| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,583,062 | (AAAT)3→2 | pseudogene (25‑28/390 nt) | yrhA → | putative uncharacterized protein YrhA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3583054 | 3583057 | 4 | 79 [0] | [0] 79 | yrhA | putative uncharacterized protein YrhA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3583058 = | 0 (0.000) | 77 (1.080) | 48/260 | 0.3 | 100% | pseudogene (21/390 nt) | yrhA | putative uncharacterized protein YrhA |
| ? | NC_000913 | = 3583053 | 0 (0.000) | pseudogene (16/390 nt) | yrhA | putative uncharacterized protein YrhA | |||||
TACTAACTTCATTACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3583200‑3583058‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atttatttGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAA < NC_000913/3583053‑3582916 TACTAACTTCATTACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTA > 2:1053144/1‑140 ACTAACTTCATTACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTAT < 2:592907/140‑1 ACTAACTTCATTACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTAT < 2:1101716/140‑1 ACTTCATTACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGG > 1:721139/1‑140 TCATTACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTT > 1:1052299/1‑140 ATTACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGGTTT > 2:797170/1‑140 TACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAG < 1:767890/140‑1 TACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAG > 1:609235/1‑140 ACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGT < 2:250260/140‑1 CATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTC < 1:1011962/140‑1 CATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTC < 2:514480/140‑1 ATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCA > 2:1172696/1‑140 AACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATC > 1:143382/1‑140 TTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATT < 1:1214873/140‑1 CTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTT > 1:900348/1‑140 CTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTT > 2:473423/1‑140 CTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTT > 2:1156550/1‑140 CTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTT > 2:918389/1‑140 CTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTT > 1:2502/1‑140 CAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTG > 2:776334/1‑140 CAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTG < 2:531162/140‑1 GGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTG < 2:609235/140‑1 GGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTG > 1:94773/1‑140 AATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATAATTTTGTG < 2:243176/135‑1 AATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATAATTTTGTG > 1:243176/1‑135 TTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCA > 1:1230965/1‑140 TGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATA < 1:923082/140‑1 ATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATG < 1:797170/140‑1 TTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGA < 2:1230965/140‑1 ATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGC > 1:648320/1‑140 ATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGC < 1:473423/140‑1 TTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCC < 1:1053144/140‑1 TACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGA < 1:1156550/140‑1 TACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGA < 1:1172696/140‑1 ACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGAT > 1:660811/1‑140 TTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGA < 2:356948/140‑1 TTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGA < 2:319945/140‑1 TTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGA < 1:467344/140‑1 TCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAA > 1:1062324/1‑140 TCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAA > 1:689822/1‑140 TCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAA > 1:121656/1‑140 TCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAA > 1:726373/1‑140 TCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAA > 1:130376/1‑140 TCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAA > 1:508677/1‑140 TCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAA > 2:674957/1‑140 CAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAAT > 1:344569/1‑140 ATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCA < 1:534811/140‑1 TTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGA < 2:1013506/140‑1 TTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGA < 1:151539/140‑1 CGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTG > 2:308534/1‑140 GTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCT > 2:1184818/1‑140 TGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTT > 2:386468/1‑140 GCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTT < 2:689822/140‑1 GCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTT < 2:508677/140‑1 CTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTC < 2:1052299/140‑1 TTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCA < 2:143382/140‑1 TTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCA < 1:776334/140‑1 CAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACC < 1:308534/140‑1 CAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACC < 1:644140/140‑1 CAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACC < 2:900348/140‑1 AATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTA < 1:674957/140‑1 AATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTA < 1:144649/140‑1 AATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTA < 2:721139/140‑1 AGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATAT > 2:111807/1‑140 AGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATAT < 2:121656/140‑1 GTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGATTTCACCTACTAATATT > 1:369371/1‑140 ATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTA > 2:775082/1‑140 ATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTA > 2:768607/1‑140 ATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCC > 2:376089/1‑137 ATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCC < 1:376089/137‑1 TCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTAT > 2:964425/1‑140 TCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTAT > 2:559861/1‑140 TCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTAT > 1:537231/1‑140 TCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTAT < 1:559861/140‑1 TCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTAT > 1:560169/1‑140 TCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTAT > 2:227496/1‑140 TCATCATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTCTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTAT < 1:1184818/140‑1 CATTTTTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGT < 2:1062324/140‑1 TTATTAATTTATTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTG > 2:693347/1‑140 TAATTTATTTGGGTTTTAGTCATTATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATG < 2:648320/140‑1 TTTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAA > 2:393703/1‑140 TTGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAA < 2:744967/140‑1 TACTAACTTCATTACATAACTTCTCCAGGCAATTAGTTGAATTAGAATTAAATTCTATTTGGATTATACTTTCAATAAATGATTCCTTGAGCGGTGCTTCAAATGGATAGTCTAAATCATTCATCATTTTTATTAATTTATTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3583200‑3583058‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atttatttGGGTTTTAGTCATCATTTTGTGTGGTCCATAATATTTTTCATGGGAGGATAAATTGAGCCAGATGGAATGGCCCAGGGAGTGATTTTGCTTTCACCTACTAATATTCCCTTAGCTATTCGTGATTGCATGTTAGTAAA < NC_000913/3583053‑3582916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |