| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2499292 | 514 (0.980) | 33 (0.070) | 12/98 | NT | 6.4% | coding (820/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2499321 | 518 (1.120) | coding (791/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2499220‑2499292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccggcgTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATTT < CP009273/2499321‑2499255 CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:17372598/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:29891294/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:24768039/1‑67 CAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGG < 1:25353230/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAATTAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:18070527/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:30758278/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:40916684/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:16535806/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC > 1:3593524/1‑68 CCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGGAGG > 1:39193898/1‑68 CCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGGAGG > 1:23317780/1‑68 CCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGG > 1:31095324/1‑68 CCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGG < 1:35827006/68‑1 CCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGG > 1:18473076/1‑68 CCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGG < 1:4709332/68‑1 TGTTATGACCGAAATAGTCGCCATTACCTGCTTCTGTTATGACCCGGCGTGCGGGGGCCGCAGGTTG > 1:38631006/1‑67 TGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGGAGGTTG > 1:30535499/1‑67 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGGCCCGGGGTGGGCTGCCTGCAGGTTGACGCTG > 1:9384566/1‑67 ACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCCGCAGGTTGTCGATGgc > 1:7340375/1‑66 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGG > 1:6508608/1‑67 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGG > 1:19834849/1‑67 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGGTGCCGATGCCGCGCGCCGGG > 1:6828980/1‑67 ACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACA > 1:40588020/1‑68 ACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACA > 1:32770582/1‑68 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCTTTACAG > 1:15103769/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:662535/1‑68 CTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGC > 1:16415372/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTTATTACAGAAGCAG > 1:37382706/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:36467466/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:41217965/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:36085796/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:25776318/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:14848214/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:9157528/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGGCATTACAGAAGCAG > 1:40523653/1‑68 TAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTA > 1:25655796/1‑68 TAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTA > 1:5288438/1‑68 TAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTA > 1:20068959/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:35385674/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:12157031/1‑68 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:43239358/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:41732202/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:41732201/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:9663665/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGGCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:8089977/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:10935623/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:34966340/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:41902103/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:471009/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:5236447/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:635877/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:8560776/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:9754297/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:26193454/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:10136594/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:13369978/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:16815526/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:29733789/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:30812653/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:3252026/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:31337456/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCAGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:5825078/1‑67 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTGATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:42438394/1‑66 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGAC < 1:12196473/68‑1 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:21669559/1‑66 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:9136686/1‑66 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:29265580/1‑66 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:30545010/1‑66 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:15868882/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:15893885/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:34812313/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:39898142/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:34152403/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:30599667/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:3249815/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA > 1:11681333/1‑68 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA < 1:36492686/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA < 1:43131136/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA < 1:23539526/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGGTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA < 1:28175868/68‑1 GCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGGTATGGCGCCTAT > 1:39040547/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:23867365/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:1938909/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:685551/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:38700847/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:33328186/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:43589759/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:39392262/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:10986230/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:11091082/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:36795861/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:5908042/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:26496394/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:27308419/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:39484823/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:39048011/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:30828514/67‑1 GTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATTT < 1:15520555/68‑1 GTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT < 1:22187189/67‑1 GTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT < 1:25935911/67‑1 CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2499220‑2499292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccggcgTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATTT < CP009273/2499321‑2499255 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |