| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4306574 = | 214 (0.350) | 11 (0.020) | 9/98 | NT | 5.0% | coding (462/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase |
| ? | CP009273 | 4306632 = | 230 (0.420) | coding (404/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase | |||||
GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306646‑4306574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT > CP009273/4306632‑4306696 GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTGTGAAAAACTGGTGC > 1:45570344/1‑68GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCAGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTG < 1:1186659/67‑1GCACCGTCTGCATCTCCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTG < 1:50904647/67‑1 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:1342740/68‑1 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:26352079/68‑1 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:15917333/68‑1 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:51008157/68‑1 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCA > 1:32103264/1‑67 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGC < 1:34123717/66‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:10094253/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:45591259/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:45731224/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:46224569/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:49282079/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:31160166/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:21346276/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:51249941/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:11337706/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:11937974/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:6533941/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:6214629/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACCGCCGCATCACACCACGCTGCCGCGGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:28037110/68‑1 CCGTCTGCAGCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:32189522/68‑1 GTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC > 1:13599998/1‑68 GTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC > 1:49328123/1‑68 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:47492206/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:38440722/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:5950880/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:45927757/68‑1 TCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCA > 1:9221308/1‑68 TCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCA > 1:30451938/1‑68 TGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGA < 1:49505806/68‑1 ATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTG > 1:40951091/1‑68 CACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGC > 1:45503477/1‑68 ACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCG > 1:13767896/1‑68 GCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:41782397/1‑68 GCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:48933074/1‑68 CTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:3031723/1‑67 GCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCG > 1:46229987/1‑68 ACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATG > 1:32044424/1‑67 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGCTGGCGTTGA > 1:33245025/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:41757459/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:7475892/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:15528046/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:50937696/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:33244987/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:17598355/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:23292389/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:28635005/1‑68 CAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:27884678/1‑67 tGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATC > 1:40902374/2‑68 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATC > 1:47698348/1‑68 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATC > 1:24118005/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:10202982/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:45557433/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:19567420/1‑68 GCAGATGCAGTCGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:12157528/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:44872210/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:41059430/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:36978051/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:20632600/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:10850897/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:7760981/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:11055711/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:12770368/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:13787039/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:5791779/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:5215255/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:16165264/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:18661985/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:50357976/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:25157365/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:31417678/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:31431774/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA < 1:36604056/66‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:39877/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:40203283/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:40253676/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA < 1:42714843/66‑1 GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306646‑4306574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT > CP009273/4306632‑4306696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |