| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4501871 = | 419 (0.600) | 34 (0.060) | 13/92 | NT | 5.6% | coding (361/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit |
| ? | CP009273 | 4501966 = | 806 (1.400) | coding (266/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit | |||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4501947‑4501871‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > CP009273/4501966‑4502031 CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG < 1:33274351/68‑1CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:53229136/1‑68CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:55003600/1‑68CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTAATGCCGTCACTGCCCGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG < 1:20134488/68‑1 TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:43037445/1‑67 TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:51956467/1‑67 TGTGGGGGCTCTACTTCTTCTGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:25164562/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:48959970/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:3337015/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:35157304/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:7394469/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:52900720/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:26167408/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:3670813/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG > 1:21939165/1‑67 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCAGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:48270929/68‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCA < 1:56514430/68‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCA > 1:34564929/1‑68 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCA < 1:47978986/68‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCA > 1:40370419/1‑68 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:45047840/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:32179394/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:40103970/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:8542018/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:16297802/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGGGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:29909568/67‑1 GGGGGCTCTACTGCTTAAGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:18133836/67‑1 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGGGGGCGGCATG > 1:10815873/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:57908634/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:6786671/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:6630376/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT < 1:13107964/67‑1 GGGCTCTACTTCTTATGCCGGCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT < 1:11622909/67‑1 GGGCTCTACTTCTTATGCCGACACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:9595958/1‑68 GGCTGTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:56154977/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:4339437/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:4430680/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:4446691/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:46161164/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:46173846/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:47776351/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:50125259/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:54442348/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:54677515/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:41875119/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:41138360/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:4059922/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:55818806/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:35520108/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:10329038/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:37805877/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:22878881/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:21082952/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:28941699/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:30298684/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:32468845/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:12270463/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:11266283/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:35745415/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:3732410/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGACCTTTGCGGGCGGCATG > 1:30991814/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:942820/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCAGTGATGGTGCTGCCGCTTCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:53656585/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGGCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:8219428/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:12014932/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:3694136/67‑1 TCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTT < 1:8929081/67‑1 TCTACTTCTTATGCCGCCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTT < 1:29230169/67‑1 ACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:55319799/68‑1 ACTTCTTATGCCGACACTGCCCGGGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:7635415/68‑1 TTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAG < 1:15581202/68‑1 ATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAA < 1:39086730/68‑1 CCGTCCCTGCCCGCGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATAT < 1:30580318/68‑1 cggCACTGCCCGTGAGGGTGCGGCCGCTGCTGGCCATTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATAT < 1:15874288/64‑1 ACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGG < 1:4659272/67‑1 GCCCGTGATTGCGCCGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAT < 1:7125112/68‑1 GCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAT < 1:45570707/68‑1 CCCGTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAT < 1:51022587/67‑1 CCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:14666380/67‑1 CCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:41704273/67‑1 CCGTGATGGGGCGGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGC < 1:15420493/68‑1 cggGATGGGGCGGCCGCTGCGGGCCGTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:28326668/65‑1 CGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:19585120/68‑1 CGTGAGGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:6033230/68‑1 gGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCGGGTGATGACAGAGGGTTGCGCTCAAT < 1:23489539/67‑1 cgGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGAGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTAT < 1:35292164/66‑1 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCCGCACG > 1:57160419/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:3833971/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:50870117/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:3115878/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:26064303/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG < 1:2467616/67‑1 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG < 1:19111170/67‑1 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:18884406/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:13869511/1‑67 CATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCC > 1:15209218/1‑68 ATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCG < 1:10402494/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGC < 1:4259890/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCG > 1:45718885/1‑67 GTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > 1:33179954/1‑67 CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4501947‑4501871‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > CP009273/4501966‑4502031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |