| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpX/Lon protease |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 15387 = | NA (NA) | 76 (1.470) | 29/120 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpX/Lon protease | |||||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 57 (1.080) | 24/122 | 0.3 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpX/Lon protease |
| ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGA > NC_000913/458727‑458853 | ccAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGa > 1:3841782/1‑65 (MQ=255)ccAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGa < 1:1594375/65‑1 (MQ=255) cgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACa > 1:620902‑M1/60‑65 (MQ=255) aaaGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACa < 1:1092772/65‑1 (MQ=255) aaaGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACa < 1:2539411/65‑1 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATc < 1:2916257‑M1/8‑1 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATc > 1:3457721‑M1/58‑65 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATc > 1:3160084‑M1/58‑65 (MQ=255) aGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtc < 1:3560945‑M2/65‑3 (MQ=255) aGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtc > 1:1453126‑M2/1‑63 (MQ=255) aGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtc < 1:1225842‑M2/65‑3 (MQ=255) ggggggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGCGGGGGAAACAtcc < 1:739347‑M2/65‑4 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttgagttagcgcttatgggGAAACATccc > 1:4102220‑M1/56‑65 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATccc > 1:3997336‑M1/56‑65 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATccc > 1:1253585‑M1/56‑65 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATccc > 1:3777364‑M1/56‑65 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATccc > 1:567509‑M1/56‑65 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATccc > 1:219338‑M1/56‑65 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaaggtagcgcttatgggGAAACATccc > 1:3780083‑M1/56‑65 (MQ=255) ggggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtccca > 1:2293957‑M2/1‑60 (MQ=255) gggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccat < 1:194596‑M2/65‑7 (MQ=255) cgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCccact < 1:151057‑M1/14‑3 (MQ=255) gaggcgtcgcattcttcagatggttcgacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCatat < 1:1758700‑M1/15‑1 (MQ=255) gaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCatat > 1:1178048‑M1/51‑65 (MQ=255) ttttATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGGGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagc < 1:3343829‑M2/65‑11 (MQ=255) ttttATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGGAACAtcccataagc > 1:1630960‑M2/1‑55 (MQ=255) ttttATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAACCAtcccataagc > 1:2668225‑M2/1‑55 (MQ=255) ttttATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagc < 1:607928‑M2/65‑11 (MQ=255) gcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACt > 1:866506‑M1/48‑65 (MQ=255) tctcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaa > 1:112909‑M2/1‑50 (MQ=255) tctcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaa < 1:3096825‑M2/65‑16 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGAc > 1:1049700‑M1/45‑65 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGAc > 1:1536497‑M1/45‑65 (MQ=255) tcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:2610864‑M2/1‑48 (MQ=255) tcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:518442‑M2/1‑48 (MQ=255) tcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:2084618‑M2/1‑48 (MQ=255) tcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:739835‑M2/1‑48 (MQ=255) tcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:769526‑M2/1‑48 (MQ=255) tcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:1851826‑M2/1‑48 (MQ=255) tcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:3978140‑M2/1‑48 (MQ=255) tcCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:134309‑M2/1‑48 (MQ=255) tcCCCTTTAATTTTTCCTCTAGTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:3889220‑M2/1‑48 (MQ=255) tcCACTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaact > 1:3075235‑M2/1‑48 (MQ=255) ttcttcagatggttcaacccttangttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACa > 1:3420579‑M1/40‑65 (MQ=255) ttcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACa > 1:2546063‑M1/40‑65 (MQ=255) tcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACAt < 1:1125289‑M1/27‑1 (MQ=255) tttAATGTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagg > 1:3300539‑M2/1‑43 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATg > 1:3740892‑M1/38‑65 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATg > 1:3633938‑M1/38‑65 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATg > 1:4310338‑M1/38‑65 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATg > 1:4076187‑M1/38‑65 (MQ=255) ttAATTGTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaaggg > 1:451906‑M2/1‑42 (MQ=255) tcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATgtg > 1:4257035‑M1/36‑64 (MQ=255) tAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggt > 1:4164335‑M2/1‑41 (MQ=255) tAATTTTTCCTCGATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggt > 1:1384447‑M2/1‑41 (MQ=255) tttttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgt < 1:4418721‑M2/65‑28 (MQ=255) tttttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgt > 1:1987799‑M2/1‑38 (MQ=255) tttttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgt > 1:801156‑M2/1‑38 (MQ=255) tttttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgt > 1:1568749‑M2/1‑38 (MQ=255) tttttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgt > 1:1167341‑M2/1‑38 (MQ=255) ttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:3729195‑M2/1‑35 (MQ=255) ttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:558510‑M2/1‑35 (MQ=255) ttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:3616016‑M2/1‑35 (MQ=255) ttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:4230063‑M2/1‑35 (MQ=255) ttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:3004801‑M2/1‑35 (MQ=255) ttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:701321‑M2/1‑35 (MQ=255) ttCCCCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:2661032‑M2/1‑35 (MQ=255) tgcctcTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:1270205‑M2/3‑35 (MQ=255) tCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggta > 1:3685128‑M2/1‑34 (MQ=255) tCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggta > 1:2897790‑M2/1‑34 (MQ=255) tATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacg > 1:2275271‑M2/1‑29 (MQ=255) aTTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgc > 1:944474‑M2/1‑28 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGa < 1:2060449‑M1/44‑1 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGa < 1:1581004‑M1/44‑1 (MQ=255) tctcGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcct < 1:306467‑M2/65‑40 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGaa > 1:4072202‑M1/21‑65 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGaa > 1:1065176‑M1/21‑65 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGaa > 1:147083‑M1/21‑65 (MQ=255) ctcGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctg > 1:2104743‑M2/1‑25 (MQ=255) 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gTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga > 1:2337652‑M2/1‑19 (MQ=255) gTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga > 1:1752147‑M2/1‑19 (MQ=255) gTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga > 1:3268‑M2/1‑19 (MQ=255) gTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga > 1:3849760‑M2/1‑19 (MQ=255) gcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCg > 1:1861519‑M1/12‑65 (MQ=255) gcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCgtg < 1:4174847‑M1/56‑1 (MQ=255) gggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCt > 1:2217065‑M1/4‑65 (MQ=255) gggAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgcc > 1:229339‑M2/1‑8 (MQ=255) ggAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccg < 1:2643157‑M2/65‑59 (MQ=255) gGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGa > 1:2777738‑M1/2‑65 (MQ=255) gGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGa > 1:757127‑M1/2‑65 (MQ=255) | CCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGA > NC_000913/458727‑458853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |