New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2481751 = | 63 (0.620) | 49 (0.490) | 28/270 | 1.8 | 36.1% | coding (426/1539 nt) | emrY | tripartite efflux pump membrane subunit EmrY |
? | NC_000913 | = 2481901 | 112 (1.130) | coding (276/1539 nt) | emrY | tripartite efflux pump membrane subunit EmrY |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ATGTCAGGACGATAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAAT > NC_000913/2481615‑2481886 | aTGTCAGGACGATAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAAt > 1:233136/1‑140 (MQ=255) aTGTCAGGACGATAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAAt > 2:1579588/1‑140 (MQ=255) tGTCAGGACGATAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATg > 2:200519/1‑140 (MQ=255) cAGGACGATAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTc > 1:431407/1‑140 (MQ=255) aGGACGATAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCt > 1:1522106/1‑140 (MQ=255) ggACGATAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCtt > 1:663455/1‑140 (MQ=255) aTAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTc > 1:1710305/1‑140 (MQ=255) aTAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTc > 2:347225/1‑140 (MQ=255) aaTCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTg < 2:451017/140‑1 (MQ=255) aTCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTgg < 1:1154934/140‑1 (MQ=255) cccATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCgg > 1:1244812/1‑140 (MQ=255) cATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGAt < 1:641397/140‑1 (MQ=255) aaaaacctctgtgacagtgaaattaccgcccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGAt > 2:341198‑M1/118‑140 (MQ=255) taaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATaa < 1:729050‑M1/25‑1 (MQ=255) aGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAAt > 2:1482629/1‑140 (MQ=255) aGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAAt > 2:1299527/1‑140 (MQ=255) actctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTc < 1:919578‑M1/28‑1 (MQ=255) tctgtgacagtgaaattaacgcccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCt > 1:971134‑M1/111‑140 (MQ=255) tctgagacagtaaaattaacgcccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCt > 2:1709958‑M1/111‑140 (MQ=255) aCATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCt < 1:379506/140‑1 (MQ=255) aCATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCt < 1:1703056/140‑1 (MQ=255) aCATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCt < 1:347443/140‑1 (MQ=255) aCATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCt < 1:1579588/140‑1 (MQ=255) aCATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCt < 1:663493/140‑1 (MQ=255) aCATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCt < 2:1096303/140‑1 (MQ=255) aCATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCt < 2:507475/140‑1 (MQ=255) tgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTta < 1:1046777‑M1/32‑1 (MQ=255) tgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTta < 1:1469780‑M1/32‑1 (MQ=255) ttGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaa > 1:1514058/1‑140 (MQ=255) gtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTAGCGGATAATTCCTtaa < 2:1333385‑M1/33‑1 (MQ=255) tgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaat > 1:1284307‑M1/107‑140 (MQ=255) aTTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGAt < 2:792440/127‑1 (MQ=255) aTTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGAt > 1:792440/1‑127 (MQ=255) tgaaaatttaccgcccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaataata > 2:663455‑M1/103‑140 (MQ=255) tAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaataata < 1:347225/140‑1 (MQ=255) tAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaataata < 2:85620/140‑1 (MQ=255) tAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaataata < 2:371768/140‑1 (MQ=255) tAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaataata < 2:1514058/140‑1 (MQ=255) tAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaataata < 2:301750/140‑1 (MQ=255) agtagaattaccgcccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaataata > 2:90071‑M1/103‑140 (MQ=255) aaaaaTATCCACCCCCAGTTAAAGTTATCAAAAATATAACCGCCAAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTC‑TTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATaaa < 2:1502215/140‑1 (MQ=255) tggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTta < 2:1490116‑M1/32‑1 (MQ=255) tggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTta > 1:1490116‑M1/101‑132 (MQ=255) tggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATaaa < 1:90071‑M1/40‑1 (MQ=255) tggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATaaa < 1:1709958‑M1/40‑1 (MQ=255) aaaaTATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATaaa > 1:1373222/1‑140 (MQ=255) aaTATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAAct < 2:1244812/140‑1 (MQ=255) taacgcccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCtgt > 2:729050‑M1/95‑140 (MQ=255) tCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCtgt > 1:710882/1‑140 (MQ=255) tCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCtgt < 1:903741/140‑1 (MQ=255) ccgccccagccattaacacctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGa > 2:431407‑M1/93‑140 (MQ=255) cAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGa < 2:777625/140‑1 (MQ=255) cAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGa < 1:941720/140‑1 (MQ=255) gcccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACa > 1:1299527‑M1/91‑140 (MQ=255) aCCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACa < 1:1423806/140‑1 (MQ=255) cAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaataat > 1:1513796/1‑123 (MQ=255) cAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTtaataat < 2:1513796/123‑1 (MQ=255) attaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTa > 1:463635‑M1/82‑140 (MQ=255) tCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGccc > 1:1477553/1‑140 (MQ=255) tgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTTTGGAGGATAATTAATTAATAATAAATTTTGTGCAACCGGAATTAACgacccat < 2:114896‑M1/68‑3 (MQ=255) tgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTGCTGGAGGATAATTACTTCATAATAAACTCTGTGAAACTGGAATTAACGGCCCCg < 2:27441‑M1/68‑1 (MQ=255) aacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGGTCTTATTTCTGGAGGATAATTCCTTAATAATAAATTTGGGCAAAGTGGAATTAACGGGCCAGcc < 2:298852‑M1/70‑1 (MQ=255) ctctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTaa < 1:322024‑M1/75‑1 (MQ=255) ctctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTaa < 1:1383671‑M1/75‑1 (MQ=255) gCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCt > 1:1419087/1‑140 (MQ=255) cccAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTg > 1:135081/1‑140 (MQ=255) ccgcccaacaTATGGGAGCGTTAATCAGGTTCATTGACAATAACCCAAGAGAAATTTTTTTTTTTTCGGGCGAATAATTCTTAAAAAAAAACCTCTGTGACAGGGAAATAACCGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGAct < 2:1373222/133‑1 (MQ=255) cccACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaa > 2:1675315/1‑140 (MQ=255) atcaagattggtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaa < 1:959280‑M1/94‑1 (MQ=255) aaaatatGGGAGAAATAATCCCGTTAATTAACAATAATGCAAGAAAAATTTTTTTTTTTTCTGGCGAATAATCCCTAAAAAATAACCTCTGTGAAAGTGAAATAACCGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaa < 2:1314094/137‑1 (MQ=255) caTATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaaa > 2:1284307/1‑140 (MQ=255) caTATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaaa > 1:1314094/1‑140 (MQ=255) ggAGCAATAATCACGGTCATTGACAATAAGACAAGAGAAAATGTTTTTTTTTCTGGCGTATAATTCCTAAAAAAAAATCTCTGTGAGAGAGAATTAAACGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAg < 2:548063/140‑1 (MQ=255) gtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAatatcctgt < 1:126595‑M1/104‑5 (MQ=255) gtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGca < 1:1419190‑M1/104‑1 (MQ=255) gtcgataggctacacattaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGca < 1:565971‑M1/104‑1 (MQ=255) cGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCCTTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGcaca > 2:463635/1‑140 (MQ=255) gATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACAt > 1:154311/1‑140 (MQ=255) aaaaaTCACGTTCATTAACAAAAATGCCAGAGAAATTTTTTTTTTTTCTGGCGAATATTTCCTAAAAAAAAACCTCTGTGACAGTGAAATAAGCGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACAt < 2:1710305/137‑1 (MQ=255) cACGGTAATTAACAATAATCCCAGACAAATTTTTTTTTTTTCTGGCGAATATTTCTTAAAAAAAAACCTTTGTGACAGTGAAATTACCGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGAt < 2:135081/140‑1 (MQ=255) cGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTg > 1:1535426/1‑140 (MQ=255) attaatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCg < 1:97325‑M1/119‑1 (MQ=255) ttatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGAt < 1:207389‑M1/121‑1 (MQ=255) ttGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGAt > 1:354399/1‑140 (MQ=255) taatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGAt < 1:153764‑M1/121‑1 (MQ=255) taatgaagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGAt < 1:431460‑M1/121‑1 (MQ=255) aagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCt < 1:793206‑M1/126‑1 (MQ=255) aagacagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGAACATCAAGATTGGTCGATAGGCt < 2:1543776‑M1/126‑1 (MQ=255) aTAATGCCAGAAAAATTTTTTTTTTTTCGGGCGAATAATTCCTAAAAAAAAAACTTTGTGAAAGTGAAATAACCGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTa < 2:818933/140‑1 (MQ=255) tAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTac > 1:1397290/1‑140 (MQ=255) acagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTaca < 1:647775‑M1/129‑1 (MQ=255) acagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTaca < 2:368398‑M1/129‑1 (MQ=255) acagcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTaca < 1:325363‑M1/129‑1 (MQ=255) agcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTAcaca < 1:62112‑M1/131‑1 (MQ=255) agcgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTAcaca < 1:1192977‑M1/131‑1 (MQ=255) cgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACAtt < 1:1632947‑M1/133‑1 (MQ=255) cgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACAtt < 1:448803‑M1/133‑1 (MQ=255) cgaaaaaAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACAtt < 2:381041‑M1/133‑1 (MQ=255) gagCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAAt > 1:1617231/1‑140 (MQ=255) gagCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAAt > 2:916635/1‑140 (MQ=255) | ATGTCAGGACGATAATCCCCATAGGGACATTGATTAAAAATATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAAT > NC_000913/2481615‑2481886 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |