| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3832491 = | 541 (0.870) | 26 (0.050) | 7/96 | NT | 6.7% | coding (884/924 nt) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter |
| ? | CP009273 | 3832524 = | 257 (0.480) | coding (917/924 nt) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3832564‑3832491‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcggcATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > CP009273/3832524‑3832589 TTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:8829862/1‑67 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTGACTAATGCCGCGCCGGACGATTTATATTTCTGGC < 1:48611050/68‑1 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:11477053/68‑1 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:23684754/68‑1 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:15476544/68‑1 TAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:35897680/1‑67 AACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGC > 1:5085084/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:30938400/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:34047084/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:3461848/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:25855944/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:22276841/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:21230497/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:42199864/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:18628717/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:11252534/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTAACTTATGCCGCGCCTGACGATTTATTTATCTGGCGCG > 1:662205/1‑68 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:39357387/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:50654308/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:12647156/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:40379718/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:42745525/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:32364160/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:22264868/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:33793002/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGCCGCG > 1:8580943/1‑67 CGGTGGCGCGGGGCCTGGCGGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:16096369/68‑1 CGGGGGCGCGGTGCCGGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:50085242/68‑1 ggcGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:35025923/65‑1 ggaGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:34421475/65‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:27996261/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:28302995/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:31475572/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:31344017/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:18252439/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:12550216/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:40136458/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:41271570/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:7639305/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:4142959/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:558463/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:44232547/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:1935534/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:4629143/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:16553829/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTACTGGCGCGGC < 1:9461790/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCGGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:12051602/68‑1 GTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCCCTTATGCCGCGCCGGACGAGTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:18423922/1‑67 GTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGtcg > 1:47579333/1‑65 GGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATA < 1:7174968/68‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:25474612/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:7411998/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:21119721/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:45172254/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:44874561/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:42292870/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:43291555/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:19910971/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:42715256/67‑1 GCGGGGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:25270556/67‑1 gggGCCGGGCCGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGA < 1:18012760/65‑1 GGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGA < 1:44842510/68‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:29159973/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:10194843/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:2851663/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:27480117/67‑1 TGCCTGGCGGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:10281493/67‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:2850972/68‑1 CTGTTAATTCTCACTTCTGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACC < 1:27204867/67‑1 gtTAATTCTCTCTTATGCCGCGCCGGACCAATTATTTTTCTTCCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:9113913/66‑1 ggaAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACTATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:26129704/65‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:1540659/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGGGAGAATTACCAGC < 1:33862902/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGAATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:39010221/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTAATTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:37317994/68‑1 ggTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCT > 1:13516333/3‑68 GGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTA < 1:19417376/68‑1 CGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAG < 1:23281048/67‑1 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:42377374/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:26699381/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:37289941/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:50434212/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:5710453/1‑68 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:26888448/68‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:49156773/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:27278671/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:43174652/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:31515001/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:6151043/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:2619901/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > 1:1405913/1‑67 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:23793172/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > 1:43101533/1‑67 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:44032408/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:16103950/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:50267333/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:26777436/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:45831890/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:18389509/66‑1 CATAAGTCAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:13628081/67‑1 TTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3832564‑3832491‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcggcATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > CP009273/3832524‑3832589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |