New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 657540 | 20 (0.320) | 19 (0.310) | 15/388 | 2.5 | 48.7% | intergenic (+39/+15) | cspE/crcB | transcription antiterminator and regulator of RNA stability/F(‑) channel |
? | NC_000913 | 657545 = | 20 (0.320) | intergenic (+44/+10) | cspE/crcB | transcription antiterminator and regulator of RNA stability/F(‑) channel |
GCATTTGTGTCTATTTTTCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGG‑‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATC‑AATGTTCGTCATCCTGCTGAACCATGCGAATCCTATTCCTATGATGAATGCCCCAATCAGGTTTGCTGTCAGCGTCCCC > NC_000913/657256‑657834 | gCATTTGTGTCTATTTTTCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑‑AAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCGGG‑‑TTT‑TT‑‑TTTTG‑GCTTTAG‑T‑‑GTGCGGt > 1:823556/1‑309 (MQ=255) tgtgTCTATTTTTCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCGGG‑‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑‑CTTTAG‑T‑‑GTGCGGt > 1:823557/1‑304 (MQ=255) tttCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCGGG‑‑‑TT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGc > 1:823559/1‑291 (MQ=255) gTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGCAAAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACT‑ATGG‑TTTTAAAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGG‑‑‑TT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑TTAGTGCGGTTGA‑GGCCGAAAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑‑‑AACG‑TCAGTAATg‑ccagcca > 1:86824/1‑374 (MQ=255) tgtaaaggtaattttgatgtctaagattaaaggtaacgttaagtggtttaatgagtccaaaggattcggtttcattactccggaagacggcagcaaaagacgtgttcgtacacttctctgcaatccagactaatggttttaaaactcttgctgaaggtcagcgcgtagagttcgaaatcactaacggtgccaaaggcccttctgctgcaaacgtaatcgctctgtaagatacgtcagcaagaattcaaaacccgcttaatcagcggtTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑aa < 1:823555‑M2/32‑1 (MQ=255) aaCGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGCAAAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGC‑GG‑‑TGT‑TT‑‑TTTGG‑TCtt < 1:823564/246‑1 (MQ=255) aaGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGG‑‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAGTT‑‑GTGCGGTTGATGGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGAccc > 1:823570/1‑301 (MQ=255) tccaaaggattcggtttcattactccggaagacggcagcaaagacgtgttcgtacacttctctgcaatccagactaatggttttaaaactcttgctgaaggtcagcgcgtagagttcgaaatcactaacggtgccaaaggcccttctgctgcaacgtaatcgctctgtaagatacgtcagcaagaattcaaaacccgcttaatcagcgtgtTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACg < 1:823566‑M2/83‑1 (MQ=255) aTTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGG‑‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGt > 1:823575/1‑218 (MQ=255) aCTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCGGG‑‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATgg > 1:823577/1‑253 (MQ=255) aaaggattcggtttcattactccggaagacggcagcaaagacgtgttcgtacacttctctgcaatccagactaatggttttaaaactcttgctgaaggtcagcgcgtagagttcgaaatcactaacggtgccaaaggcccttctgctgcaacgtaatcgctctgtaagatacgtcagcaagaattcaaacccgcttaatcagcgTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGtt < 1:823567‑M2/91‑1 (MQ=255) gAAGACGGCAGCAAAAGACGTGTTTCGTACACTTTCTCTGCAATCCAGACTAATGGTTTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAAGGACCCTTCTGCTGC‑AAACG‑AATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGC‑GG‑‑TGT‑TT‑‑TTTTG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGtt < 1:86833/214‑1 (MQ=255) aaaGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCGGG‑‑‑TT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAg‑t > 1:823579/1‑188 (MQ=255) tctcTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGC‑GG‑‑TGT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGt < 1:823578/210‑1 (MQ=255) gtgttcgtacacttctctgcaatccagactaatggttttaaaactcttgctgaaggtcagcgcgtagagttcgaaatcactaacggtgccaaaggcccttctgctgcaaacgtaatcgctctgtaagatacgtcagcaagaattcaaacccgcttaatcagcggTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACaaa < 1:823576‑M2/128‑1 (MQ=255) cagactaatggttttaaaactcttgctgaaggtcagcgcgtagagttcgaaatcactaacggtgccaaaaggcccttctgctgcaaacgtaatcgctctgtaagatacgtcagcaagaattcaaaacccgcttaatcagcgtgtTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGcc < 1:823580‑M2/47‑1 (MQ=255) tt‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCGGG‑‑TTT‑TT‑‑TTTTG‑GCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCa > 1:823586/1‑234 (MQ=255) ttGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGGT‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCggtggt > 1:823587/1‑311 (MQ=255) tcagcgcgtagagttcgaaatcactaacggtgccaaaggcccttctgctgcaaaacgtaatcgctctgtaagatacgtcagcaagaattcaaaacccgcttaatcagcgtgtTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑‑AAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACaaa < 1:823585‑M2/127‑1 (MQ=255) gtcagcgcgtagagttcgaaatcactaacggtgccaaaggcccttctgctgcaacgtaatcgctctgtaagatacgtcagcaagaattcaaaacccgcttaatcagcgtgTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTaa < 1:823583‑M2/193‑1 (MQ=255) ttCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCGGGT‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCAC‑TCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATAC‑TTCCACACTg > 1:823590/1‑305 (MQ=255) aaaTCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑GAAATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCGGGTTTTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAGTT‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCGAAAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAgg > 1:823592/1‑177 (MQ=255) cgaatacactcaacggtgccaaaggcccttctgctgcaaaacgtaatcgctctgtaagatacgtcaagcaaagaattcaaacccgcttaatcagcggTT‑‑GTTGG‑TC‑TTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑‑AAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGA‑CCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGTAAACAAAAACACCACTTCTg < 1:86836‑M2/139‑1 (MQ=255) aCGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGGT‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACtt > 1:823594/1‑226 (MQ=255) aCGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGGT‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGAcc > 1:823593/1‑257 (MQ=255) aaatcactaacggtgccaaaggcccttctgctgcaaacgtaatcgctctgtaagatacgtcagcaagaattcaaaacccgcttaatcagcggtTT‑‑TTTGG‑TCttt < 1:823588‑M2/12‑1 (MQ=255) ccaaaggcccttctgctgcaaacgtaatcgctctgtaagatacgtcagcaagaattcaaacccgcttaatcagcggTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑aa < 1:823589‑M2/85‑1 (MQ=255) tgctgc‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGG‑‑‑TT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTAGT‑T‑‑GTGCGGTTGATGGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGaa > 1:86842/1‑143 (MQ=255) tctgtaagatacgtcagcaagaattcaaaacccgcttaatcagcgTG‑‑TTT‑G‑TC‑TTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AAC‑AAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATCAAATGTTCGTCATc < 1:86840‑M2/226‑1 (MQ=255) tCAGCAACG‑AATTCAAAA‑CCGCTTAATCAGCGGT‑‑TTG‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGtt < 1:823600/128‑1 (MQ=255) taagatacgtcagcaagaattcaaaccgcttaatcagcgTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCGAAAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATC‑AATGTTCGTCATCctgct < 1:823595‑M2/230‑1 (MQ=255) agatacgtcagcaagaattcaaacccgcttaatcagcggTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGAc < 1:823597‑M2/82‑1 (MQ=255) agatacgtcagcaagaattcaaacccgcttaatcagcggTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AAC‑AAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTgag < 1:823596‑M2/154‑1 (MQ=255) gatacgtcagtcaacgattcaaaccgcttaatcagcggTTTGTTTTG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCgg < 1:86843‑M2/185‑1 (MQ=255) acgtcagcaagaattcaaaacccgcttaatcagcgtTT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCa < 1:823598‑M2/57‑1 (MQ=255) gcaagaattcaaaccgcttaatcagcggTT‑‑GTT‑G‑TC‑TTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACGA‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCcac < 1:86845‑M2/202‑1 (MQ=255) gaattcaaacccgcttaatcagcgtGT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AAC‑AAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATC‑AATGTTCGTCATCCTGCTGAACCATGc < 1:823599‑M2/238‑1 (MQ=255) ttcaaaacccgcttaatcagcgTG‑‑TTTGG‑TC‑TTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAAGACCCCAGAA‑GTTGACGA‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AAC‑AAAACACCACTTCTGCCGAAAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATC‑AATGTTCGTCATCCTGCTGAACCATGCGAATCCTATTCCTATGATGAATGCCCCAATCAGGTTTGCTGTCAGCGTcccc < 1:86844‑M2/290‑1 (MQ=255) cGCTTAATCAGCGGT‑‑TTTGTT‑‑TTTGGTTCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATc < 1:823602/231‑1 (MQ=255) | GCATTTGTGTCTATTTTTCATGTAAAGGTAATTTTGATGTCTAAGATTAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAATGAGTCCAAAGGATTCGGTTTCATTACTCCGGAAGACGGCAGC‑AAAGACGTG‑TTCGTACAC‑TTCTCTGCAATCCAGACTAATGG‑TTTT‑AAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCC‑AAAGG‑CCCTTCTGCTGC‑AAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAA‑G‑AATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGG‑‑TTT‑TT‑‑TTTGG‑TCTTTAG‑T‑‑GTGCGGTTGA‑GGCCG‑AAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGC‑AAAAGACCCCAGAAGGTTGACG‑‑‑AAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGT‑AACAAAAACACCACTTCTGCCG‑AAAATGTTGAGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATC‑AATGTTCGTCATCCTGCTGAACCATGCGAATCCTATTCCTATGATGAATGCCCCAATCAGGTTTGCTGTCAGCGTCCCC > NC_000913/657256‑657834 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |