| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,583,062 | (AAAT)3→2 | pseudogene (25‑28/390 nt) | yrhA → | putative uncharacterized protein YrhA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3583054 | 3583057 | 4 | 79 [0] | [0] 79 | yrhA | putative uncharacterized protein YrhA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3583058 = | 0 (0.000) | 77 (1.080) | 48/260 | 0.3 | 100% | pseudogene (21/390 nt) | yrhA | putative uncharacterized protein YrhA |
| ? | NC_000913 | = 3583053 | 0 (0.000) | pseudogene (16/390 nt) | yrhA | putative uncharacterized protein YrhA | |||||
CTAACATGCAATCACGAATAGCTAAGGGAATATTAGTAGGTGAAAGCAAAATCACTCCCTGGGCCATTCCATCTGGCTCAATTTATCCTCCCATGAAAAATATTATGGACCACACAAAATGATGACTAAAACCCAAATAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGGAGAAGTTATGTAATGAAGT > NC_000913/3582920‑3583195 | tttactaacatgcaatcacgaatagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccaa < 2:744967‑M1/2‑1 (MQ=255) ttactaacatgcaatcacgaatagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccaaa > 2:393703‑M1/138‑140 (MQ=255) catgcaatcacgaatagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaataatgactaaaacccAAATAAATta < 2:648320‑M1/10‑1 (MQ=255) caatcacgaatagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATtaataa > 2:693347‑M1/127‑140 (MQ=255) acgaatagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAatg < 2:1062324‑M1/19‑1 (MQ=255) atagctaagggaatattagtaggtgagagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAAtgatga < 1:1184818‑M1/23‑1 (MQ=255) atagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAAtgatga > 2:964425‑M1/118‑140 (MQ=255) atagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAAtgatga > 1:537231‑M1/118‑140 (MQ=255) atagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAAtgatga < 1:559861‑M1/23‑1 (MQ=255) atagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAAtgatga > 1:560169‑M1/118‑140 (MQ=255) atagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAAtgatga > 2:559861‑M1/118‑140 (MQ=255) atagctaagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAAtgatga > 2:227496‑M1/118‑140 (MQ=255) taagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGAt > 2:768607‑M1/113‑140 (MQ=255) taagggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGAt > 2:775082‑M1/113‑140 (MQ=255) gggaatattagtaggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGAt < 1:376089‑M1/28‑1 (MQ=255) 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2:721139‑M1/42‑1 (MQ=255) taggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCAtt < 1:674957‑M1/42‑1 (MQ=255) ggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTg < 1:644140‑M1/44‑1 (MQ=255) ggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTg < 2:900348‑M1/44‑1 (MQ=255) ggtgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTg < 1:308534‑M1/44‑1 (MQ=255) tgaaagcaaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGaa < 1:776334‑M1/46‑1 (MQ=255) 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2:1184818‑M1/91‑140 (MQ=255) caaaatcactccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCg > 2:308534‑M1/89‑140 (MQ=255) tccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGaa < 2:1013506‑M1/61‑1 (MQ=255) tccctgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGaa < 1:151539‑M1/61‑1 (MQ=255) tgggccattccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCAt < 1:534811‑M1/65‑1 (MQ=255) attccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTg > 1:344569‑M1/70‑140 (MQ=255) 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1:726373‑M1/69‑140 (MQ=255) ttccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGa > 1:689822‑M1/69‑140 (MQ=255) tccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGaa < 1:467344‑M1/73‑1 (MQ=255) tccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGaa < 2:356948‑M1/73‑1 (MQ=255) tccatctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGaa < 2:319945‑M1/73‑1 (MQ=255) atctggctcaatttatcctcccatgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGt > 1:660811‑M1/65‑140 (MQ=255) 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2:1230965‑M1/91‑1 (MQ=255) catgaaaaatattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTtaat < 1:797170‑M1/97‑1 (MQ=255) tattatggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCa < 1:923082‑M1/106‑1 (MQ=255) tggaccacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTaa > 1:1230965‑M1/30‑140 (MQ=255) cacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGcc < 2:609235‑M1/116‑1 (MQ=255) cacacaaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGcc > 1:94773‑M1/25‑140 (MQ=255) 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2:1156550‑M1/20‑140 (MQ=255) aaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGgag > 1:900348‑M1/20‑140 (MQ=255) aaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGgag > 2:918389‑M1/20‑140 (MQ=255) aaaatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGgag > 1:2502‑M1/20‑140 (MQ=255) aatgatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGGAGaa < 1:1214873‑M1/123‑1 (MQ=255) gatgactaaaacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGGAGAAGtt > 1:143382‑M1/15‑140 (MQ=255) 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1:609235‑M1/10‑140 (MQ=255) aaaccccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGGAGAAGTTATGTAAt > 2:797170‑M1/8‑140 (MQ=255) aacccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGGAGAAGTTATGTAATGa > 1:1052299‑M1/6‑140 (MQ=255) ccAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGGAGAAGTTATGTAATGAAGt > 1:721139‑M1/3‑140 (MQ=255) | CTAACATGCAATCACGAATAGCTAAGGGAATATTAGTAGGTGAAAGCAAAATCACTCCCTGGGCCATTCCATCTGGCTCAATTTATCCTCCCATGAAAAATATTATGGACCACACAAAATGATGACTAAAACCCAAATAAATAAATTAATAAAAATGATGAATGATTTAGACTATCCATTTGAAGCACCGCTCAAGGAATCATTTATTGAAAGTATAATCCAAATAGAATTTAATTCTAATTCAACTAATTGCCTGGAGAAGTTATGTAATGAAGT > NC_000913/3582920‑3583195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |