| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 691855 = | 590 (0.840) | 86 (0.130) +TAATG |
4/102 | NT | 12.3% | intergenic (+123/+31) | ubiF/glnX | 2‑octaprenyl‑3‑methyl‑6‑methoxy‑1,4‑benzoquinol oxygenase/tRNA‑Gln |
| ? | CP009273 | 691998 = | 752 (1.070) | noncoding (75/75 nt) | glnV | tRNA‑Gln | |||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
CATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/691918‑691855‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG > CP009273/691998‑692064 ||||| TTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGG < 1:36944375/67‑1 cAAGCGCGCTTCGGCGAGCGTTTTTAATGGGGCGGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAA < 1:25700019/67‑1 cGCGAGCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGT < 1:14231129/67‑1 acCGAGCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGT < 1:17164221/66‑1 acCGAGCTTTTATAAAGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGT < 1:56439732/66‑1 GCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGT > 1:55802656/1‑67 GCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGT > 1:54945349/1‑67 gctGCTTTATTAAAGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:15965375/65‑1 ccAGCTTTAATAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:30377887/66‑1 ccAGCTTTAATAATGTGGCTGCGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:53521024/66‑1 CGAGCTTTTTTAATCTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGAATCAAAAACCGGTGC < 1:15666230/68‑1 gtGCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:4636721/65‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGC < 1:31639224/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:32167384/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:47097464/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:29134162/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:18679776/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:32998816/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:20418198/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:19887171/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:17969965/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:5084303/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:58034398/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTG > 1:43255032/1‑66 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTG < 1:44276262/66‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTG < 1:3591510/66‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTG < 1:51373956/66‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCC < 1:7948535/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTG < 1:11180981/66‑1 GAGCTTTTTTAAGCTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGAATCAAAAACCGGTGCC < 1:8726478/68‑1 tGCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:24133141/66‑1 tCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCACGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCT < 1:48118476/66‑1 GCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTT > 1:26117536/1‑68 GCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCT < 1:41221645/67‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCACAAACCGGTGCCTTACC < 1:19140646/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAAACCGGTGCCTTACC < 1:37675326/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGAATCAAAAACCGGTGCCTTACC < 1:21627242/68‑1 TTTTTAATGTGGCGGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:1692653/68‑1 TTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCG < 1:11894224/68‑1 TTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:7529672/61‑1 TTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT < 1:3050452/48‑1 TTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCACGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCG < 1:33812220/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGTAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:51956931/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:43757186/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:35219968/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:28133836/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:45825839/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:49459151/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:24353177/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:20128047/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:4967206/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAAACCGGTGCCTTACCGCT > 1:42722818/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:25395744/68‑1 TAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTT > 1:45727013/1‑68 TAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTT > 1:51610212/1‑68 AATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTG < 1:38074772/68‑1 AATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTG < 1:27573990/68‑1 ATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGG < 1:4520513/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGTTCCTCGGAATGGCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACGGCTTGGC < 1:49151455/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCTGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGcg > 1:54386772/1‑66 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAGGGCCGGAATCAGAATCGGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:56492514/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:19586860/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:25796555/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:17351584/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:57398047/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:975158/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:50641955/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:10570299/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:7359922/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:6530903/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:600102/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:16404721/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:12651999/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:12846178/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:4510681/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:1367342/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:52466872/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:37103602/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:30034883/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:23216652/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:22731017/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:22320735/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:27263735/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:34728693/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:36364871/1‑68 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TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTAGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:48492059/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCACGGAATGCCGGAATCACAATCCGGTGCATAACCGATTCGC > 1:34310056/1‑68 GTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG > 1:20798567/1‑68 GTGGCTGGGGTACGAGGAGTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG < 1:4768213/68‑1 ||||| CATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/691918‑691855‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG > CP009273/691998‑692064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |