| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1555804 = | 88 (0.820) | 115 (1.070) | 55/276 | 0.5 | 49.1% | intergenic (‑135/+22) | maeA/sra | malate dehydrogenase, NAD‑requiring/30S ribosomal subunit protein S22 |
| ? | NC_000913 | = 1556015 | 150 (1.390) | intergenic (‑52/+50) | sra/bdm | 30S ribosomal subunit protein S22/biofilm‑dependent modulation protein | |||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
ATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATGTCGTTATCAGAAGCTTCAACCC > NC_000913/1555876‑1556153 | aTTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCgaa > 1:1766385/1‑140 (MQ=255) gTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGaaa > 1:1446382/1‑140 (MQ=255) cACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGGTTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAaca < 2:1762349/140‑1 (MQ=255) ccTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgagga > 2:871771‑M2/1‑132 (MQ=255) ccTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgagga > 2:112327‑M2/1‑132 (MQ=255) cTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGt > 2:508365/1‑140 (MQ=255) ttCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTg > 1:67125/1‑140 (MQ=255) ttCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTg < 1:1267186/140‑1 (MQ=255) tCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGCCGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCATGTAGCTAGTTTTAAGGACAGCATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGc > 2:548321/1‑140 (MQ=255) tCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgaggactg < 1:1827092‑M2/140‑12 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1:1715752‑M2/1‑123 (MQ=255) cTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggtta > 1:249010‑M2/1‑122 (MQ=255) gcgcTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaatta < 2:296306‑M2/140‑26 (MQ=255) gcgcTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAAtt < 2:207399/140‑1 (MQ=255) ggTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGtt < 1:481382/140‑1 (MQ=255) gTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttc < 1:492822‑M2/140‑32 (MQ=255) 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tATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCa < 2:1766385/140‑1 (MQ=255) ggTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAg < 2:1163184/140‑1 (MQ=255) agtccaAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACACCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccg < 1:699963‑M2/140‑51 (MQ=255) gtccaAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccgg > 2:358740‑M2/1‑89 (MQ=255) tccaAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTa > 2:155038/1‑140 (MQ=255) tccaAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTa < 1:943781/140‑1 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2:1564716/1‑140 (MQ=255) tAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATc > 2:260112/1‑140 (MQ=255) cTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGa > 2:522910/1‑133 (MQ=255) aGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgagggctgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttactacgctggatttgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaa < 1:1491804‑M2/140‑112 (MQ=255) aGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttactacgctggatttgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaa < 1:797878‑M2/140‑112 (MQ=255) aGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttactacgctggatttgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaa < 2:1224337‑M2/140‑112 (MQ=255) ttttAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAgg > 1:116868/1‑140 (MQ=255) tAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATg < 1:784251/140‑1 (MQ=255) aGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATGTc > 1:411836/1‑140 (MQ=255) acaacaTCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttactacgctggatttgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtc > 2:605701‑M2/1‑19 (MQ=255) acaacaTCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttactacgctggatttgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtc > 1:1696967‑M2/1‑19 (MQ=255) acaacaTCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttactacgctggatttgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtc > 2:1255154‑M2/1‑19 (MQ=255) aacaTCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATGTCGTTAt > 1:194727/1‑140 (MQ=255) aTCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttactacgctggatttgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtccagtc > 2:699963‑M2/1‑14 (MQ=255) tCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttgctgcgctggatgtgtctaatacgctaactattttgcgctggttagaaattttatggtccagtcc > 2:439108‑M2/1‑13 (MQ=255) tCGCCGTAGCGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttactacgctggatttgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtccagtcc > 1:1060678‑M2/1‑13 (MQ=255) cGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATGTCGTTATCAGaa > 2:902442/1‑140 (MQ=255) ccGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATGTCGTTATCAGAAGc < 2:1064356/140‑1 (MQ=255) ccGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATGTCGTTATCAGAAGc > 1:1008234/1‑140 (MQ=255) ccGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATGTCGTTATCAGAAGc > 2:1416698/1‑140 (MQ=255) cGAAattgaggactgatggttatgaattacttttcagcggggcgttttctgccggttgggttatttactacgctggatttgtcaccttcggtaactattttgcgctggttagaaattttatggtccagtccaagaatatg > 2:78005‑M2/1‑4 (MQ=255) cGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATGTCGTTATCAGAAGCTTCAAc > 2:927911/1‑140 (MQ=255) | ATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGACGTGCCTGACGGTTCGATTTCATTTTAACTCCTCAATCCTGTAGCTAGTTTTAAGGACAACATCGCCGTAGCGAAGAAACACGTGCTAAACCCCTAAATTAGGTTGCCGATCAAGCATAGCACCTTAAAGCGTAGGGTGCTGGCCACTGACCACATAATTGATCGTTTGCTGGTAGATATCACTGAGGATGTCGTTATCAGAAGCTTCAACCC > NC_000913/1555876‑1556153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |