| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3296254 | 211 (1.700) | coding (446/591 nt) | diaA | DnaA initiator‑associating factor for replication initiation | |||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCAACCTCATTCCCGGTGAAGGCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3295866‑3295729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCAGCGCCCGCA < NC_000913/3296254‑3296116 CCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCAACCTCATTCCCGGTGAAGGCTACCTC < 2:573517/140‑1 CGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCAACCTCATTCCCGGTGAAGGCTACCTCGCCG < 1:88511/140‑1 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CCGGTGAAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATG > 2:57265/1‑140 CCGGTGAAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACCGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCCTG > 2:1432658/1‑140 GGTGAAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGAC > 1:2005265/1‑140 GGTGAAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGAC > 2:154873/1‑140 GGTGAAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGAC > 1:194817/1‑140 GAAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCA < 2:1286283/140‑1 GAAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCA < 2:793423/140‑1 AAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACCATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAAAAATACCTCTCCCGCATCACCCAG > 2:1673782/1‑140 AAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCAG > 1:1271347/1‑140 AAGGCTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCAG > 1:2052559/1‑140 CTACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCAGCGCC < 2:1603523/140‑1 ACCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCAGCGCCCG < 1:638260/140‑1 CCTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCAGCGCCCGC > 1:1106369/1‑140 CTCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCAGCGCCCGCA > 1:1251617/1‑140 CCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCAACCTCATTCCCGGTGAAGGCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3295866‑3295729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCGCCGCCGTCATAGCCGGTCAATGCCACAATGGTCATATCACGCGTAACGGCGGCTTCAACTGCTTTAACAATATCGCGGCTGTTGCCACGGGTGGAAATGGCTAACAATACATCTCCCGCATGACCCAGCGCCCGCA < NC_000913/3296254‑3296116 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |