Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 2,581,699 | (19-bp)2→1 | intergenic (+60/+17) | tktB → / ← ypfG | transketolase 2/DUF1176 domain‑containing protein YpfG |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2581699 | 2581717 | 19 | 31 [0] | [0] 31 | tktB/ypfG | transketolase 2/DUF1176 domain‑containing protein YpfG |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2581698 | NA (NA) | 27 (0.430) | 23/238 | 1.2 | NA | noncoding (36/36 nt) | other | REP179b |
? | NC_000913 | 2581718 = | NA (NA) | intergenic (+79/+16) | tktB/ypfG | transketolase 2/DUF1176 domain‑containing protein YpfG |
CGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTG > NC_000913/2581585‑2581850 | tcccgttctttggctttaccgccgagaatattgtggcaaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCg > 2:552753‑M2/134‑140 (MQ=255) ggttttaccgccgagaatattgtggcaaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGttt < 1:625651‑M2/18‑1 (MQ=255) ttaccgccgagaatattgtggcaaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACg > 2:667074‑M2/119‑140 (MQ=255) agaatattgtggcaaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttacccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCca < 2:1097523‑M2/31‑1 (MQ=255) tattgtggcaaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAAc < 1:535219‑M2/35‑1 (MQ=255) attgtggcaaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACg < 1:673302‑M2/36‑1 (MQ=255) ggcaaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGc > 1:644217‑M2/100‑140 (MQ=255) gcaaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGcc > 2:552211‑M2/99‑140 (MQ=255) caaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCa > 1:1104711‑M2/98‑140 (MQ=255) caaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCa > 1:264940‑M2/98‑140 (MQ=255) caaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCa > 2:928297‑M2/98‑140 (MQ=255) caaaagcgcataaggtgctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCa > 1:1209323‑M2/98‑140 (MQ=255) aaaaagcgcatagggtcctgggagtgaggggtgcctggtggtgattgccggatgtggattgccggatggggcgcggacgcgtcttatccggcttacaTGGCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCa < 2:398455‑M2/43‑1 (MQ=255) gctgggagtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGc < 2:80894‑M2/59‑1 (MQ=255) gtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTAt > 2:614897‑M2/75‑140 (MQ=255) gtgaaaggtgcctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTAt < 2:1209323‑M2/66‑1 (MQ=255) gtgcctgatggtgattgcgggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGt < 2:16484‑M2/73‑1 (MQ=255) cctgatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCTCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTggg > 1:1205142‑M2/65‑140 (MQ=255) gatggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTc > 2:702644‑M2/62‑140 (MQ=255) atggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCt > 1:287239‑M2/61‑140 (MQ=255) tggtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTg < 1:614897‑M2/81‑1 (MQ=255) gtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTTTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTgcg < 2:451827‑M2/83‑1 (MQ=255) gtgattgccggatgctgattgccggatgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTgcg < 1:79094‑M2/83‑1 (MQ=255) atgcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCt > 1:940212‑M2/33‑140 (MQ=255) gcgacgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCTCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGa < 2:1205142‑M2/110‑1 (MQ=255) acgctgacgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCg > 2:383321‑M2/28‑140 (MQ=255) acgcgtcttatccggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAg > 1:185521‑M2/22‑140 (MQ=255) cggcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGcc > 2:679378‑M2/10‑140 (MQ=255) gcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTg > 2:1180106‑M2/8‑140 (MQ=255) gcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTg > 2:568033‑M2/8‑140 (MQ=255) gcctacaTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTg < 1:667074‑M2/133‑1 (MQ=255) | CGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTG > NC_000913/2581585‑2581850 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |