| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4506708 = | 432 (0.820) | 18 (0.040) | 8/94 | NT | 5.1% | coding (827/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
| ? | CP009273 | 4506742 = | 302 (0.680) | coding (793/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4506782‑4506708‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > CP009273/4506742‑4506807 AACCGCGGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGGGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:24338905/68‑1 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:24889697/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:15169544/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:17558284/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:4646456/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:19766815/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:20026934/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:42341178/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:38756025/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:1014671/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:35480625/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:26491566/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:2795258/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:29459110/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:31315739/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG < 1:35063477/68‑1 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG < 1:34048163/68‑1 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:10240703/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:14068112/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:12151254/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:11682578/1‑68 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT < 1:29813409/68‑1 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT < 1:30560547/68‑1 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT > 1:35840394/1‑68 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT < 1:25304984/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTg > 1:2623402/1‑67 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:1413973/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:21925399/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:22954324/1‑68 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:13438731/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:13106983/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:20505336/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:27381698/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:11475064/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:16676076/68‑1 CGCTGGGTGAGGGGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:39574987/68‑1 GCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:17706492/1‑67 gGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC < 1:16423506/66‑1 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC < 1:5563819/67‑1 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC < 1:11029853/67‑1 TGGGTGAGGTGATACCCACGCTAACCCGTTACCGCAACCGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCG < 1:20632753/68‑1 GGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGG < 1:34061513/68‑1 GGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGG < 1:21870427/68‑1 TGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTA < 1:42312453/67‑1 gGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGGTGCGGTAACGG < 1:40483639/65‑1 TGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGG < 1:1794492/66‑1 TGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGG < 1:16763253/66‑1 tacCCACGCTAACCCGTAACCCCAACGGCGGGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAG < 1:16136804/65‑1 AGCCACGCTAACCCGTAACCGCACCGGCGGGCTGCGCTGCGACCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGC < 1:21314707/68‑1 CGCTAACCCGTTACCGCCACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:33343901/68‑1 CGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:10464878/68‑1 CGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGGGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:32534834/68‑1 ACCCGTTACCGCACCGGCGGGCTGCGCTGCGACCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCA < 1:29312643/68‑1 cgcCGTGCTGCGCGGCGATCCCGCCGTTGCGGAAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGT < 1:12341752/65‑1 CGGCGTCCTGCCCTGCGACCCCCCCGTTGCGGAAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGT < 1:12292096/68‑1 CGGCGTCCCGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGT < 1:7010387/68‑1 CGGCGGGCGGCGCGGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGT < 1:182083/68‑1 gcCGACCCCCCCGTTGCGGAAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGC < 1:3329238/66‑1 TGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCAATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAG < 1:40775676/67‑1 CCCGCCGTGGGGGTAAGGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGTTTTATCGCTGAAGCTCAGGA < 1:5251009/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:29037197/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:40572191/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:5089115/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:43087171/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:20793682/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATG > 1:1429878/1‑67 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATG > 1:555422/1‑67 CCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT > 1:10232270/1‑67 CCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT > 1:7120225/1‑67 CCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT > 1:37184785/1‑67 CCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT > 1:19491693/1‑67 CGTTGCGGTAACGGGTTAGGGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:6966714/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:3430043/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:1386561/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:15649875/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:4619648/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:2063379/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:23284508/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:38911598/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:23319339/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:31449258/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:26469292/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:26283870/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:23858769/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTC < 1:2313443/67‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTC < 1:1632632/67‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCCGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:8974313/68‑1 CGTTGCGGAACCGGTTTAGCGGGGCTACCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:2201312/68‑1 GTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCT > 1:23288023/1‑68 GTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTAACGCTGAAGCTCAGGATGTCCT > 1:22593915/1‑68 TGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTC < 1:42532780/68‑1 TGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTT < 1:15986434/67‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGGGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTACG > 1:19097203/1‑68 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:20480311/68‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:37528089/68‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:41613014/68‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:14585541/68‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:33303330/68‑1 CGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:9038477/67‑1 CGGAAAGGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:846830/67‑1 TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4506782‑4506708‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > CP009273/4506742‑4506807 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |