| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 64557 | 549 (0.780) | 47 (0.080) | 13/94 | NT | 8.2% | coding (1224/2352 nt) | polB | DNA polymerase II |
| ? | CP009273 | = 64577 | 591 (1.010) | coding (1204/2352 nt) | polB | DNA polymerase II | |||||
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
ATCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/64483‑64557‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agccctggcGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT < CP009273/64577‑64511 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGC < 1:8694793/68‑1 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:9016794/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:22855820/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:31546243/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:32800854/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:16342974/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:55531171/1‑67 TCAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAG > 1:51322062/1‑67 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC < 1:45317250/68‑1 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC < 1:43434652/68‑1 CAGAAAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCC < 1:45088017/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:37621915/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG < 1:1114424/68‑1 AAGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTG > 1:48570442/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGc > 1:39861399/1‑66 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:36545929/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:46710928/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:56516740/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:57669284/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:58088074/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:26050104/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:22181555/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:1873904/68‑1 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:4426220/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:57074603/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:23177115/1‑67 AGGTGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGG > 1:27012422/1‑67 AGGGGCGGATGATCGACGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGC < 1:49356109/68‑1 CGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCCCCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCGACGGGTTGGGTT > 1:6509377/1‑68 CGGGTACAGGCTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGgg > 1:51181721/1‑65 CTTTTATAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATTAAGCCCTGGCGGCGACGTGGTGGATTCCCGGCCCGG > 1:10317677/1‑68 TAGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGGTACGTGATGGATTCACGGCCCGGGCTTTt > 1:17433166/1‑67 AGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGGTTTAT > 1:33461493/1‑68 AGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTtt > 1:25394234/1‑66 AGTCCAGCACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCGACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCGTTAT > 1:27274590/1‑68 ACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCCCGGCCAGGGCTTTATGATTCAGT > 1:10604121/1‑68 ACCAGCACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGT > 1:15018210/1‑68 ACTGAATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGT > 1:25741354/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCCCGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:19106709/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:24117406/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:27598389/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:39546378/1‑68 ATCATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGG > 1:36311100/1‑68 ATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACT > 1:12459928/1‑68 ATAAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACT > 1:41977391/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:29944581/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:32594053/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:33584451/1‑68 AAAGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTAT > 1:21428471/1‑68 AGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:55085333/1‑68 AGCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAA > 1:35152539/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:12775984/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:54802837/1‑68 GCCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAA > 1:36694731/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCCGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:4026817/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGCCTATTAAA > 1:11994147/1‑68 CCCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:288194/1‑68 CCTGGCGGCTACTTGTTGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTTGACTATAAAAG < 1:19935686/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:3943922/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:16445165/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:48700956/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:8114305/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:17926709/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:4358626/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:38450585/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:32181113/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:52334937/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:51996509/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:14716880/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG < 1:24334024/68‑1 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:57932247/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:50658360/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:22569781/1‑67 CCTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAA > 1:10460910/1‑67 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CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGTCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:20947355/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:56793766/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:48398206/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:3813046/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:11441327/68‑1 CTGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGC < 1:28022661/68‑1 TGGCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCC < 1:33969211/68‑1 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:15713359/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:37033902/1‑64 GCGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAG > 1:30658109/1‑64 CGGCTACGTGATGGATTCACGGCCAGGGCTTTATGATTCAGTGCTGGTGCTGGACTATAAAAGCCTGT > 1:5378671/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |