATAGAGAACAGC > CP009273/4273197‑4273331 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |