New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2230114 | NA (NA) | 8 (0.020) +CTACAATAAGCTC |
4/86 | NT | NA | noncoding (102/150 nt) | REP156 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences | REP156 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences |
? | CP009273 | = 2230185 | NA (NA) | intergenic (+206/+37) | preA/mglC | dihydropyrimidine dehydrogenase, NADH‑dependent, subunit C/methyl‑galactoside transporter subunit |
Only 100 of 703 total aligned reads displayed.
TGGCTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAATCC > CP009273/2230118‑2230252 | ggagccaaatgccggatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTa > 1:25319456‑M2/20‑68 (MQ=255) gCTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTAt > 1:28366605/1‑68 (MQ=255) gCTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTAt > 1:31532304/1‑68 (MQ=255) gCTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTAt > 1:32789567/1‑68 (MQ=255) ccTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTAAtgt > 1:40763424/1‑67 (MQ=255) gTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGt < 1:43628286/68‑1 (MQ=255) gTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGt < 1:23574607/68‑1 (MQ=255) gTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGt < 1:39736881/68‑1 (MQ=255) gTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGt < 1:34420456/68‑1 (MQ=255) ccggatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTAt > 1:22422304‑M2/9‑68 (MQ=255) ccggatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTAt > 1:32066854‑M2/9‑68 (MQ=255) cggatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATg > 1:10892668‑M2/8‑68 (MQ=255) gatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAACCCCCACAGATCATGATGTTAGGTGCGGTTAtgc > 1:39094101‑M2/6‑66 (MQ=255) gatgcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGa > 1:38140779‑M2/6‑67 (MQ=255) gcGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGa > 1:14027141‑M2/3‑68 (MQ=255) ggcgTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGaa < 1:4248591/67‑1 (MQ=255) cgTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGc > 1:24582894/1‑68 (MQ=255) gAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGa < 1:37237760/68‑1 (MQ=255) gAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGa < 1:26043879/68‑1 (MQ=255) aCGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGAc < 1:35182993/67‑1 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcac < 1:24966128/68‑1 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcac < 1:7061267/68‑1 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcac < 1:17352905/68‑1 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcac < 1:29137005/68‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcaca < 1:42150534/67‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcaca < 1:10420944/67‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACcaca < 1:21175829/67‑1 (MQ=255) tCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcac > 1:2004721/1‑68 (MQ=255) tCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcac > 1:8751708/1‑68 (MQ=255) tCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcac > 1:26253028/1‑68 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTgagcttattgtagggcggatgcaacgctggcgcgtt < 1:30903716‑M2/68‑37 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTgagcttattgtaggccggatgcaacgctggcgcgtt < 1:14920717‑M2/68‑37 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca < 1:13315187/68‑1 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca < 1:34032021/68‑1 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca < 1:3624919/68‑1 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca < 1:36571750/68‑1 (MQ=255) ccGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca < 1:30520545/68‑1 (MQ=255) cGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTgagcttattgtaggccggatgcaacgctggcgcgttt < 1:18559680‑M2/68‑38 (MQ=255) cGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca > 1:27810737/1‑67 (MQ=255) cGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTcaca > 1:42787564/1‑67 (MQ=255) ggCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCAcatc < 1:14285412/68‑1 (MQ=255) ccTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCAcatca < 1:7386520/67‑1 (MQ=255) cTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCAtt < 1:26581193/68‑1 (MQ=255) cTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCAtt > 1:3029682/1‑68 (MQ=255) aCAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTc < 1:22954996/68‑1 (MQ=255) aaaCCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCtt > 1:2972275/1‑67 (MQ=255) aaaCCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCtt > 1:37002195/1‑67 (MQ=255) aCCATACAAATCAGTATGTTgagcttattgtaggccggatgcaacgctggcgcgttttatccggcct < 1:20530491‑M2/67‑48 (MQ=255) aCCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTAc > 1:12992107/1‑67 (MQ=255) aCCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTAc > 1:40385360/1‑67 (MQ=255) aCCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTAc > 1:9470185/1‑67 (MQ=255) aCCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTAc > 1:17014007/1‑67 (MQ=255) aCCACACAGATCATGATCTTATGTGCGTAAATCACCCAATGCCCACCACATTCACAACATTACTTAcg > 1:9117721/1‑68 (MQ=255) cacacaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTAcgcg < 1:10177210/68‑1 (MQ=255) cacacaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTAcgcg < 1:41784900/68‑1 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGTCCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt > 1:11940549/1‑68 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt > 1:16065051/1‑68 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt < 1:24190668/68‑1 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGt < 1:15267748/68‑1 (MQ=255) acaGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAAAGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCCCGt > 1:19608877/1‑68 (MQ=255) aGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTAt > 1:27168035/1‑68 (MQ=255) aGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTAt > 1:32267162/1‑68 (MQ=255) gATCATGATGTTATGTTCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTAtt > 1:13629700/1‑68 (MQ=255) tCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTc > 1:3122163/1‑68 (MQ=255) tCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTc > 1:7870533/1‑68 (MQ=255) tgatgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGt > 1:25759206/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:5952189/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:5690894/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:5044414/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:23220416/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:12188315/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:41440685/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:11472305/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:5297138/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:43124319/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:19143672/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:650907/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:18922378/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:35756532/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:836103/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:2684788/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:33713018/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:31824712/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:16513201/1‑68 (MQ=255) atgTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGa > 1:28759171/1‑68 (MQ=255) atgTTATCTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACAATCACATCAATTCTTACGATCGTATTTCAgaga > 1:20782805/1‑68 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:4565455/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:22594847/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:40062281/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:8099327/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:14607595/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:21804947/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:33204760/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGaa > 1:27992527/1‑67 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAAt < 1:11318660/68‑1 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAAt < 1:37848398/68‑1 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAAt < 1:17888558/68‑1 (MQ=255) gTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGCACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTCaa > 1:12568978/1‑67 (MQ=255) tATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAATcc > 1:38571080/1‑68 (MQ=255) tATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAATcc > 1:18174795/1‑68 (MQ=255) | TGGCTCCTGTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCACACAGATCATGATGTTATGTGCGTTTATGACCGAATGCGGACCACATTCACATCATTTCTTACGCGCGTATTTCAGTGAATCC > CP009273/2230118‑2230252 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |