| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3320552 = | 748 (1.070) | 40 (0.070) | 9/94 | NT | 5.6% | coding (472/630 nt) | rlmE | 23S rRNA U2552 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | CP009273 | 3320589 = | 725 (1.230) | coding (435/630 nt) | rlmE | 23S rRNA U2552 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3320625‑3320552‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tagcgccagTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTGCCATAT > CP009273/3320589‑3320653 GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCGATGTATCTGGTGGAACTGGCGGTAGAAATGTGTCGGGGTGTATTA > 1:6984365/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:3589154/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:45877495/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:53873926/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:3481461/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:33276085/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:32457297/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:32427309/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:16003550/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:55334886/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:48283704/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:14024105/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:5309655/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:12820868/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:51340237/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:5110752/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTA > 1:50054058/1‑67GGCGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGACGTGAGGTATTA > 1:56303855/1‑67 CGGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGC < 1:42512495/67‑1 GGTGGATATCCCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGC < 1:26670666/67‑1 GGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCG < 1:45754477/67‑1 GGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCG > 1:17779899/1‑67 GGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCG > 1:38639852/1‑67 GGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCG < 1:14440402/67‑1 GGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCG > 1:41116030/1‑67 GGTGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCG < 1:6747096/67‑1 TGGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCC < 1:39723826/67‑1 GGATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAG < 1:43116156/68‑1 GATAT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAG < 1:27697300/67‑1 AT‑CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCC < 1:11208623/68‑1 AT‑CCCCCGGGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCC < 1:35499993/68‑1 CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCAC < 1:4341358/68‑1 CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCAC < 1:44486458/68‑1 CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCAC < 1:30901311/68‑1 CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCAC < 1:41911798/68‑1 CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCAC < 1:30563102/68‑1 CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCAC < 1:29214224/68‑1 CCCCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCAC < 1:24344939/68‑1 CCCCGTGCCATGTATCTGGTGGCACTGGCGCTAGAAATGTTTGGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACC < 1:53644959/68‑1 CCCGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCA < 1:56715724/68‑1 CGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGA < 1:17405198/68‑1 CGTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGGCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGA < 1:1680172/68‑1 GTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGAT < 1:49420102/68‑1 GTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGAT < 1:19279467/68‑1 GTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGAT < 1:22295063/68‑1 GTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGAT < 1:41461993/68‑1 GTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGAT < 1:5037023/68‑1 GTGCCATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGAT < 1:17681666/68‑1 CATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGTCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGATACA < 1:13459514/67‑1 ATGTATCTGGTGGAACTGGCGCTAGAAATGTGGCGTGATGTATTAGCGCCAGTTCCACCAGATACATG < 1:37711908/68‑1 TAGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTG < 1:21354920/68‑1 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTGC < 1:46692923/68‑1 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTGC < 1:21910515/68‑1 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTGC < 1:50958882/68‑1 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTG > 1:19778216/1‑67 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTG > 1:1806804/1‑67 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTG > 1:20748302/1‑67 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTG > 1:33831916/1‑67 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTG > 1:48135141/1‑67 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTG > 1:22159753/1‑67 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGGGGATATCCACCGCCGGTGTTCCG > 1:12619775/1‑54 AGCGCCAGTTCCACCAGATACATGGCACGGCGGATATCCACCGCCGGTGTTCCGCTCATGTTTGGTG > 1:38364062/1‑67 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |