| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 890745 | 58 (1.310) | 88 (1.980) | 35/132 | 0.0 | 60.3% | coding (9/258 nt) | grxA | reduced glutaredoxin 1 |
| ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
GCTCAATTTCTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/890679‑890745‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < NC_000913/1050545‑1050478 GCTCAATTTCTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGG < 1:965609/68‑1GCTCAATTTCTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGG < 1:1619409/68‑1 CTCAATTTCTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGG < 1:555531/68‑1 ATTTCTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCGACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAAT > 1:2077618/1‑68 TTCTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGA < 1:273536/68‑1 TTCTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGA < 1:3378839/68‑1 CTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACT < 1:282956/68‑1 CTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACT < 1:1161222/68‑1 GCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAA < 1:1278099/68‑1 CAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACT < 1:1433577/68‑1 GATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTA < 1:1347046/68‑1 CTTTTGTACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTG > 1:2143575/1‑68 CTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTG < 1:931607/68‑1 CTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTG > 1:1710367/1‑68 CTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGAACAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTG > 1:2794794/1‑68 TGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 1:535730/1‑68 GCACGCACACAGTAAGGGCATCCGGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:790368/68‑1 CACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGTGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:1611806/68‑1 CACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:3520310/68‑1 ACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 1:2426642/68‑1 ACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 1:1229888/68‑1 GCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:569115/68‑1 cagAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:3154797/65‑1 CACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:1434059/68‑1 ACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:3247795/1‑68 ACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGATAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:2797961/1‑68 CAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:124872/68‑1 AGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT > 1:9476/1‑68 AGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT > 1:3343819/1‑68 AGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:763184/68‑1 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AGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:2209559/68‑1 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTCATGACTCCCACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:1958311/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCATATA > 1:2608000/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:3354598/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:313869/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:1567862/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:3159442/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:735574/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:82232/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:607186/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:3561992/1‑68 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GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:2340359/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:1204568/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:219250/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:283616/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:2909671/1‑68 GGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATAGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:2550023/1‑68 CAACCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:930768/68‑1 CCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:641174/68‑1 CCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:2822284/68‑1 CCCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:421213/68‑1 CCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCa > 1:2408270/1‑67 CCGAACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > 1:3482811/1‑68 ACGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 1:1824124/68‑1 CGACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 1:2537895/1‑68 GACCAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:3362296/68‑1 CAAAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 1:1874665/68‑1 AAAATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT < 1:1362947/68‑1 ATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCGGA‑GGCTTTGGCATG > 1:2081601/1‑68 ATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 1:3074735/68‑1 ATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 1:867004/68‑1 ATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT > 1:1969459/1‑68 ATAACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 1:1837935/68‑1 ACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA < 1:2926664/68‑1 ACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA < 1:755500/68‑1 ACGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA < 1:108732/68‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGC < 1:2817473/68‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGC < 1:107757/68‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < 1:422652/68‑1 GCTCAATTTCTCAGCCAGATCTTTTGCACGCACACAGTAAGGGCAACCCGAACGACCAAAAATAACGg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/890679‑890745‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < NC_000913/1050545‑1050478 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |