| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4501871 = | 419 (0.600) | 34 (0.060) | 13/92 | NT | 5.6% | coding (361/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit |
| ? | CP009273 | 4501966 = | 806 (1.400) | coding (266/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit | |||||
Only 100 of 985 total aligned reads displayed.
CAGCACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501899‑4502033 | agcaCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGtt > 1:27065348/1‑68 (MQ=255) aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGtt < 1:35082113/65‑1 (MQ=255) aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac > 1:27342031/1‑68 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:53142317/68‑1 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:24576880/68‑1 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:3066759/68‑1 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:4791846/68‑1 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:6356436/68‑1 (MQ=255) ccATCACCGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGTTTAaca < 1:51995813/68‑1 (MQ=255) tCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCg < 1:14472577/68‑1 (MQ=255) aCGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCgag < 1:35526848/68‑1 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa > 1:10011860/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa < 1:28237775/68‑1 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:16153323/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:4333691/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:50364244/1‑68 (MQ=255) cAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata < 1:45701227/67‑1 (MQ=255) aGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAatat > 1:12970644/1‑67 (MQ=255) aCGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGt > 1:55159131/1‑68 (MQ=255) ggCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGa > 1:23140566/1‑68 (MQ=255) ggCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGa > 1:12096124/1‑68 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt > 1:53310823/1‑67 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt < 1:42506557/67‑1 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt > 1:4043423/1‑67 (MQ=255) ccgtgatggtgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:41704273‑M2/25‑1 (MQ=255) aTAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:19494050/67‑1 (MQ=255) aTAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:57804644/67‑1 (MQ=255) tAAGAAGTATAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:12668303/68‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:37460048/68‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:9315930/68‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:15498764/68‑1 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:8423558/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:14980890/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:21541501/1‑68 (MQ=255) tAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt > 1:43863668/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:55927376/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:18098971/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:56627652/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:39408641/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:3977905/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:29316086/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:13337333/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:44695821/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:25059662/67‑1 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:31300394/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:57575688/1‑68 (MQ=255) gCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc < 1:4121727/67‑1 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc > 1:36044544/1‑67 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc > 1:21866937/1‑67 (MQ=255) cacaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:27730897/1‑68 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:33643950/1‑67 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:23955312/1‑67 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:11456678/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:660787/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:36482222/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:7484635/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:37784514/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:51411546/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:54398131/1‑67 (MQ=255) gagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:36852175/1‑67 (MQ=255) gagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:18989715/1‑67 (MQ=255) gagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:23629831/1‑67 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:8925192/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:28687985/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:30059126/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:13888351/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:6954693/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:48146360/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:25997979/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:5378004/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:49185816/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:11014231/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:45242769/1‑65 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:20756499/1‑65 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATCCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:3200684/1‑65 (MQ=255) ggCCAGGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:34464915/66‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa < 1:46958531/61‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:18764958/1‑64 (MQ=255) ccAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt > 1:4982188/1‑68 (MQ=255) ccAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt > 1:38081614/1‑68 (MQ=255) ccAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCACACAATCCCCt < 1:40864052/66‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:52590674/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:16809915/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:48480182/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:33085705/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:57157955/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATCCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:26486792/67‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATc > 1:54747463/1‑68 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGCGGGTTGCGCACACTCCCCTGTATCa > 1:17312221/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:40084650/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:20190479/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:22553278/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:25508603/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:48954913/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:46381458/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:32645883/1‑67 (MQ=255) ggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcg > 1:50870117‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcg > 1:38576387‑M2/8‑67 (MQ=255) atggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccg < 1:10605412‑M2/64‑1 (MQ=255) tggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccg > 1:7976562‑M2/4‑67 (MQ=255) | CAGCACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501899‑4502033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |