New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2481751 = | 63 (0.620) | 49 (0.490) | 28/270 | 1.8 | 36.1% | coding (426/1539 nt) | emrY | tripartite efflux pump membrane subunit EmrY |
? | NC_000913 | = 2481901 | 112 (1.130) | coding (276/1539 nt) | emrY | tripartite efflux pump membrane subunit EmrY |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGATGCTCCCAGAAAGC > NC_000913/2481769‑2482040 | aaTTCCTAAAAAAAAACCTCTGTGACAGTGAAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGaa < 1:679779/140‑1 (MQ=255) taataataaACTCTGTGACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTaaaa > 1:1237235/1‑140 (MQ=255) aataataaACTCTGTGACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTaaaaa > 2:442402/1‑140 (MQ=255) aaaaaCCTCTGTGACAGTGAAATTAC‑CGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggat > 2:341198‑M2/1‑117 (MQ=255) ataaACTCTGTGACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGAACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAaataat < 1:1543776/140‑1 (MQ=255) aCTCTGTGACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattc < 1:919578‑M2/140‑29 (MQ=255) ttctgaaaCAGT‑GAATTAAGCGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTaa < 1:1333385/133‑1 (MQ=255) ctctGAAACAGTGAAATCAA‑CGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTaa < 1:1675315/140‑1 (MQ=255) tctGTGACAGTGAAATTAA‑CGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattcct > 1:971134‑M2/1‑110 (MQ=255) ctGTGACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAtt < 1:916635/140‑1 (MQ=255) tgtgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGGCTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGCTTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTACAAATAATCTTAATTc > 2:479185/1‑140 (MQ=255) tgtgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattcctta < 1:1046777‑M2/140‑33 (MQ=255) tgtgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattcctta < 1:1469780‑M2/140‑33 (MQ=255) tgtgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatggtcttttttctgacgtataattactta < 2:554156‑M2/140‑33 (MQ=255) tgtgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTc > 1:1410943/1‑140 (MQ=255) gtgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctagcggataattccttaa < 2:1333385‑M2/140‑34 (MQ=255) gtgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCg > 1:1171283/1‑140 (MQ=255) tgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaat > 1:1284307‑M2/1‑106 (MQ=255) tgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGc > 2:1617090/1‑140 (MQ=255) tgACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGc > 1:1534928/1‑140 (MQ=255) tgaaaatttac‑cgcccCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataata > 2:663455‑M2/8‑102 (MQ=255) gTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTAtt > 1:1266159/1‑140 (MQ=255) tGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaa < 1:1709958‑M2/140‑41 (MQ=255) tGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaa < 1:90071‑M2/140‑41 (MQ=255) tGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattcctta > 1:1490116‑M2/1‑100 (MQ=255) tGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattcctta < 2:1490116‑M2/132‑33 (MQ=255) tGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTc > 2:1190644/1‑140 (MQ=255) tGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTc > 2:1358792/1‑140 (MQ=255) aaaa‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTtgt < 1:1126775/138‑1 (MQ=255) tAA‑CGCCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgt > 2:729050‑M2/1‑94 (MQ=255) ggCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCaa > 2:223655/1‑140 (MQ=255) cGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGc < 2:1539030/140‑1 (MQ=255) cGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGc < 1:1190644/140‑1 (MQ=255) cGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGc < 2:207389/140‑1 (MQ=255) cccTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAgg < 2:354399/140‑1 (MQ=255) tGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttttggaggataattaattaataataaattttgtgcaaccggaattaacgacccat < 2:114896‑M2/140‑69 (MQ=255) tGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttctttttgctggaggataattacttcataataaactctgtgaaactggaattaacggccccg < 2:27441‑M2/140‑69 (MQ=255) tGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGAt > 2:1346486/1‑140 (MQ=255) tGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGAt > 1:1108476/1‑140 (MQ=255) tGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGAt > 2:446350/1‑140 (MQ=255) tGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGAt > 2:593577/1‑140 (MQ=255) aaCGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatggtcttatttctggaggataattccttaataataaatttgggcaaagtggaattaacgggccagcc < 2:298852‑M2/140‑71 (MQ=255) cGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCa < 2:1632947/140‑1 (MQ=255) ctctAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaa < 1:322024‑M2/140‑76 (MQ=255) ctctAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaa < 1:1383671‑M2/140‑76 (MQ=255) ctctAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATg > 2:763146/1‑140 (MQ=255) ctctAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATg > 2:628497/1‑140 (MQ=255) ctctAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATg > 2:485284/1‑140 (MQ=255) ctctAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGC‑AAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATgg > 2:1391964/1‑140 (MQ=255) ctAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGc < 2:1108476/140‑1 (MQ=255) tAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCa < 1:554156/140‑1 (MQ=255) tatCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTa > 1:1271124/1‑140 (MQ=255) tCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTaca < 2:1434007/140‑1 (MQ=255) gCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAA‑TGACCGTTAGTAAAAATAATAATTATTTAATAATAATTTCTGTCAACCTGCCATTAACAGCGATGCCAATAGCCTTTGCTAGACCaa > 2:94221/1‑140 (MQ=255) aTCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACg < 1:593577/140‑1 (MQ=255) tCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGa < 2:1620402/140‑1 (MQ=255) cAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAg > 2:1005679/1‑140 (MQ=255) ttGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAAc < 2:916987/132‑1 (MQ=255) ttGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGAt > 2:1151091/1‑140 (MQ=255) tGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATa < 1:1346486/140‑1 (MQ=255) tGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATa < 1:446350/140‑1 (MQ=255) tGGTCGATAGGCTACAAATTAATGAAAACAGAAAAAAAaattttttttttttctggcggataattcattaataataacctctgtgacagtgaaattaccgcccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcag > 2:959280‑M2/1‑38 (MQ=255) ggTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATaa > 1:915982/1‑140 (MQ=255) gTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagca < 1:1600770‑M2/140‑105 (MQ=255) gTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAAc > 1:1337675/1‑140 (MQ=255) gTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAAc > 1:1480129/1‑140 (MQ=255) gTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAAc > 2:450766/1‑140 (MQ=255) gTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAAc > 1:653261/1‑140 (MQ=255) gTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAAc > 1:645684/1‑140 (MQ=255) gTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAAc > 1:350989/1‑140 (MQ=255) aTAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAg < 1:763146/140‑1 (MQ=255) cTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGcc < 1:223655/140‑1 (MQ=255) tACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCt > 2:1073828/1‑140 (MQ=255) acacATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCtt > 1:270524/1‑140 (MQ=255) caTTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGt < 1:1151091/140‑1 (MQ=255) aTTAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcg < 1:97325‑M2/140‑120 (MQ=255) aTTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTc < 1:353414/140‑1 (MQ=255) aTTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTc > 2:941216/1‑140 (MQ=255) ttatgAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgat < 1:207389‑M2/138‑122 (MQ=255) tAATGAAGACAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgat < 1:153764‑M2/140‑122 (MQ=255) aaTGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGt > 1:1075030/1‑136 (MQ=255) aaTGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGt < 2:1075030/136‑1 (MQ=255) aaTGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt > 1:141559/1‑140 (MQ=255) aaTGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt > 1:1245649/1‑140 (MQ=255) aaGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGAt > 1:387077/1‑140 (MQ=255) aCAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctaca < 1:325363‑M2/140‑130 (MQ=255) aCAGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctaca < 2:368398‑M2/140‑130 (MQ=255) aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGATGCt < 2:1271124/140‑1 (MQ=255) aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGATGCt < 1:1419483/140‑1 (MQ=255) aCAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGATGCt > 2:1419483/1‑140 (MQ=255) aGCGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacaca < 1:62112‑M2/140‑132 (MQ=255) aGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGcc < 1:551971/122‑1 (MQ=255) aGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGa > 1:741973/1‑134 (MQ=255) cGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacatt < 1:1632947‑M2/140‑134 (MQ=255) cGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacatt < 2:381041‑M2/140‑134 (MQ=255) cGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacatt < 1:448803‑M2/140‑134 (MQ=255) cGAAAAAaaatgttcttttttctggcggataattccttaataataaactctgtgacagtggaattaacggccccgccattaacccctgaacgactctaaaaaatatcagcacatcaagattggtcgataggctacacatt < 1:465329‑M2/140‑134 (MQ=255) cGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGATGCTCCCa > 1:1367593/1‑140 (MQ=255) aaaaGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGATGCTCCCAGAAAGc < 2:793206/140‑1 (MQ=255) aaaaGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGATGCTCCCAGAAAGc < 1:94221/140‑1 (MQ=255) | CGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAA‑CGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGTTGATGCTCCCAGAAAGC > NC_000913/2481769‑2482040 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |