| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 726722 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/88 | NT | NA | coding (1684/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | 726734 = | NA (NA) | coding (1696/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 984 total aligned reads displayed.
TGAGCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTT > CP009273/726657‑726780 | tGAGCTTGACTGAGTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTTTGACCTTGACCGTTTTGGTCAGGTGAcggg < 1:35193759/67‑2 (MQ=18)tGAGCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGAcggcg > 1:3080867/1‑68 (MQ=255)tGAGCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGAcggc < 1:24415633/67‑1 (MQ=255)tGAGCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGAcggc < 1:23926624/67‑1 (MQ=255)tGAGCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGAcggc < 1:32644828/67‑1 (MQ=255)tGAGCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGAcggc < 1:12353553/67‑1 (MQ=255) aGCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGt > 1:24945387/1‑68 (MQ=255) aGCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGCCGGt > 1:14491176/1‑68 (MQ=255) gCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGt > 1:33958089/1‑67 (MQ=255) gCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGt > 1:16435794/1‑67 (MQ=255) cACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCAcc < 1:15376658/68‑1 (MQ=255) actgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCAcc > 1:20419394/1‑67 (MQ=255) ctgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACcgc < 1:34459851/68‑1 (MQ=255) tgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACcgcg > 1:15656931/1‑68 (MQ=255) tgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACcgcg > 1:43617801/1‑68 (MQ=255) tgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACcgcg < 1:33225596/68‑1 (MQ=255) gactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGa > 1:19031329/1‑68 (MQ=255) actgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg < 1:22614432/68‑1 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:28891916/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:10025613/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:4931016/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:21509194/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:31742750/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:44551419/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:45687980/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:17758367/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:45394126/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:39846940/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:15874691/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:14903268/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:42146383/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg < 1:26183399/67‑1 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg < 1:42653516/67‑1 (MQ=255) tgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGa > 1:10663061/1‑68 (MQ=255) tCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg < 1:43902277/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:50740865/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:46457802/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTGGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAggg > 1:47981866/1‑67 (MQ=255) ggTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:41719853/1‑65 (MQ=255) ggTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:28185094/1‑65 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:26834340/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:42912740/1‑68 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:35716403/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:25427298/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:36214689/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:37352884/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:37746219/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:14094182/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:13763890/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:45898473/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:11202194/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:49981142/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:50280286/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:6647069/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:8224423/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:9428750/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:27700446/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:18560902/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:27221926/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:31218625/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:2102097/68‑1 (MQ=255) tAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAg > 1:23521657/1‑68 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGTGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:5236750/1‑68 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:22165672/1‑68 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt < 1:7216871/68‑1 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:41124735/1‑68 (MQ=255) aaCCAGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:7724995/1‑68 (MQ=255) aCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:2942943/1‑67 (MQ=255) cccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTa > 1:16884868/1‑67 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:1811660/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:22970419/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:32055823/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:20049572/1‑68 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:26563331/68‑1 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc > 1:29864724/1‑68 (MQ=255) tgaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCAt > 1:28580389/1‑68 (MQ=255) gaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATa < 1:46926791/68‑1 (MQ=255) gaccatgaccGTTTTGGGCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATa < 1:19526848/68‑1 (MQ=255) gaccatgaccGGTTGGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATa < 1:1354415/68‑1 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:21833271/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:4046728/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:33721955/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:13081128/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:449605/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg < 1:25665176/68‑1 (MQ=255) ccatgaccGGTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg < 1:40683646/68‑1 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:17318881/1‑67 (MQ=255) tgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACGGCGAGGATTTGCTGAGGCAGTACCGCGCATACGACa < 1:38290223/68‑1 (MQ=17) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:48727853/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:11846894/1‑67 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:38522983/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:36639620/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTCGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:11554569/67‑1 (MQ=255) cGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCg > 1:5638998/1‑68 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg < 1:51026484/68‑1 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg > 1:30355109/1‑68 (MQ=255) tttGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTgg > 1:8711365/1‑68 (MQ=255) tCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt > 1:6303908/1‑68 (MQ=37) tCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGAACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt > 1:4767466/1‑68 (MQ=255) cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:39358135/67‑1 (MQ=35) | TGAGCTTCACTGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTT > CP009273/726657‑726780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |