| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,581,699 | (19-bp)2→1 | intergenic (+60/+17) | tktB → / ← ypfG | transketolase 2/DUF1176 domain‑containing protein YpfG |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2581699 | 2581717 | 19 | 31 [0] | [0] 31 | tktB/ypfG | transketolase 2/DUF1176 domain‑containing protein YpfG |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2581698 | NA (NA) | 27 (0.430) | 23/238 | 1.2 | NA | noncoding (36/36 nt) | other | REP179b |
| ? | NC_000913 | 2581718 = | NA (NA) | intergenic (+79/+16) | tktB/ypfG | transketolase 2/DUF1176 domain‑containing protein YpfG | |||||
TCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGT > NC_000913/2581566‑2581831 | tCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccg > 2:552753‑M1/1‑133 (MQ=255) ggttttaccGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgttt < 1:625651‑M1/137‑19 (MQ=255) ttACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacg > 2:667074‑M1/1‑118 (MQ=255) agaATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTACCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatcca < 2:1097523‑M1/140‑32 (MQ=255) tatTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaac < 1:535219‑M1/140‑36 (MQ=255) atTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacg < 1:673302‑M1/140‑37 (MQ=255) ggCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggc > 1:644217‑M1/1‑99 (MQ=255) gCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggcc > 2:552211‑M1/1‑98 (MQ=255) cAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggcca > 1:1104711‑M1/1‑97 (MQ=255) cAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggcca > 1:264940‑M1/1‑97 (MQ=255) cAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggcca > 2:928297‑M1/1‑97 (MQ=255) cAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggcca > 1:1209323‑M1/1‑97 (MQ=255) aaaaagCGCATAGGGTCCTGGGAGTGAGGGGTGCCTGGTGGTGATTGCCGGATGTGGATTGCCGGATGGGGCGCGGACGCGTCTTATCCGGCTTACAtggcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggcca < 2:398455‑M1/139‑44 (MQ=255) gCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgc < 2:80894‑M1/140‑60 (MQ=255) gTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttat > 2:614897‑M1/1‑74 (MQ=255) gTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttat < 2:1209323‑M1/140‑67 (MQ=255) gTGCCTGATGGTGATTGCGGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggt < 2:16484‑M1/140‑74 (MQ=255) ccTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtccctccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtggg > 1:1205142‑M1/1‑64 (MQ=255) gATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttc > 2:702644‑M1/1‑61 (MQ=255) aTGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttct > 1:287239‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctg < 1:614897‑M1/140‑82 (MQ=255) gTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtttcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcg < 2:451827‑M1/140‑84 (MQ=255) gTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcg < 1:79094‑M1/140‑84 (MQ=255) atgcGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcggcgtaacgcaccaggcgaaaacgct > 1:940212‑M1/1‑32 (MQ=255) gcGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtccctccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcggcgtaacgcaccaggcgaaaacgctga < 2:1205142‑M1/140‑111 (MQ=255) aCGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcggcgtaacgcaccaggcgaaaacgctgaccg > 2:383321‑M1/1‑27 (MQ=255) aCGCGTCTTATCCGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcggcgtaacgcaccaggcgaaaacgctgaccgtcaaag > 1:185521‑M1/1‑21 (MQ=255) cGGCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcggcgtaacgcaccaggcgaaaacgctgaccgtcaaagcgccagcgcgcc > 2:679378‑M1/1‑9 (MQ=255) gCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcggcgtaacgcaccaggcgaaaacgctgaccgtcaaagcgccagcgcgcctg > 2:1180106‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcggcgtaacgcaccaggcgaaaacgctgaccgtcaaagcgccagcgcgcctg > 2:568033‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCTACAtgtcccgccattttgtttaacgggtgatccacaacgtgggccaggcgtctggcccatgccagttatcgcaggtgggttctgcggcgtaacgcaccaggcgaaaacgctgaccgtcaaagcgccagcgcgcctg < 1:667074‑M1/140‑134 (MQ=255) | TCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGT > NC_000913/2581566‑2581831 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |