| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 726722 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/88 | NT | NA | coding (1684/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | 726734 = | NA (NA) | coding (1696/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
CGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/726799‑726722‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcggtgcaccgcGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACACG > CP009273/726734‑726799 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCG > 1:3040541/1‑68 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCG > 1:31013262/1‑68 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCG > 1:27783833/1‑68 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCG > 1:41067638/1‑68 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCG > 1:51008185/1‑68 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCG > 1:15969061/1‑68 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCG > 1:15584534/1‑68 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCG > 1:40046219/1‑68 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGC < 1:45948859/67‑1 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGC < 1:21459221/67‑1 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGC < 1:6832691/67‑1 GTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGC < 1:2638540/67‑1 GTGGCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGC < 1:34151725/67‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:38051957/68‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:36999259/68‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:40576081/68‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:28631571/68‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:43192708/68‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:9365089/68‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:18451972/68‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:8849438/68‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:5676269/68‑1 GTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGCCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:48020783/68‑1 GTCTTGCACGGAAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGGACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:23584463/68‑1 TCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:35669825/67‑1 CTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGC > 1:43753425/1‑68 CTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGC < 1:17867398/68‑1 CTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGC > 1:12763924/1‑68 TTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGC > 1:11393497/1‑67 TTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGC < 1:19815606/67‑1 TTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCAC < 1:1189799/68‑1 TTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCAC < 1:38671949/68‑1 TCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACC < 1:24876745/68‑1 TCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACC < 1:34719053/68‑1 TCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACC < 1:19050509/68‑1 ACGTCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCTGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:843323/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:36339508/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:7527843/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:34952217/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:39534471/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:48905576/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:42463388/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:32653505/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:9165221/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:31583562/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:10839173/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:29244617/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:10000963/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:28353521/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:1221278/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:21127607/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:27143628/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:13325449/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:21274323/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:24092169/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:25874912/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:25508527/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:14735848/68‑1 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCG > 1:29937608/1‑67 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCG > 1:46500982/1‑67 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCG > 1:49758076/1‑67 ACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGGCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:35282712/68‑1 ATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGT < 1:15425369/55‑1 TGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCG > 1:50666017/1‑45 CGTAGGCGCGGTACTGACGCAGCCCTACCTCGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGC < 1:22783331/67‑1 CTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGGTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGt > 1:42111962/1‑67 cCGGTGCACCGAGAGGAAGGGCTGACTCACTCCCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAAATGACGT > 1:41617812/2‑68 GCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGT > 1:16390072/1‑68 GCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGT > 1:48996620/1‑68 GCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGT > 1:21584475/1‑68 GCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGT > 1:40254089/1‑68 CGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGT < 1:33765804/67‑1 GGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGA > 1:26776525/1‑68 GGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGA < 1:32397151/68‑1 GGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGA > 1:44964289/1‑68 GGTGCACCGCGAGGAAGGGATTAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGA < 1:2254802/68‑1 GCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAG < 1:50030837/68‑1 GCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAG < 1:16755654/68‑1 GCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAG > 1:29571013/1‑68 GCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAG > 1:3309940/1‑68 GCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAA < 1:2470815/67‑1 GCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGACGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAG < 1:25285527/68‑1 CACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAG > 1:44840798/1‑67 CACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAG > 1:37608446/1‑67 ACCGCGAGGACGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGA < 1:48367558/67‑1 ACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGAC > 1:20311755/1‑68 ACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGAC > 1:47412531/1‑68 ACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGAC > 1:11502288/1‑68 ACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGAC > 1:45449676/1‑68 ACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGAC > 1:13812346/1‑68 ACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGA < 1:46786297/67‑1 CGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACAC > 1:31833910/1‑68 CGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACAC < 1:27022368/68‑1 CGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACAC < 1:22176893/68‑1 CGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACAC < 1:20668269/68‑1 CGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACAC < 1:19268092/68‑1 CGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACAC < 1:46983077/68‑1 GCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACAC > 1:6552830/1‑67 GCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACAC > 1:44189431/1‑67 GCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGA > 1:7686068/1‑44 CGTGTCTTTCACGGCAATTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGCGGTACTGACTCAGCCCTTCCTCGCGGTGCACCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/726799‑726722‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcggtgcaccgcGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTTAATTGCCGTGAAAGACACG > CP009273/726734‑726799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |