| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4311466 = | 963 (1.380) | 61 (0.100) | 21/94 | NT | 7.8% | coding (48/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
| ? | CP009273 | 4311493 = | 637 (1.080) | coding (21/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit | |||||
Only 100 of 1133 total aligned reads displayed.
GCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTG > CP009273/4311426‑4311559 | cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:21883701/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:43195870/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:31737407/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:33718300/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:57682462/1‑68 (MQ=255) cgcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACACCCAGTGCTGGCggg > 1:41334502/1‑68 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:54703799/1‑67 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCggg > 1:3796444/1‑67 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCgg < 1:34500643/66‑1 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGt < 1:12896457/68‑1 (MQ=255) gcgTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGt < 1:28048254/68‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcg < 1:51228028/68‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTc < 1:4199968/67‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTc < 1:13925430/67‑1 (MQ=255) actatggagcactgaatgcacgcagataccgcgacccgccagcactggatgtccgtgctggcgGGTcg < 1:8859857‑M2/5‑1 (MQ=255) tatggagcactgaatgcacgcagataccgcgacccgccagcactggatggccgtgctggcgGGTcgcg < 1:15529744‑M2/7‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:19060910/68‑1 (MQ=255) tCAGGCGGGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg < 1:19393555/68‑1 (MQ=255) tccGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:32985787/3‑68 (MQ=255) tccGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:29752743/3‑68 (MQ=255) gCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:1974971/1‑67 (MQ=255) cctgctgcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt < 1:54309311/63‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCCGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCCCGGACAGCCAGTGGTGGCGGGTCGCggga > 1:45060372/1‑64 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGCCATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:5720489/1‑66 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt < 1:35711090/65‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:42618096/1‑66 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:26042809/1‑66 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:21435882/1‑66 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:12378901/1‑66 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTAt < 1:24446592/67‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTAt < 1:16640944/67‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCAAGTGCTGGCGGGTCGCGGTa > 1:14570065/1‑66 (MQ=255) gcactgaatgcacgcagataccgcgccccgccagcactggatggccgtgctggcgGGTCGCGGTATCt < 1:22848803‑M2/13‑1 (MQ=255) gTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATc < 1:49300499/67‑1 (MQ=255) gTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATc < 1:30147499/67‑1 (MQ=255) actgaatgcacgcagataccgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGc < 1:25693177‑M1/42‑1 (MQ=255) gcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGt > 1:30865969/1‑67 (MQ=255) gcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTg < 1:40891863/68‑1 (MQ=255) gcCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTg < 1:17209030/68‑1 (MQ=255) ccAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGc > 1:10353363/1‑68 (MQ=255) cAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGc < 1:45914325/67‑1 (MQ=255) atgcacgcagataccgcgaccCGCCCGCACGGGCATCCAGTGCTGGCGGGTGGCGGGTTCTGGGTGCa < 1:48314438‑M1/47‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt < 1:22423926/65‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTc < 1:20605452/67‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa > 1:3968845/1‑68 (MQ=255) gCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt > 1:10002917/1‑67 (MQ=255) gCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt > 1:7642068/1‑67 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:40411441/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:8071662/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:35014726/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:44525396/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGt < 1:37438031/65‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:47060914/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:43547885/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc > 1:58012463/1‑67 (MQ=255) cGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGc < 1:4874534/67‑1 (MQ=255) ttGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTcc < 1:55107612/67‑1 (MQ=255) tGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCAt < 1:27105729/68‑1 (MQ=255) ccgcgacccgccagcactggatggccgtgctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCAt < 1:20902079‑M2/33‑1 (MQ=255) ggCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa > 1:17688045/1‑68 (MQ=255) ggCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa > 1:32042435/1‑68 (MQ=255) ggCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa > 1:10713706/1‑68 (MQ=255) cgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa < 1:49742963‑M1/61‑1 (MQ=255) cgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa < 1:36103804‑M1/61‑1 (MQ=255) cgcgaccCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGGCGCGGTATCTGGGGGCATTCAGTGCTCCATa < 1:2413548‑M1/61‑1 (MQ=255) tgtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTg > 1:53884790/1‑68 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:56668707/68‑1 (MQ=255) gtgCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa < 1:29005642/68‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAt < 1:11815318/68‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAt < 1:55523032/68‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAt > 1:31461685/1‑68 (MQ=255) gcgcCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAAt < 1:28863608/68‑1 (MQ=255) ccagcactggatgtccgtgctggcgGGTCGCGGGATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGcattga > 1:6170347‑M2/26‑66 (MQ=255) CAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCa > 1:3885427‑M1/1‑67 (MQ=255) cactggatgtccgtgctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCa > 1:1829115‑M2/22‑68 (MQ=255) ACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCAt < 1:46584369‑M1/68‑1 (MQ=255) ACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCAt < 1:39917690‑M1/68‑1 (MQ=255) aCATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCg > 1:52811389/1‑68 (MQ=255) aCATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCg > 1:932947/1‑68 (MQ=255) aCATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCg > 1:6873211/1‑68 (MQ=255) aTCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGgc > 1:51985272/1‑68 (MQ=255) aGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGgcgcgc > 1:16184051/1‑68 (MQ=255) tgctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTAGGcgcgcg > 1:53387288‑M2/9‑67 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGcgcgcg < 1:5063457‑M2/59‑1 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGcgcgcg < 1:3045921‑M2/59‑1 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCTCGTc > 1:37046305‑M2/8‑68 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTc > 1:12633578‑M2/8‑68 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTc > 1:38459490‑M2/8‑68 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTc > 1:25177865‑M2/8‑68 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTc > 1:15185341‑M2/8‑68 (MQ=255) gctggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTc > 1:13357597‑M2/8‑68 (MQ=255) tggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAg > 1:47538374‑M2/6‑68 (MQ=255) ggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAgg < 1:438172‑M2/64‑1 (MQ=255) ggcgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAgg < 1:23566653‑M2/64‑1 (MQ=255) cgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAg > 1:11316852‑M2/3‑65 (MQ=255) cgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAg > 1:5611833‑M2/3‑65 (MQ=255) cgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAg > 1:32589826‑M2/3‑65 (MQ=255) cgGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAg > 1:50168047‑M2/3‑65 (MQ=255) gGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCt < 1:39136879‑M2/66‑1 (MQ=255) gGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCt < 1:36380123‑M2/66‑1 (MQ=255) | GCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTG > CP009273/4311426‑4311559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |