| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1586885 = | NA (NA) | 8 (0.010) | 6/90 | NT | NA | intergenic (‑186/+37) | hipB/yneO | antitoxin of HipAB toxin‑antitoxin system/pseudogene, AidA homolog |
| ? | CP009273 | 1586916 = | NA (NA) | intergenic (‑217/+6) | hipB/yneO | antitoxin of HipAB toxin‑antitoxin system/pseudogene, AidA homolog | |||||
Only 100 of 913 total aligned reads displayed.
ATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTT > CP009273/1586849‑1586983 | aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:17626048/1‑68 (MQ=255)aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:26446739/1‑68 (MQ=255)aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:43357982/1‑68 (MQ=255)aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:49617677/1‑68 (MQ=255)aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTAGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:18567542/1‑68 (MQ=255) tAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat > 1:38037150/1‑67 (MQ=255) gcatgctgggagtgaaatatagctggtaaaccgtaTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat < 1:14086209‑M1/32‑1 (MQ=255) aGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACg < 1:29020960/68‑1 (MQ=255) ggCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACgg > 1:41532893/1‑68 (MQ=255) gCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt > 1:34845417/1‑68 (MQ=255) cGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt < 1:21292638/67‑1 (MQ=255) cGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt < 1:57235812/67‑1 (MQ=255) cGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt < 1:21837165/67‑1 (MQ=255) cGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt < 1:2226774/67‑1 (MQ=255) cGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt < 1:25238032/67‑1 (MQ=255) gTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGttt < 1:35101796/68‑1 (MQ=255) gTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGtt < 1:55554494/67‑1 (MQ=255) agtgaaatatagctggtaaaccgtaTAAGCCGCATGCCATCTCGCCATGCGGCTTATTCGGTTTACCa < 1:40173355‑M1/43‑1 (MQ=255) tGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTGTACGGTTTACCa > 1:18003136/1‑67 (MQ=255) tGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCa > 1:50225498/1‑67 (MQ=255) gcgcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGc < 1:27430694/68‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGc < 1:50692466/68‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGc < 1:14989206/68‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGc < 1:11035763/68‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTGAAGTCGGCAATAATAAGCGGCATGCCATCTCGACATGGGGCTTATTCGGTTTACCTGc < 1:18969282/68‑1 (MQ=255) cgcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCt < 1:6194629/68‑1 (MQ=255) gcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCt < 1:33495003/67‑1 (MQ=255) gcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCt < 1:28742177/67‑1 (MQ=255) gcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCt < 1:39406230/67‑1 (MQ=255) gcCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCt < 1:45316270/67‑1 (MQ=255) gcCGTTTGAAGTCGGCAAAATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTACACGGTTTACCAGCt < 1:56496018/67‑1 (MQ=255) cGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCtat < 1:34375906/67‑1 (MQ=255) gTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTatat < 1:9606701/68‑1 (MQ=255) aaGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTc > 1:53092600/1‑66 (MQ=255) aGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACt < 1:53881038/68‑1 (MQ=255) gTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACt > 1:54265756/1‑67 (MQ=255) gTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACt > 1:55115473/1‑67 (MQ=255) tatTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATg < 1:41764932/68‑1 (MQ=255) gtatacgccgcatgtcgagatggcatgcggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACGCCCAGCATg < 1:19918397‑M2/34‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:46244052/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:46721755/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:38882122/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:47084353/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:42249822/68‑1 (MQ=255) atTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:3577100/68‑1 (MQ=255) ttAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGcc < 1:23075928/68‑1 (MQ=255) ttAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGcc < 1:32920978/68‑1 (MQ=255) TAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGccc > 1:30201078‑M1/1‑68 (MQ=255) TAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:37611328‑M1/66‑1 (MQ=255) TAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCGATATTTCACTCCCAGCATGc < 1:9119389‑M1/66‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCatgcccgga < 1:51491338‑M1/68‑4 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:36740709‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:17172565‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:8268382‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:43001385‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:12857712‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:3128424‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:40923891‑M1/68‑1 (MQ=255) GCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa < 1:13395520‑M1/68‑1 (MQ=255) 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GCCATCTCGACATTCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:33787632‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:45849021‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:27852644‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:44069514‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:4386532‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:36209998‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:16367935‑M1/1‑68 (MQ=255) GCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc > 1:2079917‑M1/1‑68 (MQ=255) cATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt < 1:13871712/67‑1 (MQ=255) cATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt < 1:38399451/67‑1 (MQ=255) cATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt < 1:47871463/67‑1 (MQ=255) cATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt < 1:30802726/67‑1 (MQ=255) ctcGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAg < 1:35489463/68‑1 (MQ=255) tcGACTTGGGGTTTATAGGGTTTACCAGATATATTTCACTCCCAGCTTGCCCTGTGTATCGCTATAGc < 1:32210462/68‑1 (MQ=255) tcGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGc < 1:7339300/68‑1 (MQ=255) gACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCt < 1:39921424/68‑1 (MQ=255) catgcggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCttt < 1:49068827‑M2/57‑1 (MQ=255) catgcggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCttt > 1:40649983‑M2/12‑68 (MQ=255) catgcggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCttt > 1:2553900‑M2/12‑68 (MQ=255) catgcggcttaTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCttt > 1:19482898‑M2/12‑68 (MQ=255) 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aTACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGt < 1:7027327‑M2/67‑1 (MQ=255) | ATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTT > CP009273/1586849‑1586983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |