| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3015939 | 870 (1.240) | 44 (0.070) | 15/96 | NT | 5.8% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| ? | CP009273 | = 3015996 | 673 (1.120) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding | |||||
Only 100 of 1124 total aligned reads displayed.
ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGT > CP009273/3015872‑3016006 | tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:44363996/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:51751466/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:3442980/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:14772511/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGAAGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:4943907/1‑68 (MQ=255) aTGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgc > 1:32243225/1‑68 (MQ=255) aTGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcg < 1:16352432/67‑1 (MQ=255) ggACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgc > 1:38923828/1‑68 (MQ=255) ggACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCAATTACGCCGCCAGGTcgcgc > 1:43368938/1‑68 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:10042502/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:41366673/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:21974564/1‑67 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:27724902/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:44000127/68‑1 (MQ=255) cGGCGAGCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:10801185/68‑1 (MQ=255) cGGCGAGCGTCTGGCTATCCACGCCTCCACCCAGTTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:53621466/68‑1 (MQ=255) aTCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTg > 1:26580879/1‑68 (MQ=255) tCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTgg < 1:45213495/68‑1 (MQ=255) tCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTgg < 1:50399167/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:45726383/68‑1 (MQ=255) tCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCa > 1:35915658/1‑68 (MQ=255) tCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCa > 1:34903412/1‑68 (MQ=255) ggTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGa > 1:3637491/1‑68 (MQ=255) ggTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGa > 1:47807751/1‑68 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa > 1:4253734/1‑67 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:46299644/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:5707715/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:8289315/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:9318056/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:24597875/67‑1 (MQ=255) tCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACa > 1:6197899/1‑67 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:46671632/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:56125852/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:1526195/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:52757773/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:48138793/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:12726554/68‑1 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:25075087/1‑68 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:17467991/1‑68 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa < 1:52017665/68‑1 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:113428/1‑68 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATCAAACAGCa > 1:3137122/1‑68 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa > 1:47088096/1‑68 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:25781079/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:35502297/68‑1 (MQ=255) aCCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCa > 1:2255184/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcc > 1:3770835‑M1/1‑27 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg < 1:13767839/68‑1 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:53860219/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:15943669/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:1875485/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg < 1:37209611/68‑1 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg < 1:28393142/68‑1 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:33869870/1‑68 (MQ=255) gTACCATGGCACTTTCGCCGCCAactcgctctttaatgagaggaagtttatgcggtttcatgccctcg > 1:16842861‑M1/1‑23 (MQ=255) gTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt > 1:12279880/1‑68 (MQ=255) gTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt > 1:56603087/1‑68 (MQ=255) gTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt > 1:44773744/1‑68 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:55169623/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:30012179/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:11777869/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:42140527/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:1967553/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:10497323/67‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:23953487/67‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:40628436/67‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:21007872/67‑1 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:28790644/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:54473705/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:19942111/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:29328624/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:6661220/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:20632033/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:55586638/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:50994937/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGGCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAACTTCATGTCATTa > 1:47363330/1‑68 (MQ=255) aTGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggc > 1:39563445‑M1/1‑18 (MQ=255) aTGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGATACAGCATAAAGTTCATGGCATTaaa > 1:27174694/1‑67 (MQ=255) tGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:43152856/1‑68 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgccatgatctgtatgcggtttcatgcccccgaggcgc > 1:33274517‑M1/1‑16 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgc > 1:7045779‑M1/1‑16 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:18235590/1‑67 (MQ=255) aCTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAGAGTTCATGTCATTAAAGAGCGa > 1:5966720/1‑68 (MQ=255) aCTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGa > 1:8744785/1‑68 (MQ=255) aCTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGa > 1:22941251/1‑68 (MQ=255) cTTACGCCGCCAGGTCGCGGGCCTCGTTGGCATGTAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAg < 1:3041222/68‑1 (MQ=255) aCGCTGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtg < 1:21470249‑M2/68‑3 (MQ=255) aCGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctg > 1:32790163‑M1/1‑9 (MQ=255) aCGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtg < 1:48942687‑M2/68‑3 (MQ=255) cgccgcCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtg < 1:29748775‑M2/67‑3 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:30809831‑M2/68‑5 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:23629449‑M2/68‑5 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:39887727‑M2/68‑5 (MQ=255) gccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggc < 1:53416155‑M1/68‑65 (MQ=255) gccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggc < 1:29007641‑M1/68‑65 (MQ=255) gccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggc < 1:780121‑M1/68‑65 (MQ=255) gccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggc < 1:38152783‑M1/68‑65 (MQ=255) ccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcg < 1:27978943‑M2/68‑9 (MQ=255) ccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAAAATCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcg < 1:13934227‑M2/68‑9 (MQ=255) cAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGcggcgg < 1:57734289/68‑1 (MQ=255) | ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGT > CP009273/3015872‑3016006 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |