| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3296254 | 211 (1.700) | coding (446/591 nt) | diaA | DnaA initiator‑associating factor for replication initiation | |||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
GCTATCGCCGCTCTGCGCTTTATGGCGGCGCGGCAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGG > NC_000913/3295590‑3295866 | gCTACCGCCGCTCTGCGCTTTATGGCGGCGCGGAAGCCAGTGTGACCGGCAGCAAACAACACAAATTATTTCAGGCTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGAtgtg < 2:712110/140‑1 (MQ=255) tgcgggcgctgggtcatgcgggagatgtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgag > 1:1251617‑M1/140‑140 (MQ=255) cgggcgctgggtcatgcgggagatgtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGt < 1:638260‑M1/3‑1 (MQ=255) ggcgctgggtcatgcgggagatgtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAg < 2:1528324‑M1/5‑1 (MQ=255) ggcgctgggtcatgcgggagatgtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAg < 2:1603523‑M1/5‑1 (MQ=255) cgccgcTCTGCGCTTTATGGCGGCGCGGCAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGc > 1:2024510/1‑140 (MQ=255) cgctgggtcatgcgggagatgtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGcc > 2:1137585‑M1/134‑140 (MQ=255) ctgggtgatgcgggagaggtatttttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatatggttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCtt > 2:1673782‑M1/132‑140 (MQ=255) tctGCGCTTTATGGCGGCGCGGCAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCAc < 1:883240/140‑1 (MQ=255) ctGCGCTTTATGGCGGCGCGGCAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCAcc < 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1:252688/140‑1 (MQ=255) gagatgtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAg < 1:306403‑M1/22‑1 (MQ=255) gagatgtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAg < 1:2047101‑M1/22‑1 (MQ=255) agatgtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAgg > 1:1286283‑M1/118‑140 (MQ=255) ggcgcggcAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGa < 1:1260552/140‑1 (MQ=255) ggcgcggcAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGa < 2:557634/140‑1 (MQ=255) gtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGa > 2:2047101‑M1/114‑140 (MQ=255) gtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGa > 2:42869‑M1/114‑140 (MQ=255) gtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGa > 1:561943‑M1/114‑140 (MQ=255) gtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGa < 1:531501‑M1/27‑1 (MQ=255) gtattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGa > 2:81237‑M1/114‑140 (MQ=255) gcgcggcAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAg < 2:684530/140‑1 (MQ=255) gcgcggcAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAg < 2:1426687/140‑1 (MQ=255) gcgcggcAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAg < 2:14767/140‑1 (MQ=255) gcgcggcAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAg < 1:222752/140‑1 (MQ=255) gcgcggcAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAg < 1:2061506/140‑1 (MQ=255) gcgcggcAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAg < 2:1583112/140‑1 (MQ=255) tattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAg > 1:1858929‑M1/113‑140 (MQ=255) tattgttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAg > 1:1126855‑M1/113‑140 (MQ=255) tattgttagccatttccacccgtgccaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAg > 1:1072862‑M1/113‑140 (MQ=255) gttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGa < 1:820834‑M1/32‑1 (MQ=255) ttagccatttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTCGAGTGGAt > 1:44299‑M1/108‑140 (MQ=255) catttccacccgtggcaacagccgcgatattgttaaagcagttgaagccgccgttacgcgtgatatgaccattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAgg 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accattgtggcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAgcttgct < 2:655588‑M1/105‑1 (MQ=255) gcattgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGaaa < 2:578787‑M1/114‑1 (MQ=255) ttgaccggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAgcttgc > 2:1483098‑M1/24‑127 (MQ=255) cTGTGGA‑TTGCCGGTTTGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTgctgtctc < 2:727382/140‑8 (MQ=255) gtgGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTc > 1:1459722/1‑140 (MQ=255) gtgGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTc > 1:1280424/1‑140 (MQ=255) tgGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCa > 2:402268/1‑140 (MQ=255) accggctatgacggcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTc < 2:1168255‑M1/120‑1 (MQ=255) cGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCaaa < 2:1997319/140‑1 (MQ=255) gTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAAtt > 2:1944724/1‑140 (MQ=255) gcggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTgc > 2:855855‑M1/8‑140 (MQ=255) cggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTgcg < 1:1843562‑M1/134‑1 (MQ=255) cggcgaGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTgcg < 2:1053995‑M1/134‑1 (MQ=255) | GCTATCGCCGCTCTGCGCTTTATGGCGGCGCGGCAGCCAGTGTGACCCGCAGCAAACAACACAAATTATTACAGACTGCCCGCTTGTGGCTCGCGCGTCATAATGGGAGTTTTGATACTGTGGA‑TTGCCGGTTCGATGTGGTAGCCTTCACCGGGAATGAGGTTGAGTGGATTAAGGATGCCTTTAATGACCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGG > NC_000913/3295590‑3295866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |