New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3015939 | 870 (1.240) | 44 (0.070) | 15/96 | NT | 5.8% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
? | CP009273 | = 3015996 | 673 (1.120) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3015865‑3015939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccaACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCGT < CP009273/3015996‑3015931 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:7640047/1‑68 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:29951091/1‑68 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:39602032/1‑68 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCACGTACCTTGGCACTTAC > 1:13324425/1‑68 TGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG < 1:4403672/68‑1 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCGCTTACG > 1:49753962/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:27368873/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:55131467/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:40584692/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:30516529/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:32037423/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:18796618/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:51109578/1‑67 CTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:24967339/68‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCTGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:55764560/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCATGTACCATGGCACTTACGCC < 1:27066863/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:39493085/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:45909772/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:46665095/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:48151641/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:55416671/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:42964596/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:48985312/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:40299864/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:30214185/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:52171308/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:30860489/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:31514096/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:38803724/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:32670897/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:53939506/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:10435265/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:52999849/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:38444169/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:2163312/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:15187007/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:16476582/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:17012956/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:17099765/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:14355859/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:17388973/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:17498924/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:19316907/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:14207858/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:56574021/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:21074893/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:21238996/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:57261797/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:13038372/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:22763989/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:2333385/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:56469445/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:23979150/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:11146671/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:24574189/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:25132723/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:10541373/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:25747628/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:26392101/67‑1 TTTACGCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:50512214/67‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:26070716/68‑1 ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA > 1:54580144/1‑68 TCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCGCTTTTATGACATGGACGTTATGCTGTTTC > 1:28819143/1‑68 ACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCACCTCGCTCTTGAATGACATGAACTTTATGGTGTTTCATG > 1:41239908/1‑68 CCAGGTACCATGGCACTTACGCAGCCAACACGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGGTGTTTCATGg > 1:31660483/1‑66 TACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGGCCTCGA > 1:47333783/1‑68 TACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGA > 1:36848480/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGTGATGAACTTTATGCTGTTTGATGCCCACGAG > 1:14800072/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCGTTAATGCCATGAACTTTATGCGGTTTCATGCCCACGAG > 1:44832071/1‑68 CATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGC > 1:11188422/1‑68 ATGGCACTTACGCCGCCCACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGC > 1:21901200/1‑67 ATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGC > 1:34440004/1‑67 GGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGCCATGATCTGTATGCGGTTTCATGCCCCCGAGGCGC > 1:33274517/1‑67 GGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGGACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGCCGC > 1:54298827/1‑67 GCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGC > 1:20319305/1‑68 ACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTG > 1:5996942/1‑68 ACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTG > 1:32790163/1‑68 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:36025307/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:27978943/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:53507481/68‑1 CGCCGCCAACTCGCGCTTTATTGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:13873641/68‑1 GCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGC > 1:57506805/1‑68 GCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGC > 1:2371935/1‑68 GCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGC > 1:34815401/1‑68 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |