| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1238033 = | 628 (1.190) | 38 (0.110) | 17/76 | NT | 9.7% | coding (504/915 nt) | ldcA | murein tetrapeptide carboxypeptidase; LD‑carboxypeptidase A |
| ? | CP009273 | 1238051 = | 280 (0.780) | coding (486/915 nt) | ldcA | murein tetrapeptide carboxypeptidase; LD‑carboxypeptidase A | |||||
Only 100 of 787 total aligned reads displayed.
GATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAGG > CP009273/1237985‑1238118 | gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCt > 1:3163599/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCtt < 1:2866095/68‑1 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:10125345/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:21267010/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:20923687/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:26443520/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:27546494/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:30456066/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:17679522/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:17407661/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:32175301/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:16278867/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:37947876/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:40031398/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:4526426/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:6766407/1‑67 (MQ=255)gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:7140739/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTc > 1:42243197/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:114982/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:15270244/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:30921143/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCGTc > 1:33541232/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCGTc > 1:25532250/1‑67 (MQ=255) ctggcgttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc > 1:41365429‑M1/46‑67 (MQ=255) ctggcgttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc > 1:11000015‑M1/46‑67 (MQ=255) cgggcgttacgcaatgaacccttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTcc < 1:3829536‑M2/4‑1 (MQ=255) gttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGc > 1:39376049‑M1/41‑68 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:42840928/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc > 1:10458736/1‑68 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:21717672/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCGTGcc > 1:22957604/1‑68 (MQ=255) tacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc > 1:888587‑M1/39‑67 (MQ=255) aTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCa > 1:43575950/1‑68 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:29262426/68‑1 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:34595294/68‑1 (MQ=255) acgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCAt < 1:43202270‑M2/13‑1 (MQ=255) cAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt > 1:1373706/1‑67 (MQ=255) aatgaaaccttcaccactgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCa < 1:20584241‑M2/16‑1 (MQ=255) aTCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCa < 1:34977016/66‑1 (MQ=255) aTCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAAt > 1:568068/1‑68 (MQ=255) aTCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAAt < 1:20380648/68‑1 (MQ=255) tCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATg < 1:39187318/68‑1 (MQ=255) tCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATg < 1:24391095/68‑1 (MQ=255) cttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAg < 1:29981374‑M2/25‑1 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGGCATTCAATGGTGAAgg > 1:42680004/1‑68 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAgg > 1:16590242/1‑68 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCGTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAgg > 1:1225959/1‑68 (MQ=255) tttccTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAg < 1:25939909/63‑1 (MQ=255) ttGCCTCCCCACACCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAgg < 1:4948688/67‑1 (MQ=255) ttGCCTCCCCACACCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAg < 1:13880413/66‑1 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAgg < 1:16953151/67‑1 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGt < 1:37020421/68‑1 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGt > 1:13129492/1‑68 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGt < 1:25180472/68‑1 (MQ=255) accattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGtt > 1:14949096‑M2/40‑67 (MQ=255) accattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGtt > 1:15855474‑M2/40‑67 (MQ=255) tCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCAt > 1:29052300/1‑68 (MQ=255) attgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCTATGGTGATGGTTTCAt < 1:7464200‑M1/50‑1 (MQ=255) attgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCAt < 1:39906012‑M1/50‑1 (MQ=255) ccACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc < 1:24003550/68‑1 (MQ=255) ccACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc < 1:2209728/68‑1 (MQ=255) acaACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGt > 1:27013913/1‑68 (MQ=255) acaACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGt > 1:9230835/1‑68 (MQ=255) gcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATTGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:5395842‑M2/29‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc < 1:9525836/68‑1 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc < 1:41148178/68‑1 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:19479894/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGGTTCATTGCGTAAc > 1:14591505/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCGTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:28287237/1‑68 (MQ=255) 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tCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccagcca < 1:32621039/68‑1 (MQ=255) ccGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccagcca < 1:33112522/67‑1 (MQ=255) gcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaa > 1:24768717‑M2/18‑68 (MQ=255) gCCGGACATGTGGTGGCTTCCCCTTGCGATTCAATTGTGTAGGTTTCATTGGGTAACGCCAGCCAGaa < 1:37619638/68‑1 (MQ=255) cccgacatgtcgggccTTACCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTAATTGCGTAACGCCAGCCAGaaa > 1:31841007‑M2/17‑68 (MQ=255) ccccacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaa < 1:36664216‑M2/51‑1 (MQ=255) CCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaaa < 1:8040941‑M1/68‑1 (MQ=255) CCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaaa < 1:2359625‑M1/68‑1 (MQ=255) acaggtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCCGCCAGAAATGGt > 1:41597956‑M2/13‑68 (MQ=255) catgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt < 1:18984795‑M2/56‑1 (MQ=255) 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CCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTaaa < 1:3393686‑M1/68‑1 (MQ=255) | GATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAGG > CP009273/1237985‑1238118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |