| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 726722 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/88 | NT | NA | coding (1684/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | 726734 = | NA (NA) | coding (1696/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 855 total aligned reads displayed.
TGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTT > CP009273/726667‑726780 | tgactgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACcgcg > 1:33317687/1‑68 (MQ=255) actgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg > 1:28857952/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTACCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:28414949/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:10025613/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:44544426/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:1229768/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:31742750/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:29659468/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAgg > 1:16728354/1‑68 (MQ=255) ctgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAg < 1:34952971/67‑1 (MQ=255) tgTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGa > 1:10663061/1‑68 (MQ=255) tCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:37987448/1‑68 (MQ=255) tCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAgg > 1:21308915/1‑68 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:32848512/68‑1 (MQ=255) ccGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAggg < 1:40997534/68‑1 (MQ=255) ttATGTACCCCGCTATCACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:32170558/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGaa > 1:22729663/1‑61 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:15916659/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:39590806/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:51256005/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:46637656/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGa > 1:2072198/1‑68 (MQ=255) ttATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTACGGTCAGGTGACGGCGGTGAACCGCTAGGAAGGGCTGa > 1:17437350/1‑68 (MQ=14) tttGTAACCCGCTATGACCAAGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:27655759/66‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCCTGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:40221923/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:43503429/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:45297026/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:42849727/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:50940865/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:6372877/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:6761486/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:8224423/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:1492787/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:8713414/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:9428750/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:30939838/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:1379593/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:14094182/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:34065112/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:27221926/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:18290021/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg > 1:24946708/1‑68 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:22479059/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:25619447/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:14524111/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:22019450/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:20163722/68‑1 (MQ=255) tATGTAACCCGCAATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAg < 1:4775205/68‑1 (MQ=255) tAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAg > 1:13590957/1‑68 (MQ=255) tAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAg > 1:44940691/1‑68 (MQ=255) aaCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:36458220/1‑68 (MQ=255) aaCCAGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:7724995/1‑68 (MQ=255) aCCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGt > 1:28008867/1‑67 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:18824366/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:36983968/1‑68 (MQ=255) ccGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:11572350/1‑68 (MQ=255) cGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTAcc > 1:11276759/1‑67 (MQ=255) gCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACcgc > 1:4388624/1‑68 (MQ=255) gCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACcgc < 1:17120634/68‑1 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:26563331/68‑1 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:42623401/68‑1 (MQ=255) tATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCgcgc < 1:30036325/68‑1 (MQ=255) tgaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCAt > 1:35480507/1‑68 (MQ=255) tgaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCAt > 1:40624224/1‑68 (MQ=255) gaccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATa < 1:50069463/68‑1 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:39068289/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:45534540/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:15439918/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:26113228/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:35961512/1‑68 (MQ=255) accatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGCGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:38404925/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATAc > 1:23625643/1‑67 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:46220480/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg < 1:5800305/68‑1 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:26793755/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:13081128/1‑68 (MQ=255) ccatgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGACGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:29268591/1‑68 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:49680978/1‑67 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:48845352/1‑67 (MQ=255) catgaccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACg > 1:47281965/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:19150249/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:4581992/1‑67 (MQ=255) accGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAg > 1:11846894/1‑67 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:37630740/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:17823648/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:25403303/67‑1 (MQ=255) ccGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGc < 1:5498820/67‑1 (MQ=255) cGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCg > 1:41479288/1‑68 (MQ=255) cGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCg > 1:33760628/1‑68 (MQ=255) 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cAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGt < 1:4208456/67‑1 (MQ=35) | TGACTGTTCCGGTTATGTAACCCGCTATGACCATGACCGTTTTGGTCAGGTGACGGCGGTGCACCGCGAGGAAGGGCTGAGTCAGTACCGCGCATACGACAGCCGTGGACAGTT > CP009273/726667‑726780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |