| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3630213 | 524 (0.750) | 59 (0.110) | 22/84 | NT | 13.3% | coding (558/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase |
| ? | CP009273 | = 3630199 | 374 (0.710) | coding (572/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630135‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGC < CP009273/3630199‑3630134 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA < 1:18211854/67‑1CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA > 1:17205680/1‑67CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA > 1:11679449/1‑67CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGA > 1:10593569/1‑67 CCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCC > 1:56277945/1‑68 CGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCG < 1:42520577/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:32311831/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:20769146/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC < 1:12180255/68‑1 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:52258293/1‑68 GCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:7128693/1‑68 CCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:45267092/1‑67 CCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:29637615/1‑67 CCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGC > 1:48464781/1‑67 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:57658443/1‑68 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGC > 1:18191141/1‑68 CACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCG < 1:46738912/67‑1 ACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCG < 1:76278/68‑1 ACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCG < 1:40572940/68‑1 ACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGGGAATGGCACCAGACCCGCGCG < 1:55621625/68‑1 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCCGACCCGCGCGGG > 1:41968002/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG < 1:28726358/68‑1 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:10693340/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:21301274/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:2001228/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:31091992/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:19059872/1‑68 GCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGG > 1:38922662/1‑68 CCGCCAGCTCCTGTAACTATTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGTCACCAGCCCCGCGCGGGT < 1:12324220/67‑1 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC > 1:31853203/1‑68 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGT < 1:50243994/67‑1 CCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGT < 1:35789012/67‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:46519952/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:14243446/68‑1 CAGCACCTGTAACTCTCCGAGCAAGGGTTTATGCAGAGTCAAGGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:38738092/68‑1 CAGCACCTGAAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGT < 1:34138759/68‑1 cCACCTGAAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:29525046/67‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGC < 1:2169413/66‑1 ACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGGGAATGGCACCAGCCCCGCGCGGGTCGGGTGCCA < 1:32372632/68‑1 ACCTGAAACCCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCA < 1:38052956/68‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:26311400/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:29502608/67‑1 AACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAAGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:36845414/67‑1 AACTCTACGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC < 1:51010812/67‑1 ACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCAC > 1:1097473/1‑66 TCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTG < 1:3980146/68‑1 CTTCGAGCACCGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:27755798/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:38137706/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:40285887/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:41424194/68‑1 CTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGCCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGC < 1:46650030/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGGCATTCACTCTGCA > 1:19351253/1‑68 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCA < 1:17012637/68‑1 TTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCCCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCA < 1:27626199/68‑1 TTATGCAGAGGGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCT < 1:23547350/67‑1 ATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGAGCGATTCACTCAGCATAAAGCCTAGCTCGA > 1:25904463/1‑68 ATGCACAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGA < 1:19150592/68‑1 TGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAA < 1:3520601/68‑1 TGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAA > 1:3029562/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:36866667/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:7556555/1‑68 GCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAG > 1:13447313/1‑68 AGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA < 1:39046620/67‑1 AGAGTGAAGGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGA < 1:54705865/67‑1 gtcAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAG < 1:16051655/62‑1 GTGAATGGCCCCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:53189720/1‑67 GTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTT > 1:51436720/1‑67 ATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGGCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGG > 1:17737608/1‑68 gGGCCCCAGCCCCCCGCGGGGCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT < 1:2887746/67‑1 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGGTCGAAGAGGTACAGGT > 1:6134666/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGa > 1:54717294/1‑67 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:54341692/1‑68 TGGCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT < 1:45463947/68‑1 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:9606955/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:36660408/1‑66 GCACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGT > 1:42494185/1‑66 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTTCATAAACCGTTGCAAGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:50851717/1‑68 ACCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:14180794/1‑68 CCAGACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTG > 1:54753946/1‑67 ACCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGG > 1:29888001/1‑67 ccgGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCTTTAACCGGTGCTCGAAGTTTTACAGGTGCTGGCGGG < 1:36590471/64‑1 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC < 1:44024244/68‑1 CCCGCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGG < 1:52202805/67‑1 CCCCCGCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGC < 1:50227365/68‑1 CGCGCGGGCCGGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGT < 1:24188780/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:15354314/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC < 1:43198358/68‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:22191558/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:15864807/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:42322932/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:13779584/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGC > 1:42151062/1‑68 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGG < 1:24247917/67‑1 GCGGGTCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGAGGC > 1:48728254/1‑68 GGGTCTGGGGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGG < 1:14938823/68‑1 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:58090919/1‑67 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:12935576/1‑67 TCTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG < 1:21876531/67‑1 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGC < 1:23170795/67‑1 CTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTG > 1:24139557/1‑66 CACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3630135‑3630213‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gacccgcgcgggtcTGGTGCCATTCACTCTGCATAAACCGTTGCTCGAAGAGTTACAGGTGCTGGCGGGCGTGGCGGTGC < CP009273/3630199‑3630134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |