New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 1238033 = | 901 (1.290) | 38 (0.080) | 16/76 | NT | 7.1% | coding (504/915 nt) | ldcA | murein tetrapeptide carboxypeptidase; LD‑carboxypeptidase A |
? | CP009273 | 1238051 = | 386 (0.810) | coding (486/915 nt) | ldcA | murein tetrapeptide carboxypeptidase; LD‑carboxypeptidase A |
Only 100 of 1053 total aligned reads displayed.
CGATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAGG > CP009273/1237984‑1238118 | gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCTGCCCGACATGTCGGGCCtt > 1:47677055/1‑68 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCt > 1:5270357/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCt > 1:14473054/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCt > 1:20327065/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCtt < 1:12555194/68‑1 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCtt < 1:56117382/68‑1 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCtt > 1:16537960/1‑68 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:27693191/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:36769436/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:29763159/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:31481069/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:3470834/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:37476290/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:39062653/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:39884834/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:44519376/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:47346600/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:48219241/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:488414/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:49212916/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:52445110/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:54568670/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:56960033/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:7897145/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:843816/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:9175880/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCt > 1:10452845/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCCGGCCt > 1:21320311/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACAAGTCTGGCCtt > 1:51346941/1‑68 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCATCGGCCCCACATGACCGGCCt > 1:43024791/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCAACAACGTGCCTTCGGCCCGCCAAGTCGGGCCt > 1:31001205/1‑67 (MQ=255) gATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGAATGCCTACCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCGAGGTCGGTCCt > 1:6647621/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCtta > 1:6950246/1‑66 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:19545590/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:53810627/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTcc < 1:49906326/68‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:55683606/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:53174305/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:42285043/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:33525577/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTc > 1:15859100/1‑67 (MQ=255) tCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATCTCGGGCCTTc > 1:28685364/1‑67 (MQ=255) ctggcgttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTcc < 1:14781692‑M2/4‑1 (MQ=255) cgttacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatggcgggccTTCCCCtt < 1:18323475‑M2/8‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc < 1:4144295/68‑1 (MQ=255) aaTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGc < 1:13129670/67‑1 (MQ=255) tacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGcc < 1:57589780‑M2/11‑1 (MQ=255) tacgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGcc > 1:55074173‑M1/39‑67 (MQ=255) aTCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCa > 1:18719309/1‑68 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt > 1:3516814/1‑68 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:12048874/68‑1 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:33268863/68‑1 (MQ=255) tCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt < 1:29392846/68‑1 (MQ=255) acgcaatgaaaccttcaccattgaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt > 1:23661963‑M1/38‑68 (MQ=255) acgcaatgaaaccttcaccattgaatcgcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCAt > 1:2268561‑M1/38‑68 (MQ=255) gCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCa > 1:17836850/1‑68 (MQ=255) gCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCCACATGTCGGGCCATCCCCCTGCCAttaa > 1:33852688/1‑66 (MQ=255) ttCGAAATATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACTTGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAAt < 1:35445526/67‑1 (MQ=255) cttcaccattgaatggccaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAg > 1:32518993‑M1/26‑68 (MQ=255) cttcaccattgaatggaaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTGAATGGTGAAg > 1:6189543‑M2/44‑68 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAgg > 1:4685630/1‑68 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTCGCCATTCAATGGTGAAgg > 1:54314678/1‑68 (MQ=255) aTTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCGTGCCATTCAATGGTGAAgg > 1:23159502/1‑68 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATTGTGAAGGt < 1:25472444/68‑1 (MQ=255) ttGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGt < 1:26027754/68‑1 (MQ=255) tGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGtt > 1:30695905/1‑68 (MQ=255) accattgaatggcaaggggaaggcccgccatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGaagggt > 1:34282871‑M2/40‑65 (MQ=255) attgaatggcaaggggaaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCAt > 1:39372248‑M2/37‑68 (MQ=255) gaatggcaaggggaaGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc > 1:13632441‑M1/16‑68 (MQ=255) ccACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc < 1:20786052/68‑1 (MQ=255) ccACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc < 1:24721029/68‑1 (MQ=255) ccACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCATTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGc < 1:4523611/68‑1 (MQ=255) ccGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTACCCATGGCATTCAATGGGGATGGGTTCATTGACTAAc > 1:35987968/2‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGCAGGTTTGATTGCGTTAc > 1:57992218/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:45848314/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:51726157/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:21623249/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:41948743/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTAATTGCGTAAc > 1:55336595/1‑68 (MQ=255) aCGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCGTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:740704/1‑68 (MQ=255) cGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAAc > 1:30307612/1‑67 (MQ=255) gTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACg > 1:17130821/1‑67 (MQ=255) gCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAAt < 1:11161760/42‑1 (MQ=255) ttCGGCCCGCCATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccagcc > 1:44074410/1‑68 (MQ=255) aaggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACgccagcca > 1:46244195‑M2/21‑68 (MQ=255) ggcccgacatgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGa < 1:50776494‑M2/50‑1 (MQ=255) GCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCGATGGTGAAGGTTTCATGGCGTAACGCCAGCCAGaa < 1:56488074‑M1/68‑1 (MQ=255) CCCGCCATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGaaa < 1:28087424‑M1/68‑1 (MQ=255) catgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGt > 1:24223074‑M2/12‑67 (MQ=255) atgtcgggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGc < 1:40582644‑M2/58‑1 (MQ=255) ATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGc > 1:14039109‑M1/1‑68 (MQ=255) cgggccGCCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:10003844‑M2/61‑1 (MQ=255) cgcgccTCCCCCTGGCCATTAAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg < 1:43705839‑M2/61‑1 (MQ=255) CGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg > 1:11621689‑M1/1‑67 (MQ=255) CGGGCCTCCCCCTTGCCATTCAATGGTGACGGTTTCATTGCGAAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCg > 1:50261296‑M1/1‑67 (MQ=255) gggccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGt < 1:45521049‑M2/63‑1 (MQ=255) GGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCgg > 1:38402926‑M1/1‑67 (MQ=255) GCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTaa < 1:26863065‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTaa < 1:15420010‑M1/68‑1 (MQ=255) ccTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTaaa > 1:32132192‑M2/3‑68 (MQ=255) | CGATCAGTGAAATCAGCATCGCAAGATTGCCTCCCCACAACGTGCCTTCGGCCCGACATGTCGGGCCTTCCCCTTGCCATTCAATGGTGAAGGTTTCATTGCGTAACGCCAGCCAGAAATGGTGCTCGGTAAAGG > CP009273/1237984‑1238118 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |