| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4328027 = | 362 (0.580) | 21 (0.040) | 9/96 | NT | 5.0% | intergenic (‑281/+44) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase |
| ? | CP009273 | 4328055 = | 487 (0.920) | intergenic (‑309/+16) | adiY/adiA | adi system transcriptional activator/arginine decarboxylase | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
ATTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4328100‑4328027‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attacgccTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACATAACGTGGTAAATACCGTCAATAATTTCAGTCC > CP009273/4328055‑4328120 ATTTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACA < 1:2841364/67‑1 TTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTA < 1:46353501/68‑1 TTACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACAATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATT > 1:12875845/1‑67 ACCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTAC > 1:48951903/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGC < 1:38030536/68‑1 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:42765396/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:23726676/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:26160649/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:26848731/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:28137448/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:29228683/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:31472296/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:33766167/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:34576622/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:39367656/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:40741640/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:10629278/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:43298268/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:43723269/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:47059192/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:50362434/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:50544286/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:6230505/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:8013954/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:9830955/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:16218519/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:17038637/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:11293784/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:18179673/1‑67 CCACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACG > 1:13853710/1‑67 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:17942992/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:46658452/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:14889645/68‑1 CACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC < 1:48085055/68‑1 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:32163364/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:45423630/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:32517093/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:32352931/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:3099689/1‑67 ACGTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCC > 1:19719421/1‑67 GTTATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCT > 1:43056259/1‑66 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:23813564/67‑1 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:24955994/67‑1 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:22436248/67‑1 TATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGCAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCA < 1:47394809/67‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:35494050/68‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:24418576/68‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:36893355/68‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:8171001/68‑1 ATGTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATCGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGC < 1:47389614/68‑1 GTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGG < 1:49268987/68‑1 GTGCGTGAAAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGG < 1:49570045/68‑1 GAACGCGTAACCACTATTCCGCGCAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGT < 1:26372014/68‑1 GAAAGCGAAACCACTATTCCGCTCAAGGCGTAATTGATTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGT < 1:21882111/68‑1 AAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGG < 1:22473554/68‑1 AAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTG < 1:37881012/67‑1 AAGCGTAACCACTATTCCGCTGAAGGCGAAATTGTTTAAATAACATTACCCCTTCAGCGGAATAGTG < 1:27101379/67‑1 CACTATTCCGCTCAAGGCGTAATTTTTTAAATAACATAACGCCTTCCGCGGAATAGTGGTTACGCTTT < 1:14959884/68‑1 TCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:39403875/68‑1 TCCGCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCA < 1:20344668/68‑1 gcgGAAGGCGTAATTGTTTAAAAAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACAT < 1:24539799/65‑1 GCTGAAGGCGTAATTGTTTAAATAACATTACGCCTTCAGCGGAATAGTGGTTACGCTTTCACGCACAT < 1:12351569/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |