| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpX/Lon protease |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 15387 = | NA (NA) | 76 (1.470) | 29/120 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpX/Lon protease | |||||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 57 (1.080) | 24/122 | 0.3 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpX/Lon protease |
| ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/15454‑15387‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaTGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCT < NC_000913/458795‑458733 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:1724978/65‑1AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:406320/1‑65AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:3758443/65‑1AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAACTTAGCGCTTATG < 1:2686814/65‑1AGTAATTCATCGGCACATTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:1664323/1‑65 GTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG > 1:118011/1‑65 GTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG > 1:1188352/1‑65 GTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG > 1:668020/1‑65 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GCTTATGGGATGGTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAA > 1:2668225/1‑65 ATGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCC < 1:194596/65‑1 TGGGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCC > 1:2293957/1‑65 GGATGTTTCCCCCGCATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCC < 1:739347/65‑1 GGATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCC < 1:1366208/65‑1 GATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCT > 1:1453126/1‑65 GATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCT > 1:1198969/1‑65 GATGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCT < 1:3560945/65‑1 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/15454‑15387‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaTGTTTCCCCCACATTCAACGCCGAGAATAGAGGAAAAATTAAAGGGGAGATAAAATCCCCCCT < NC_000913/458795‑458733 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |