| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1555804 = | 88 (0.820) | 115 (1.070) | 55/276 | 0.5 | 49.1% | intergenic (‑135/+22) | maeA/sra | malate dehydrogenase, NAD‑requiring/30S ribosomal subunit protein S22 |
| ? | NC_000913 | = 1556015 | 150 (1.390) | intergenic (‑52/+50) | sra/bdm | 30S ribosomal subunit protein S22/biofilm‑dependent modulation protein | |||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
CATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGT > NC_000913/1555667‑1555943 | tgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaAtt > 2:1129260‑M1/138‑140 (MQ=255) caccttcggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAg < 2:1357770‑M1/6‑1 (MQ=255) actcactcTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGAc > 2:1548376/1‑140 (MQ=255) ttcggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACt > 2:1223735‑M1/131‑140 (MQ=255) ctcactcTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACt > 2:554385/1‑140 (MQ=255) tcactcTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTg < 2:538986/140‑1 (MQ=255) cggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGa > 1:1492090‑M1/129‑140 (MQ=255) cactcTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGa < 1:828719/140‑1 (MQ=255) gtaactattttgcgctggttagaaattttatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATg < 1:1070433‑M1/14‑1 (MQ=255) ttttttGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGtt > 1:900029/1‑140 (MQ=255) actattttgcgctggttagaaattttatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGtt > 1:1715752‑M1/124‑140 (MQ=255) ctattttgcgctggttagaaattttatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTa > 1:249010‑M1/123‑140 (MQ=255) ttGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGa > 2:1696967/1‑140 (MQ=255) gcgctggttagaaattttatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTa < 2:296306‑M1/25‑1 (MQ=255) atatCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTa > 2:594976/1‑140 (MQ=255) atccatccCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACt > 2:44984/1‑140 (MQ=255) ccatccCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACttt > 1:103099/1‑140 (MQ=255) gttagaaattttatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagatagtttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCa < 2:221491‑M1/32‑1 (MQ=255) aattttatgttccagtccaagaatatgccgtgcgtgacggttctcattcattttaactcctcaatcatgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCggg > 2:103099‑M1/104‑140 (MQ=255) tatggtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGtt < 2:1243048‑M1/42‑1 (MQ=255) gtccagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCt < 1:1255154‑M1/46‑1 (MQ=255) cagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGcc < 2:6179‑M1/49‑1 (MQ=255) cagtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGcc < 2:863742‑M1/49‑1 (MQ=255) gtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCgg > 2:1827092‑M1/90‑140 (MQ=255) gtccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCgg > 2:358740‑M1/90‑140 (MQ=255) gTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCgg < 1:594976/140‑1 (MQ=255) gTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCgg < 1:1054858/140‑1 (MQ=255) ccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGtt > 1:863742‑M1/88‑140 (MQ=255) ccaagaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGtt > 2:224790‑M1/88‑140 (MQ=255) cTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGtt < 1:1136316/140‑1 (MQ=255) tGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTggg < 1:1366149/140‑1 (MQ=255) tGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTggg > 2:1308123/1‑140 (MQ=255) agaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTggg > 1:281647‑M1/85‑140 (MQ=255) agaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTggg > 2:1459450‑M1/85‑140 (MQ=255) gaatatgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGt > 2:492822‑M1/84‑140 (MQ=255) tgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTAttt < 1:235476‑M1/62‑1 (MQ=255) tgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTAttt < 1:1106037‑M1/62‑1 (MQ=255) tgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTAttt < 1:8844‑M1/62‑1 (MQ=255) tgacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTAttt < 1:1528791‑M1/62‑1 (MQ=255) tgacgtgcctgacggtgcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTAttt < 2:1152343‑M1/62‑1 (MQ=255) gacgtgcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTta > 1:1699119‑M1/78‑140 (MQ=255) ccGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTta < 1:48591/140‑1 (MQ=255) gcctgacggttcgatttcattttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATCAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGtt < 1:38814‑M1/53‑1 (MQ=255) atggCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACg < 2:1574015/138‑1 (MQ=255) tttttaatttaaaccctcaaatctgtagctagttttaaggacaacatcgccggagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAAT‑ACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCAcc > 2:185359‑M1/60‑140 (MQ=255) cAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCt < 1:1215625/129‑1 (MQ=255) tataAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTc < 1:1235885/140‑1 (MQ=255) ttttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtatcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGGTATTTACTAAGATGGATTTGTCACCTTCgg < 2:173423‑M1/87‑1 (MQ=255) tttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGt > 1:173423‑M1/53‑140 (MQ=255) tttaactcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGt > 2:787767‑M1/53‑140 (MQ=255) aaaGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGt > 2:511981/1‑140 (MQ=255) aaGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTa < 1:1620273/140‑1 (MQ=255) aGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTaa < 1:210368/140‑1 (MQ=255) cAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACt > 2:1119168/1‑140 (MQ=255) cAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACt > 1:517624/1‑140 (MQ=255) actcctcaatcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACt < 2:1060678‑M1/92‑1 (MQ=255) gATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTAt > 1:1305258/1‑140 (MQ=255) atcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTgcg > 2:1271925‑M1/41‑140 (MQ=255) atcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTgcg > 1:1673974‑M1/41‑140 (MQ=255) atcctgtagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTgcg > 1:6179‑M1/41‑140 (MQ=255) aacaaaaacaCCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTTCTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTgcg < 1:1355977/140‑1 (MQ=255) aacaaaaacaCCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTgcg < 1:1548718/140‑1 (MQ=255) aacaaaaacaCCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTgcg > 1:1480760/1‑140 (MQ=255) aaacaCCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTgcg < 1:549660/135‑1 (MQ=255) tagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTgcg > 2:1181009‑M1/35‑134 (MQ=255) tagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTgcg < 1:1181009‑M1/100‑1 (MQ=255) tagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGtt < 2:1630758‑M1/106‑1 (MQ=255) tagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGtt < 2:1020124‑M1/106‑1 (MQ=255) tagctagttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCATTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGtt < 2:401932‑M1/106‑1 (MQ=255) acCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGa < 1:558829/140‑1 (MQ=255) cATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGaaa < 2:656097/140‑1 (MQ=255) cATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGaaa < 1:344228/140‑1 (MQ=255) agttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGaaa < 1:797878‑M1/111‑1 (MQ=255) agttttaaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGaaa < 1:685313‑M1/111‑1 (MQ=255) ttGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAAtt < 2:879233/140‑1 (MQ=255) aaggacaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTAt < 1:78005‑M1/117‑1 (MQ=255) cAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATg > 2:1466098/1‑140 (MQ=255) ggCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgt > 2:1657391/1‑140 (MQ=255) gCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtc < 1:1657391/140‑1 (MQ=255) gCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtc < 2:1105726/140‑1 (MQ=255) acaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtc > 1:221548‑M1/20‑140 (MQ=255) acaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtc > 1:407305‑M1/20‑140 (MQ=255) acaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtc > 2:1528791‑M1/20‑140 (MQ=255) acaacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtc > 1:1460112‑M1/20‑140 (MQ=255) aacatcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtcca < 1:1762349‑M1/123‑1 (MQ=255) atcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtccagtc > 2:699963‑M1/15‑140 (MQ=255) atcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtccagtc > 1:1152343‑M1/15‑140 (MQ=255) tcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTGCTGCGCTGGATGTGTCTAATACGCTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtccagtcc > 2:439108‑M1/14‑140 (MQ=255) tcgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtccagtcc > 2:8844‑M1/14‑140 (MQ=255) cgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtccagtcca > 2:800004‑M1/13‑140 (MQ=255) cgccgtagcgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtccagtcca > 1:1224337‑M1/13‑140 (MQ=255) gtTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCaa < 2:900029/140‑1 (MQ=255) ttAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCAGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGa > 2:528926/1‑140 (MQ=255) aaTCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAat > 2:25653/1‑140 (MQ=255) cgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATg > 2:235476‑M1/5‑140 (MQ=255) cgaaATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATg > 2:78005‑M1/5‑140 (MQ=255) tCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtccagtcc > 1:497387/1‑129 (MQ=255) tCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtccagtc < 1:1381013/128‑1 (MQ=255) tCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGgtccagtc > 2:1381013/1‑128 (MQ=255) aTTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCGAAGAATATGACGt > 2:1715752/1‑140 (MQ=255) | CATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGT > NC_000913/1555667‑1555943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |