New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 657540 | 20 (0.320) | 19 (0.310) | 15/388 | 2.5 | 48.7% | intergenic (+39/+15) | cspE/crcB | transcription antiterminator and regulator of RNA stability/F(‑) channel |
? | NC_000913 | 657545 = | 20 (0.320) | intergenic (+44/+10) | cspE/crcB | transcription antiterminator and regulator of RNA stability/F(‑) channel |
GCATTTGTGTCTATTTTTCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑TTT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGTAACAAAAACACCACTTCTGCCGAAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATCAATGTTCGTCATCCTGCTGAACCATGCGAATCCTATTCCTATGATGAATGCCCCAATCAGGTTTGC > NC_000913/657256‑657821 | gCATTTGTGTCTATTTTTCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑‑AAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑TTT‑TTTTTTG‑GCTTTAG‑T‑‑GTGCGGt > 1:823556/1‑309 (MQ=255) tgtgTCTATTTTTCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑TTT‑TTTTTGG‑‑CTTTAG‑T‑‑GTGCGGt > 1:823557/1‑304 (MQ=255) tttCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑‑TT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGc > 1:823559/1‑291 (MQ=255) tGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGCAAAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑Gttttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaa < 1:823555‑M1/299‑34 (MQ=255) gTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGCAAAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACT‑ATGG‑TTTTAAAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑‑TT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑TTAGTGCGGTTGA‑GGCCGAAAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑AACG‑TCAGTAATg‑ccagcca > 1:86824/1‑374 (MQ=255) aaCGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGCAAAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGC‑‑GG‑‑TGT‑TTTTTGG‑TCtt < 1:823564/246‑1 (MQ=255) aaGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑TTT‑TTTTTGG‑TCTTTAGTT‑‑GTGCGGTTGATGGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGAccc > 1:823570/1‑301 (MQ=255) tCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑‑AACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGTGttttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacg < 1:823566‑M1/294‑85 (MQ=255) aaaGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑‑AACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTC‑AAACCCGCTTAATCAGC‑‑Gtttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacgaaaacgtt < 1:823567‑M1/295‑92 (MQ=255) aTTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑TTT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGt > 1:823575/1‑218 (MQ=255) aCTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑TTT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATgg > 1:823577/1‑253 (MQ=255) gAAGACGGCAGCAAAAGACGTGTTTCGTACACTTTCTCTGCAATCCAGACTAATGGTTTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAAGGACCCTTCTGCTGC‑AAACG‑AATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGC‑‑GG‑‑TGT‑TTTTTTG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGtt < 1:86833/214‑1 (MQ=255) aaaGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑‑TT‑TTTTTGG‑TCTTTAg‑t > 1:823579/1‑188 (MQ=255) gtg‑tTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTC‑AAACCCGCTTAATCAGCG‑Gtttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacgaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaa < 1:823576‑M1/292‑129 (MQ=255) tctcTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGC‑‑GG‑‑TGT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGt < 1:823578/210‑1 (MQ=255) cAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGTGttttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgcc < 1:823580‑M1/191‑49 (MQ=255) tt‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑TTT‑TTTTTTG‑GCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGTTCAGTAATGCCCa > 1:823586/1‑234 (MQ=255) ttGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑GGT‑TTT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGTAACAAAAACACCACTTCTGCCGAAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCggtggt > 1:823587/1‑311 (MQ=255) gTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑‑AACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGTGtttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacgaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaaaacaccacttctgccgaaaatgttgagaaggttgttagaccgccacaaaatccggtggtgattaa < 1:823583‑M1/303‑194 (MQ=255) tCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGCAAAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGTGttttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacgaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaa < 1:823585‑M1/239‑129 (MQ=255) 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aCGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑GGT‑TTT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGTAACAAAAACACCACtt > 1:823594/1‑226 (MQ=255) aCGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑GGT‑TTT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGTAACAAAAACACCACTTCTGCCGAAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGAcc > 1:823593/1‑257 (MQ=255) cc‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTC‑AAACCCGCTTAATCAGCG‑Gtttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacgaa < 1:823589‑M1/161‑86 (MQ=255) tgctgc‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑‑TT‑TTTTTGG‑TCTTAGT‑T‑‑GTGCGGTTGATGGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGaa > 1:86842/1‑143 (MQ=255) tctGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGC‑‑Gtgtttgtcttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaaagaccccagaaggttgacgaaaaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaaacaccacttctgccgaaaatgttgagaaggttgttagaccgccacaaaatccggtggtgattaatactttccacactggatcaaatgttcgtcatc < 1:86840‑M1/271‑227 (MQ=255) tAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAA‑‑CCGCTTAATCAGC‑‑Gtttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacgaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaaaacaccacttctgccgaaaatgttgagaaggttgttagaccgccacaaaatccggtggtgattaatactttccacactggatcaatgttcgtcatcctgct < 1:823595‑M1/269‑231 (MQ=255) aGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTC‑AAACCCGCTTAATCAGCG‑Gtttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacgaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaaacaccacttctgccgaaaatgttgag < 1:823596‑M1/193‑155 (MQ=255) aGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTC‑AAACCCGCTTAATCAGCG‑Gtttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgac < 1:823597‑M1/121‑83 (MQ=255) gATACGTC‑AGTC‑AA‑C‑GATTCAAA‑‑CCGCTTAATCAGCG‑Gtttgttttgtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacgaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaaaacaccacttctgccgaaaatgttgagaaggttgttagaccgccacaaaatccgg < 1:86843‑M1/223‑186 (MQ=255) aCGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑Ttttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtca < 1:823598‑M1/93‑58 (MQ=255) tC‑AG‑C‑AACG‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCG‑GT‑‑TTG‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGtt < 1:823600/128‑1 (MQ=255) g‑C‑AA‑G‑AATTCAAA‑‑CCGCTTAATCAGCG‑Gttgttgtcttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaagaccccagaaggttgacgaaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaaaacaccacttctgccgaaaatgttgagaaggttgttagaccgccacaaaatccggtggtgattaatactttccac < 1:86845‑M1/230‑203 (MQ=255) g‑AATTC‑AAACCCGCTTAATCAGCG‑Tgttttggtctttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaaagaccccagaaggttgacgaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaaacaccacttctgccgaaaatgttgagaaggttgttagaccgccacaaaatccggtggtgattaatactttccacactggatcaatgttcgtcatcctgctgaaccatgc < 1:823599‑M1/263‑239 (MQ=255) ttCAAAACCCGCTTAATCAGC‑‑Gtgtttggtcttagtgtgcggttgaggccgaaaacagccagaatgccagtgcggtcatggcaaaaagaccccagaagttgacgaaaaacgttcagtaatgcccagccaaagcggccctcttgtaacaaaacaccacttctgccgaaaaatgttgagaaggttgttagaccgccacaaaatccggtggtgattaatactttccacactggatcaatgttcgtcatcctgctgaaccatgcgaatcctattcctatgatgaatgccccaatcaggtttgctgtcagcgtcccc < 1:86844‑M1/312‑291 (MQ=255) cGCTTAATCAGCG‑GT‑‑TTTGTTTTTGGTTCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGTAACAAAAACACCACTTCTGCCGAAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATc < 1:823602/231‑1 (MQ=255) | GCATTTGTGTCTATTTTTCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTC‑AG‑C‑AA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCG‑GG‑‑TTT‑TTTTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGTAACAAAAACACCACTTCTGCCGAAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATCAATGTTCGTCATCCTGCTGAACCATGCGAATCCTATTCCTATGATGAATGCCCCAATCAGGTTTGC > NC_000913/657256‑657821 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |